Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G228300.2,Sobic.004G228300.1
Synonym Sb04g027270
Functional annotation C2 domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RP63 , C5XYA3
Pfam PF00168
Panther DB PTHR10774 PTHR10774:SF58
NCBI CDD KOG1030; Predicted Ca2+-dependent phospholipid-binding protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G63220 : Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g42710.1 : C2 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032118
Brachypodium KQK00501
Barley -
Wheat TraesCS6B02G264600 , TraesCS6A02G236000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G143900 transporter family protein, putative, expressed K08150: SLC2A13, MFS transporter, SP family, solute carrier family 2 (myo-inositol transporter), member 13
2 Sobic.005G214700 - -
3 Sobic.002G104801 - -
4 Sobic.010G190500 - -
5 Sobic.002G157900 - -
6 Sobic.003G145300 expressed protein -
7 Sobic.009G090400 - -
8 Sobic.001G332200 cysteine proteinase EP-B 1 precursor, putative, expressed -
9 Sobic.007G222200 - -
10 Sobic.005G122100 expressed protein -
11 Sobic.006G136700 GPI-anchored protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G098400 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
13 Sobic.004G187400 SKP1-like protein 1B, putative, expressed K03094: SKP1, S-phase kinase-associated protein 1
14 Sobic.001G024300 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G417401 - -
16 Sobic.007G103000 FGGY family of carbohydrate kinases, putative, expressed K00864: glpK, glycerol kinase
17 Sobic.010G271600 exo70 exocyst complex subunit family protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G056500 - -
19 Sobic.009G116100 conserved hypothetical protein -
20 Sobic.004G131400 DEF7 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G228300 Sobic004G228300 Sobic006G143900 Sobic006G143900 Sobic004G228300--Sobic006G143900 Sobic005G214700 Sobic005G214700 Sobic004G228300--Sobic005G214700 Sobic002G104801 Sobic002G104801 Sobic004G228300--Sobic002G104801 Sobic010G190500 Sobic010G190500 Sobic004G228300--Sobic010G190500 Sobic002G157900 Sobic002G157900 Sobic004G228300--Sobic002G157900 Sobic003G145300 Sobic003G145300 Sobic004G228300--Sobic003G145300 Sobic009G090400 Sobic009G090400 Sobic004G228300--Sobic009G090400 Sobic001G332200 Sobic001G332200 Sobic004G228300--Sobic001G332200 Sobic007G222200 Sobic007G222200 Sobic004G228300--Sobic007G222200 Sobic004G273600 Sobic004G273600 Sobic006G143900--Sobic004G273600 Sobic005G145400 Sobic005G145400 Sobic006G143900--Sobic005G145400 Sobic007G176900 Sobic007G176900 Sobic006G143900--Sobic007G176900 Sobic001G135950 Sobic001G135950 Sobic006G143900--Sobic001G135950 Sobic004G295050 Sobic004G295050 Sobic006G143900--Sobic004G295050 Sobic010G001200 Sobic010G001200 Sobic006G143900--Sobic010G001200 Sobic005G037700 Sobic005G037700 Sobic006G143900--Sobic005G037700 Sobic003G420500 Sobic003G420500 Sobic006G143900--Sobic003G420500 Sobic003G333100 Sobic003G333100 Sobic006G143900--Sobic003G333100 Sobic005G214700--Sobic009G090400 Sobic005G214700--Sobic002G157900 Sobic008G102850 Sobic008G102850 Sobic005G214700--Sobic008G102850 Sobic005G214700--Sobic010G190500 Sobic005G122100 Sobic005G122100 Sobic005G214700--Sobic005G122100 Sobic005G214700--Sobic007G222200 Sobic009G098400 Sobic009G098400 Sobic005G214700--Sobic009G098400 Sobic003G009600 Sobic003G009600 Sobic005G214700--Sobic003G009600 Sobic001G024300 Sobic001G024300 Sobic005G214700--Sobic001G024300 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic002G104801--Sobic004G251900 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic002G104801--Sobic009G098900 Sobic004G070600 Sobic004G070600 Sobic002G104801--Sobic004G070600 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic002G104801--Sobic010G161400 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic002G104801--Sobic002G002600 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic002G104801--Sobic003G173800 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic002G104801--Sobic009G089532 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic002G104801--Sobic005G010000 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic002G104801--Sobic001G539700 Sobic010G190500--Sobic005G214700 Sobic010G190500--Sobic007G222200 Sobic010G190500--Sobic005G122100 Sobic010G190500--Sobic009G090400 Sobic010G190500--Sobic003G009600 Sobic007G103000 Sobic007G103000 Sobic010G190500--Sobic007G103000 Sobic010G271600 Sobic010G271600 Sobic010G190500--Sobic010G271600 Sobic002G417401 Sobic002G417401 Sobic010G190500--Sobic002G417401 Sobic010G190500--Sobic008G102850 Sobic002G157900--Sobic009G090400 Sobic006G136700 Sobic006G136700 Sobic002G157900--Sobic006G136700 Sobic002G157900--Sobic001G024300 Sobic002G157900--Sobic001G332200 Sobic002G157900--Sobic007G222200 Sobic002G157900--Sobic002G417401 Sobic009G116100 Sobic009G116100 Sobic002G157900--Sobic009G116100 Sobic002G157900--Sobic005G122100 Sobic002G157900--Sobic003G009600 Sobic004G147700 Sobic004G147700 Sobic003G145300--Sobic004G147700 Sobic010G230200 Sobic010G230200 Sobic003G145300--Sobic010G230200 Sobic002G282600 Sobic002G282600 Sobic003G145300--Sobic002G282600 Sobic005G031700 Sobic005G031700 Sobic003G145300--Sobic005G031700 Sobic002G091300 Sobic002G091300 Sobic003G145300--Sobic002G091300 Sobic009G087200 Sobic009G087200 Sobic003G145300--Sobic009G087200 Sobic001G511100 Sobic001G511100 Sobic003G145300--Sobic001G511100 Sobic003G027300 Sobic003G027300 Sobic003G145300--Sobic003G027300 Sobic003G145300--Sobic009G116100 Sobic009G090400--Sobic002G157900 Sobic009G090400--Sobic007G222200 Sobic009G090400--Sobic005G122100 Sobic009G090400--Sobic001G024300 Sobic009G090400--Sobic002G417401 Sobic009G090400--Sobic003G009600 Sobic009G090400--Sobic006G136700 Sobic009G090400--Sobic001G332200 Sobic009G090400--Sobic009G116100 Sobic001G332200--Sobic006G136700 Sobic001G332200--Sobic002G157900 Sobic001G332200--Sobic001G024300 Sobic004G131400 Sobic004G131400 Sobic001G332200--Sobic004G131400 Sobic010G056500 Sobic010G056500 Sobic001G332200--Sobic010G056500 Sobic001G332200--Sobic002G417401 Sobic001G332200--Sobic009G116100 Sobic004G025600 Sobic004G025600 Sobic001G332200--Sobic004G025600 Sobic001G332200--Sobic009G090400 Sobic007G222200--Sobic009G090400 Sobic007G222200--Sobic002G417401 Sobic007G222200--Sobic001G024300 Sobic007G222200--Sobic002G157900 Sobic007G222200--Sobic005G122100 Sobic007G222200--Sobic003G009600 Sobic007G222200--Sobic006G136700 Sobic007G222200--Sobic009G116100 Sobic007G222200--Sobic001G332200
Octagon: transcription factors


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