Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G163866.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJE8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G184050 - -
2 Sobic.005G145550 - -
3 Sobic.004G096801 - -
4 Sobic.010G214500 purple acid phosphatase, putative, expressed -
5 Sobic.006G165600 - -
6 Sobic.003G351401 - -
7 Sobic.003G164600 - -
8 Sobic.007G188800 "Candidate orthologue to the wheat Pm40 gene, Disease resistance RGA1"(PubMedID : 27755575)@CC-NBS-LRR, putative, expressed -
9 Sobic.005G159801 - -
10 Sobic.009G029001 - -
11 Sobic.004G111300 - -
12 Sobic.005G189300 - -
13 Sobic.001G312400 - -
14 Sobic.002G237800 NOL1/NOP2/sun family protein, putative, expressed K03500: rsmB, 16S rRNA (cytosine967-C5)-methyltransferase
15 Sobic.004G324700 - -
16 Sobic.002G128101 - -
17 Sobic.004G132600 aminotransferase, putative, expressed K11717: cysteine desulfurase / selenocysteine lyase
18 Sobic.003G207500 signal peptide peptidase domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G008600 double-stranded RNA binding motif containing protein, expressed -
20 Sobic.007G113400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G163866 Sobic005G163866 Sobic005G184050 Sobic005G184050 Sobic005G163866--Sobic005G184050 Sobic005G145550 Sobic005G145550 Sobic005G163866--Sobic005G145550 Sobic004G096801 Sobic004G096801 Sobic005G163866--Sobic004G096801 Sobic010G214500 Sobic010G214500 Sobic005G163866--Sobic010G214500 Sobic006G165600 Sobic006G165600 Sobic005G163866--Sobic006G165600 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic005G163866--Sobic003G351401 Sobic003G164600 Sobic003G164600 Sobic005G163866--Sobic003G164600 Sobic007G188800 Sobic007G188800 Sobic005G163866--Sobic007G188800 Sobic005G159801 Sobic005G159801 Sobic005G163866--Sobic005G159801 Sobic005G184050--Sobic005G163866 Sobic005G184050--Sobic004G096801 Sobic005G184050--Sobic005G159801 Sobic002G128101 Sobic002G128101 Sobic005G184050--Sobic002G128101 Sobic005G003400 Sobic005G003400 Sobic005G184050--Sobic005G003400 Sobic005G188300 Sobic005G188300 Sobic005G184050--Sobic005G188300 Sobic002G188350 Sobic002G188350 Sobic005G184050--Sobic002G188350 Sobic002G237800 Sobic002G237800 Sobic005G184050--Sobic002G237800 Sobic005G184050--Sobic005G145550 Sobic005G189300 Sobic005G189300 Sobic005G145550--Sobic005G189300 Sobic007G163001 Sobic007G163001 Sobic005G145550--Sobic007G163001 Sobic004G324700 Sobic004G324700 Sobic005G145550--Sobic004G324700 Sobic001G475100 Sobic001G475100 Sobic005G145550--Sobic001G475100 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic005G145550--Sobic003G207500 Sobic002G031900 Sobic002G031900 Sobic005G145550--Sobic002G031900 Sobic005G145550--Sobic007G188800 Sobic003G179350 Sobic003G179350 Sobic005G145550--Sobic003G179350 Sobic004G111300 Sobic004G111300 Sobic005G145550--Sobic004G111300 Sobic004G096801--Sobic005G184050 Sobic004G096801--Sobic005G163866 Sobic009G029001 Sobic009G029001 Sobic004G096801--Sobic009G029001 Sobic005G065200 Sobic005G065200 Sobic004G096801--Sobic005G065200 Sobic007G181300 Sobic007G181300 Sobic004G096801--Sobic007G181300 Sobic002G128900 Sobic002G128900 Sobic004G096801--Sobic002G128900 Sobic002G279700 Sobic002G279700 Sobic004G096801--Sobic002G279700 Sobic008G006200 Sobic008G006200 Sobic004G096801--Sobic008G006200 Sobic005G183400 Sobic005G183400 Sobic004G096801--Sobic005G183400 Sobic010G214500--Sobic007G163001 Sobic010G214500--Sobic004G324700 Sobic010G214500--Sobic005G145550 Sobic010G214500--Sobic003G207500 Sobic010G214500--Sobic007G188800 Sobic010G214500--Sobic004G111300 Sobic010G214500--Sobic002G031900 Sobic001G528500 Sobic001G528500 Sobic010G214500--Sobic001G528500 Sobic008G111200 Sobic008G111200 Sobic010G214500--Sobic008G111200 Sobic003G439600 Sobic003G439600 Sobic006G165600--Sobic003G439600 Sobic006G193200 Sobic006G193200 Sobic006G165600--Sobic006G193200 Sobic006G165600--Sobic005G163866 Sobic009G017666 Sobic009G017666 Sobic006G165600--Sobic009G017666 Sobic004G025400 Sobic004G025400 Sobic006G165600--Sobic004G025400 Sobic005G028900 Sobic005G028900 Sobic006G165600--Sobic005G028900 Sobic006G214700 Sobic006G214700 Sobic006G165600--Sobic006G214700 Sobic007G132500 Sobic007G132500 Sobic006G165600--Sobic007G132500 Sobic006G248350 Sobic006G248350 Sobic006G165600--Sobic006G248350 Sobic003G351401--Sobic005G163866 Sobic010G135250 Sobic010G135250 Sobic003G351401--Sobic010G135250 Sobic003G351401--Sobic007G188800 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic003G351401--Sobic010G102366 Sobic003G351401--Sobic001G528500 Sobic001G312400 Sobic001G312400 Sobic003G351401--Sobic001G312400 Sobic003G351401--Sobic003G207500 Sobic009G089101 Sobic009G089101 Sobic003G351401--Sobic009G089101 Sobic003G112001 Sobic003G112001 Sobic003G351401--Sobic003G112001 Sobic003G164600--Sobic005G065200 Sobic003G164600--Sobic005G163866 Sobic003G385401 Sobic003G385401 Sobic003G164600--Sobic003G385401 Sobic003G439900 Sobic003G439900 Sobic003G164600--Sobic003G439900 Sobic006G275700 Sobic006G275700 Sobic003G164600--Sobic006G275700 Sobic003G164600--Sobic004G096801 Sobic001G486700 Sobic001G486700 Sobic003G164600--Sobic001G486700 Sobic010G142700 Sobic010G142700 Sobic003G164600--Sobic010G142700 Sobic007G170700 Sobic007G170700 Sobic003G164600--Sobic007G170700 Sobic007G188800--Sobic007G163001 Sobic007G188800--Sobic003G207500 Sobic007G188800--Sobic005G145550 Sobic003G251100 Sobic003G251100 Sobic007G188800--Sobic003G251100 Sobic010G273300 Sobic010G273300 Sobic007G188800--Sobic010G273300 Sobic007G188800--Sobic001G475100 Sobic005G102900 Sobic005G102900 Sobic007G188800--Sobic005G102900 Sobic007G188800--Sobic010G214500 Sobic007G188800--Sobic005G189300 Sobic005G159801--Sobic003G439900 Sobic005G159801--Sobic005G184050 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic005G159801--Sobic001G091200 Sobic005G159801--Sobic006G275700 Sobic002G398200 Sobic002G398200 Sobic005G159801--Sobic002G398200 Sobic005G159801--Sobic005G163866 Sobic001G309800 Sobic001G309800 Sobic005G159801--Sobic001G309800 Sobic005G159801--Sobic002G128101 Sobic001G262800 Sobic001G262800 Sobic005G159801--Sobic001G262800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.