Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G128101.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W3K8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G21222 : protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g03970.1 : CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.5 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G236500 OsPOP19 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed -
2 Sobic.003G439900 40S ribosomal protein S15, putative, expressed -
3 Sobic.005G184050 - -
4 Sobic.005G003400 - -
5 Sobic.005G163866 - -
6 Sobic.005G159801 - -
7 Sobic.005G102350 - -
8 Sobic.008G121240 - -
9 Sobic.003G351401 - -
10 Sobic.005G008600 double-stranded RNA binding motif containing protein, expressed -
11 Sobic.003G388000 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K03350: APC3, anaphase-promoting complex subunit 3
12 Sobic.002G237800 NOL1/NOP2/sun family protein, putative, expressed K03500: rsmB, 16S rRNA (cytosine967-C5)-methyltransferase
13 Sobic.005G145800 - -
14 Sobic.005G178300 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
15 Sobic.010G060166 - -
16 Sobic.002G188350 - -
17 Sobic.008G023600 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
18 Sobic.002G035300 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
19 Sobic.001G475000 expressed protein -
20 Sobic.005G012900 DNA binding protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G128101 Sobic002G128101 Sobic002G236500 Sobic002G236500 Sobic002G128101--Sobic002G236500 Sobic003G439900 Sobic003G439900 Sobic002G128101--Sobic003G439900 Sobic005G184050 Sobic005G184050 Sobic002G128101--Sobic005G184050 Sobic005G003400 Sobic005G003400 Sobic002G128101--Sobic005G003400 Sobic005G163866 Sobic005G163866 Sobic002G128101--Sobic005G163866 Sobic005G159801 Sobic005G159801 Sobic002G128101--Sobic005G159801 Sobic005G102350 Sobic005G102350 Sobic002G128101--Sobic005G102350 Sobic008G121240 Sobic008G121240 Sobic002G128101--Sobic008G121240 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic002G128101--Sobic003G351401 Sobic003G388000 Sobic003G388000 Sobic002G236500--Sobic003G388000 Sobic002G236500--Sobic002G128101 Sobic003G396700 Sobic003G396700 Sobic002G236500--Sobic003G396700 Sobic002G237800 Sobic002G237800 Sobic002G236500--Sobic002G237800 Sobic001G200200 Sobic001G200200 Sobic002G236500--Sobic001G200200 Sobic001G273000 Sobic001G273000 Sobic002G236500--Sobic001G273000 Sobic005G008600 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Sobic003G112001 Sobic003G112001 Sobic003G351401--Sobic003G112001
Octagon: transcription factors


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