Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G104801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W373
Pfam PF06522
Panther DB PTHR33417 PTHR33417:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G48140 : B12D protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g17310.1 : B12D protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013642
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G089310.1 , HORVU5Hr1G107180.1 , HORVU5Hr1G107180.2 , HORVU5Hr1G107180.3 , HORVU5Hr1G107180.4
Wheat TraesCS1B02G433700 , TraesCS1D02G412000 , TraesCS2D02G106400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G251900 tetraspanin family protein, putative, expressed -
2 Sobic.009G098900 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
3 Sobic.004G070600 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.010G161400 polygalacturonase, putative, expressed K01213: galacturan 1,4-alpha-galacturonidase
5 Sobic.002G002600 la domain containing protein, expressed -
6 Sobic.003G173800 polygalacturonase, putative, expressed -
7 Sobic.009G089532 - -
8 Sobic.005G010000 expressed protein -
9 Sobic.001G539700 expansin precursor, putative, expressed -
10 Sobic.004G137200 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
11 Sobic.008G028100 pollen allergen, putative, expressed -
12 Sobic.004G025500 - -
13 Sobic.008G186900 SCP-like extracellular protein, expressed -
14 Sobic.002G106800 expressed protein -
15 Sobic.007G100800 CSLD3 - cellulose synthase-like family D, expressed -
16 Sobic.008G028300 pollen allergen, putative, expressed -
17 Sobic.003G061700 - -
18 Sobic.009G260900 expressed protein -
19 Sobic.009G016700 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed K00134: GAPDH, glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase
20 Sobic.003G335700 ATCHX15, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G104801 Sobic002G104801 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic002G104801--Sobic004G251900 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic002G104801--Sobic009G098900 Sobic004G070600 Sobic004G070600 Sobic002G104801--Sobic004G070600 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic002G104801--Sobic010G161400 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic002G104801--Sobic002G002600 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic002G104801--Sobic003G173800 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic002G104801--Sobic009G089532 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic002G104801--Sobic005G010000 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic002G104801--Sobic001G539700 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic004G251900--Sobic004G025500 Sobic004G251900--Sobic009G098900 Sobic004G251900--Sobic009G089532 Sobic004G251900--Sobic001G539700 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic004G251900--Sobic004G137200 Sobic004G251900--Sobic002G002600 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic004G251900--Sobic008G028100 Sobic002G283000 Sobic002G283000 Sobic004G251900--Sobic002G283000 Sobic004G251900--Sobic003G173800 Sobic009G098900--Sobic003G173800 Sobic009G098900--Sobic004G025500 Sobic009G098900--Sobic010G161400 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic009G098900--Sobic002G106800 Sobic009G098900--Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic004G137200 Sobic009G098900--Sobic005G010000 Sobic009G098900--Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic002G002600 Sobic001G002200 Sobic001G002200 Sobic004G070600--Sobic001G002200 Sobic009G096700 Sobic009G096700 Sobic004G070600--Sobic009G096700 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic004G070600--Sobic010G093600 Sobic008G027800 Sobic008G027800 Sobic004G070600--Sobic008G027800 Sobic004G070600--Sobic002G002600 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic004G070600--Sobic004G166100 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic004G070600--Sobic008G028300 Sobic001G228000 Sobic001G228000 Sobic004G070600--Sobic001G228000 Sobic004G070600--Sobic001G539700 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic009G098900 Sobic010G161400--Sobic003G173800 Sobic010G161400--Sobic002G002600 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic010G161400--Sobic007G100800 Sobic010G161400--Sobic005G010000 Sobic010G161400--Sobic008G028300 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic010G161400--Sobic003G061700 Sobic010G161400--Sobic002G106800 Sobic002G002600--Sobic008G028300 Sobic002G002600--Sobic001G539700 Sobic002G002600--Sobic008G028100 Sobic002G002600--Sobic009G089532 Sobic002G002600--Sobic010G161400 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic002G002600--Sobic009G016700 Sobic002G002600--Sobic010G093600 Sobic002G002600--Sobic009G096700 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic002G002600--Sobic003G127200 Sobic003G173800--Sobic005G010000 Sobic003G173800--Sobic002G106800 Sobic003G173800--Sobic009G098900 Sobic003G173800--Sobic010G161400 Sobic003G173800--Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic004G137200 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic003G173800--Sobic002G091200 Sobic003G173800--Sobic007G100800 Sobic003G173800--Sobic003G061700 Sobic009G089532--Sobic001G539700 Sobic009G089532--Sobic008G028100 Sobic009G089532--Sobic002G002600 Sobic009G089532--Sobic009G096700 Sobic009G089532--Sobic009G098900 Sobic009G089532--Sobic010G093600 Sobic009G089532--Sobic004G137200 Sobic009G089532--Sobic009G016700 Sobic009G089532--Sobic008G028300 Sobic005G010000--Sobic003G173800 Sobic005G010000--Sobic002G106800 Sobic005G010000--Sobic007G100800 Sobic005G010000--Sobic003G061700 Sobic005G010000--Sobic008G186900 Sobic005G010000--Sobic010G161400 Sobic005G010000--Sobic009G098900 Sobic005G010000--Sobic004G137200 Sobic005G010000--Sobic002G091200 Sobic001G539700--Sobic008G028100 Sobic001G539700--Sobic009G089532 Sobic001G539700--Sobic002G002600 Sobic001G539700--Sobic009G016700 Sobic001G539700--Sobic010G093600 Sobic001G539700--Sobic009G096700 Sobic001G539700--Sobic008G028300 Sobic001G539700--Sobic009G098900 Sobic007G222400 Sobic007G222400 Sobic001G539700--Sobic007G222400
Octagon: transcription factors


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