Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G023600.1,Sobic.008G023600.2
Synonym Sb08g002065
Functional annotation OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed
UniProt A0A1B6PAY4
Pfam PF13365
Panther DB PTHR18868 PTHR18868:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G27660 : Trypsin family protein with PDZ domain
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g04750.1 : OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK04034 , KQK04035
Barley -
Wheat TraesCS6B02G240200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G188400 - -
2 Sobic.005G003400 - -
3 Sobic.008G066300 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G162800 expressed protein -
5 Sobic.010G036901 - -
6 Sobic.008G064300 - -
7 Sobic.010G009600 OsFBX182 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.004G313400 transcription elongation factor SPT5 homolog 1, putative, expressed K15172: SUPT5H, transcription elongation factor SPT5
9 Sobic.002G239400 OsFBX338 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.005G110547 - -
11 Sobic.005G070301 - K03007: RPB10, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
12 Sobic.002G274700 glycosyl transferase family 8, putative, expressed K13648: alpha-1,4-galacturonosyltransferase
13 Sobic.001G075201 - -
14 Sobic.010G257500 expressed protein -
15 Sobic.001G539400 plasma membrane ATPase, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
16 Sobic.003G027000 OsMADS3 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
17 Sobic.008G041300 - K14777: DDX47, ATP-dependent RNA helicase DDX47/RRP3
18 Sobic.002G128101 - -
19 Sobic.009G119100 hexokinase, putative, expressed K00844: hexokinase
20 Sobic.001G504700 BSD domain-containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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