Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G312400.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S8G8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G260300 - -
2 Sobic.006G248350 - -
3 Sobic.008G120132 - -
4 Sobic.005G128800 translationally-controlled tumor protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G351401 - -
6 Sobic.005G145800 - -
7 Sobic.003G439900 40S ribosomal protein S15, putative, expressed -
8 Sobic.005G124300 - -
9 Sobic.001G262800 - -
10 Sobic.010G143000 - -
11 Sobic.005G163866 - -
12 Sobic.002G035300 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
13 Sobic.004G132600 aminotransferase, putative, expressed K11717: cysteine desulfurase / selenocysteine lyase
14 Sobic.001G318100 - -
15 Sobic.010G243600 - -
16 Sobic.005G159801 - -
17 Sobic.002G398200 RGH1A, putative, expressed -
18 Sobic.001G528400 tobamovirus multiplication protein, putative, expressed -
19 Sobic.005G115400 - -
20 Sobic.005G127900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G312400 Sobic001G312400 Sobic001G260300 Sobic001G260300 Sobic001G312400--Sobic001G260300 Sobic006G248350 Sobic006G248350 Sobic001G312400--Sobic006G248350 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic001G312400--Sobic008G120132 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic001G312400--Sobic005G128800 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic001G312400--Sobic003G351401 Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic001G312400--Sobic005G145800 Sobic003G439900 Sobic003G439900 Sobic001G312400--Sobic003G439900 Sobic005G124300 Sobic005G124300 Sobic001G312400--Sobic005G124300 Sobic001G262800 Sobic001G262800 Sobic001G312400--Sobic001G262800 Sobic001G260300--Sobic001G312400 Sobic002G035300 Sobic002G035300 Sobic001G260300--Sobic002G035300 Sobic001G260300--Sobic001G262800 Sobic001G260300--Sobic005G124300 Sobic010G214400 Sobic010G214400 Sobic001G260300--Sobic010G214400 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic001G260300--Sobic001G091200 Sobic002G398200 Sobic002G398200 Sobic001G260300--Sobic002G398200 Sobic010G214500 Sobic010G214500 Sobic001G260300--Sobic010G214500 Sobic001G260300--Sobic003G439900 Sobic006G248350--Sobic001G312400 Sobic006G248350--Sobic010G214400 Sobic006G165600 Sobic006G165600 Sobic006G248350--Sobic006G165600 Sobic003G128550 Sobic003G128550 Sobic006G248350--Sobic003G128550 Sobic009G013300 Sobic009G013300 Sobic006G248350--Sobic009G013300 Sobic006G248350--Sobic005G124300 Sobic002G413900 Sobic002G413900 Sobic006G248350--Sobic002G413900 Sobic005G115400 Sobic005G115400 Sobic006G248350--Sobic005G115400 Sobic006G248350--Sobic001G260300 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic008G120132--Sobic010G143000 Sobic008G120132--Sobic005G128800 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic008G120132--Sobic001G318100 Sobic008G120132--Sobic005G115400 Sobic010G115900 Sobic010G115900 Sobic008G120132--Sobic010G115900 Sobic009G214800 Sobic009G214800 Sobic008G120132--Sobic009G214800 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic008G120132--Sobic009G070250 Sobic001G353800 Sobic001G353800 Sobic008G120132--Sobic001G353800 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic008G120132--Sobic005G108225 Sobic005G128800--Sobic008G120132 Sobic005G128800--Sobic010G115900 Sobic005G128800--Sobic010G143000 Sobic010G100200 Sobic010G100200 Sobic005G128800--Sobic010G100200 Sobic005G128800--Sobic009G070250 Sobic005G128800--Sobic001G353800 Sobic005G128800--Sobic005G124300 Sobic005G128800--Sobic005G115400 Sobic005G128800--Sobic001G318100 Sobic005G163866 Sobic005G163866 Sobic003G351401--Sobic005G163866 Sobic010G135250 Sobic010G135250 Sobic003G351401--Sobic010G135250 Sobic007G188800 Sobic007G188800 Sobic003G351401--Sobic007G188800 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic003G351401--Sobic010G102366 Sobic001G528500 Sobic001G528500 Sobic003G351401--Sobic001G528500 Sobic003G351401--Sobic001G312400 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic003G351401--Sobic003G207500 Sobic009G089101 Sobic009G089101 Sobic003G351401--Sobic009G089101 Sobic003G112001 Sobic003G112001 Sobic003G351401--Sobic003G112001 Sobic005G145800--Sobic002G035300 Sobic010G028501 Sobic010G028501 Sobic005G145800--Sobic010G028501 Sobic005G145800--Sobic009G070250 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic005G145800--Sobic005G127900 Sobic001G273000 Sobic001G273000 Sobic005G145800--Sobic001G273000 Sobic005G145800--Sobic008G120132 Sobic001G528400 Sobic001G528400 Sobic005G145800--Sobic001G528400 Sobic009G093800 Sobic009G093800 Sobic005G145800--Sobic009G093800 Sobic005G145800--Sobic001G312400 Sobic005G159801 Sobic005G159801 Sobic003G439900--Sobic005G159801 Sobic001G262200 Sobic001G262200 Sobic003G439900--Sobic001G262200 Sobic003G439900--Sobic001G262800 Sobic005G065200 Sobic005G065200 Sobic003G439900--Sobic005G065200 Sobic003G439900--Sobic001G312400 Sobic002G128101 Sobic002G128101 Sobic003G439900--Sobic002G128101 Sobic008G121240 Sobic008G121240 Sobic003G439900--Sobic008G121240 Sobic003G439900--Sobic001G260300 Sobic003G439900--Sobic002G398200 Sobic005G124300--Sobic010G214400 Sobic009G107020 Sobic009G107020 Sobic005G124300--Sobic009G107020 Sobic005G124300--Sobic005G115400 Sobic005G124300--Sobic001G260300 Sobic005G124300--Sobic010G115900 Sobic005G124300--Sobic005G128800 Sobic005G124300--Sobic002G413900 Sobic009G070300 Sobic009G070300 Sobic005G124300--Sobic009G070300 Sobic005G124300--Sobic003G128550 Sobic001G262800--Sobic001G260300 Sobic001G262800--Sobic008G121240 Sobic001G262800--Sobic001G262200 Sobic001G262800--Sobic003G439900 Sobic002G069500 Sobic002G069500 Sobic001G262800--Sobic002G069500 Sobic001G262800--Sobic002G035300 Sobic001G262800--Sobic001G312400 Sobic001G262800--Sobic001G273000 Sobic001G262800--Sobic005G128800
Octagon: transcription factors


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