Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G159801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIS4
Pfam PF03283
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016787; hydrolase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G57590 : Pectinacetylesterase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g44070.1 : pectinacetylesterase domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G439900 40S ribosomal protein S15, putative, expressed -
2 Sobic.005G184050 - -
3 Sobic.001G091200 - -
4 Sobic.006G275700 expressed protein -
5 Sobic.002G398200 RGH1A, putative, expressed -
6 Sobic.005G163866 - -
7 Sobic.001G309800 - -
8 Sobic.002G128101 - -
9 Sobic.001G262800 - -
10 Sobic.001G312400 - -
11 Sobic.004G190700 zinc finger, C3HC4 type, putative, expressed -
12 Sobic.008G121240 - -
13 Sobic.002G236500 OsPOP19 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed -
14 Sobic.002G066901 - -
15 Sobic.002G188350 - -
16 Sobic.004G146100 C2 domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.006G248350 - -
18 Sobic.010G273300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
19 Sobic.001G260300 - -
20 Sobic.004G324300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G159801 Sobic005G159801 Sobic003G439900 Sobic003G439900 Sobic005G159801--Sobic003G439900 Sobic005G184050 Sobic005G184050 Sobic005G159801--Sobic005G184050 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic005G159801--Sobic001G091200 Sobic006G275700 Sobic006G275700 Sobic005G159801--Sobic006G275700 Sobic002G398200 Sobic002G398200 Sobic005G159801--Sobic002G398200 Sobic005G163866 Sobic005G163866 Sobic005G159801--Sobic005G163866 Sobic001G309800 Sobic001G309800 Sobic005G159801--Sobic001G309800 Sobic002G128101 Sobic002G128101 Sobic005G159801--Sobic002G128101 Sobic001G262800 Sobic001G262800 Sobic005G159801--Sobic001G262800 Sobic003G439900--Sobic005G159801 Sobic001G262200 Sobic001G262200 Sobic003G439900--Sobic001G262200 Sobic003G439900--Sobic001G262800 Sobic005G065200 Sobic005G065200 Sobic003G439900--Sobic005G065200 Sobic001G312400 Sobic001G312400 Sobic003G439900--Sobic001G312400 Sobic003G439900--Sobic002G128101 Sobic008G121240 Sobic008G121240 Sobic003G439900--Sobic008G121240 Sobic001G260300 Sobic001G260300 Sobic003G439900--Sobic001G260300 Sobic003G439900--Sobic002G398200 Sobic005G184050--Sobic005G163866 Sobic004G096801 Sobic004G096801 Sobic005G184050--Sobic004G096801 Sobic005G184050--Sobic005G159801 Sobic005G184050--Sobic002G128101 Sobic005G003400 Sobic005G003400 Sobic005G184050--Sobic005G003400 Sobic005G188300 Sobic005G188300 Sobic005G184050--Sobic005G188300 Sobic002G188350 Sobic002G188350 Sobic005G184050--Sobic002G188350 Sobic002G237800 Sobic002G237800 Sobic005G184050--Sobic002G237800 Sobic005G145550 Sobic005G145550 Sobic005G184050--Sobic005G145550 Sobic004G146100 Sobic004G146100 Sobic001G091200--Sobic004G146100 Sobic003G208500 Sobic003G208500 Sobic001G091200--Sobic003G208500 Sobic003G388000 Sobic003G388000 Sobic001G091200--Sobic003G388000 Sobic001G091200--Sobic005G159801 Sobic001G091200--Sobic001G260300 Sobic001G475000 Sobic001G475000 Sobic001G091200--Sobic001G475000 Sobic001G273000 Sobic001G273000 Sobic001G091200--Sobic001G273000 Sobic008G168700 Sobic008G168700 Sobic001G091200--Sobic008G168700 Sobic005G104300 Sobic005G104300 Sobic001G091200--Sobic005G104300 Sobic006G275700--Sobic005G159801 Sobic001G091100 Sobic001G091100 Sobic006G275700--Sobic001G091100 Sobic006G275700--Sobic003G439900 Sobic006G057600 Sobic006G057600 Sobic006G275700--Sobic006G057600 Sobic006G275700--Sobic008G121240 Sobic003G164600 Sobic003G164600 Sobic006G275700--Sobic003G164600 Sobic001G475100 Sobic001G475100 Sobic006G275700--Sobic001G475100 Sobic006G275700--Sobic005G188300 Sobic006G275700--Sobic001G262200 Sobic002G398200--Sobic001G309800 Sobic002G398200--Sobic005G159801 Sobic004G324600 Sobic004G324600 Sobic002G398200--Sobic004G324600 Sobic002G398200--Sobic001G260300 Sobic002G398200--Sobic003G439900 Sobic002G398200--Sobic001G312400 Sobic009G019800 Sobic009G019800 Sobic002G398200--Sobic009G019800 Sobic004G190700 Sobic004G190700 Sobic002G398200--Sobic004G190700 Sobic002G398200--Sobic005G163866 Sobic005G163866--Sobic005G184050 Sobic005G163866--Sobic005G145550 Sobic005G163866--Sobic004G096801 Sobic010G214500 Sobic010G214500 Sobic005G163866--Sobic010G214500 Sobic006G165600 Sobic006G165600 Sobic005G163866--Sobic006G165600 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic005G163866--Sobic003G351401 Sobic005G163866--Sobic003G164600 Sobic007G188800 Sobic007G188800 Sobic005G163866--Sobic007G188800 Sobic005G163866--Sobic005G159801 Sobic001G309800--Sobic002G398200 Sobic001G309800--Sobic005G159801 Sobic001G309800--Sobic005G163866 Sobic001G309800--Sobic003G439900 Sobic001G309800--Sobic004G096801 Sobic010G004701 Sobic010G004701 Sobic001G309800--Sobic010G004701 Sobic004G122100 Sobic004G122100 Sobic001G309800--Sobic004G122100 Sobic001G309800--Sobic001G262200 Sobic003G418733 Sobic003G418733 Sobic001G309800--Sobic003G418733 Sobic002G236500 Sobic002G236500 Sobic002G128101--Sobic002G236500 Sobic002G128101--Sobic003G439900 Sobic002G128101--Sobic005G184050 Sobic002G128101--Sobic005G003400 Sobic002G128101--Sobic005G163866 Sobic002G128101--Sobic005G159801 Sobic005G102350 Sobic005G102350 Sobic002G128101--Sobic005G102350 Sobic002G128101--Sobic008G121240 Sobic002G128101--Sobic003G351401 Sobic001G262800--Sobic001G260300 Sobic001G262800--Sobic008G121240 Sobic001G262800--Sobic001G262200 Sobic001G262800--Sobic003G439900 Sobic002G069500 Sobic002G069500 Sobic001G262800--Sobic002G069500 Sobic002G035300 Sobic002G035300 Sobic001G262800--Sobic002G035300 Sobic001G262800--Sobic001G312400 Sobic001G262800--Sobic001G273000 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic001G262800--Sobic005G128800
Octagon: transcription factors


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