Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G439900.7,Sobic.003G439900.2,Sobic.003G439900.6,Sobic.003G439900.3,Sobic.003G439900.5
Synonym Sb03g046965
Functional annotation 40S ribosomal protein S15, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q8G5 , C5XJ95 , A0A1B6Q8F8
Pfam -
Panther DB PTHR11880 PTHR11880:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006412; translation GO:0005840ribosome GO:0003735structural constituent of ribosome


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G09500 : Ribosomal protein S19 family protein,cytosolic ribosomal protein S15
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g08660.1 : 40S ribosomal protein S15, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G159801 - -
2 Sobic.001G262200 expressed protein -
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15 Sobic.002G188350 - -
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17 Sobic.004G166800 ribosomal protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G056400 - K10884: XRCC6, KU70, ATP-dependent DNA helicase 2 subunit 1
19 Sobic.006G019100 expressed protein -
20 Sobic.009G013300 rp3 protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G439900 Sobic003G439900 Sobic005G159801 Sobic005G159801 Sobic003G439900--Sobic005G159801 Sobic001G262200 Sobic001G262200 Sobic003G439900--Sobic001G262200 Sobic001G262800 Sobic001G262800 Sobic003G439900--Sobic001G262800 Sobic005G065200 Sobic005G065200 Sobic003G439900--Sobic005G065200 Sobic001G312400 Sobic001G312400 Sobic003G439900--Sobic001G312400 Sobic002G128101 Sobic002G128101 Sobic003G439900--Sobic002G128101 Sobic008G121240 Sobic008G121240 Sobic003G439900--Sobic008G121240 Sobic001G260300 Sobic001G260300 Sobic003G439900--Sobic001G260300 Sobic002G398200 Sobic002G398200 Sobic003G439900--Sobic002G398200 Sobic005G159801--Sobic003G439900 Sobic005G184050 Sobic005G184050 Sobic005G159801--Sobic005G184050 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic005G159801--Sobic001G091200 Sobic006G275700 Sobic006G275700 Sobic005G159801--Sobic006G275700 Sobic005G159801--Sobic002G398200 Sobic005G163866 Sobic005G163866 Sobic005G159801--Sobic005G163866 Sobic001G309800 Sobic001G309800 Sobic005G159801--Sobic001G309800 Sobic005G159801--Sobic002G128101 Sobic005G159801--Sobic001G262800 Sobic001G262100 Sobic001G262100 Sobic001G262200--Sobic001G262100 Sobic001G262200--Sobic003G439900 Sobic001G262200--Sobic001G262800 Sobic001G262200--Sobic008G121240 Sobic001G262200--Sobic005G065200 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic001G262200--Sobic003G351401 Sobic001G091100 Sobic001G091100 Sobic001G262200--Sobic001G091100 Sobic001G253800 Sobic001G253800 Sobic001G262200--Sobic001G253800 Sobic001G262200--Sobic001G260300 Sobic001G262800--Sobic001G260300 Sobic001G262800--Sobic008G121240 Sobic001G262800--Sobic001G262200 Sobic001G262800--Sobic003G439900 Sobic002G069500 Sobic002G069500 Sobic001G262800--Sobic002G069500 Sobic002G035300 Sobic002G035300 Sobic001G262800--Sobic002G035300 Sobic001G262800--Sobic001G312400 Sobic001G273000 Sobic001G273000 Sobic001G262800--Sobic001G273000 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic001G262800--Sobic005G128800 Sobic003G164600 Sobic003G164600 Sobic005G065200--Sobic003G164600 Sobic005G065200--Sobic003G439900 Sobic005G065200--Sobic008G121240 Sobic005G065200--Sobic001G262200 Sobic009G013300 Sobic009G013300 Sobic005G065200--Sobic009G013300 Sobic004G096801 Sobic004G096801 Sobic005G065200--Sobic004G096801 Sobic005G065200--Sobic005G163866 Sobic005G065200--Sobic002G069500 Sobic006G248350 Sobic006G248350 Sobic005G065200--Sobic006G248350 Sobic001G312400--Sobic001G260300 Sobic001G312400--Sobic006G248350 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic001G312400--Sobic008G120132 Sobic001G312400--Sobic005G128800 Sobic001G312400--Sobic003G351401 Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic001G312400--Sobic005G145800 Sobic001G312400--Sobic003G439900 Sobic005G124300 Sobic005G124300 Sobic001G312400--Sobic005G124300 Sobic001G312400--Sobic001G262800 Sobic002G236500 Sobic002G236500 Sobic002G128101--Sobic002G236500 Sobic002G128101--Sobic003G439900 Sobic002G128101--Sobic005G184050 Sobic005G003400 Sobic005G003400 Sobic002G128101--Sobic005G003400 Sobic002G128101--Sobic005G163866 Sobic002G128101--Sobic005G159801 Sobic005G102350 Sobic005G102350 Sobic002G128101--Sobic005G102350 Sobic002G128101--Sobic008G121240 Sobic002G128101--Sobic003G351401 Sobic008G121240--Sobic001G262800 Sobic008G121240--Sobic001G262200 Sobic008G121240--Sobic002G069500 Sobic008G121240--Sobic005G065200 Sobic008G121240--Sobic003G439900 Sobic008G121240--Sobic002G035300 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic008G121240--Sobic001G318100 Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic008G121240--Sobic002G101100 Sobic002G056400 Sobic002G056400 Sobic008G121240--Sobic002G056400 Sobic001G260300--Sobic001G312400 Sobic001G260300--Sobic002G035300 Sobic001G260300--Sobic001G262800 Sobic001G260300--Sobic005G124300 Sobic010G214400 Sobic010G214400 Sobic001G260300--Sobic010G214400 Sobic001G260300--Sobic001G091200 Sobic001G260300--Sobic002G398200 Sobic010G214500 Sobic010G214500 Sobic001G260300--Sobic010G214500 Sobic001G260300--Sobic003G439900 Sobic002G398200--Sobic001G309800 Sobic002G398200--Sobic005G159801 Sobic004G324600 Sobic004G324600 Sobic002G398200--Sobic004G324600 Sobic002G398200--Sobic001G260300 Sobic002G398200--Sobic003G439900 Sobic002G398200--Sobic001G312400 Sobic009G019800 Sobic009G019800 Sobic002G398200--Sobic009G019800 Sobic004G190700 Sobic004G190700 Sobic002G398200--Sobic004G190700 Sobic002G398200--Sobic005G163866
Octagon: transcription factors


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