Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G398200.1
Synonym Sb02g041290
Functional annotation RGH1A, putative, expressed
UniProt C5X3Y8
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF537
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G46730 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g13430.1 : RGH1A, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015323
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G309800 - -
2 Sobic.005G159801 - -
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20 Sobic.009G012200 RPA1C - Putative single-stranded DNA binding complex subunit 1, expressed K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1


Gene co-expression network
sample Sobic002G398200 Sobic002G398200 Sobic001G309800 Sobic001G309800 Sobic002G398200--Sobic001G309800 Sobic005G159801 Sobic005G159801 Sobic002G398200--Sobic005G159801 Sobic004G324600 Sobic004G324600 Sobic002G398200--Sobic004G324600 Sobic001G260300 Sobic001G260300 Sobic002G398200--Sobic001G260300 Sobic003G439900 Sobic003G439900 Sobic002G398200--Sobic003G439900 Sobic001G312400 Sobic001G312400 Sobic002G398200--Sobic001G312400 Sobic009G019800 Sobic009G019800 Sobic002G398200--Sobic009G019800 Sobic004G190700 Sobic004G190700 Sobic002G398200--Sobic004G190700 Sobic005G163866 Sobic005G163866 Sobic002G398200--Sobic005G163866 Sobic001G309800--Sobic002G398200 Sobic001G309800--Sobic005G159801 Sobic001G309800--Sobic005G163866 Sobic001G309800--Sobic003G439900 Sobic004G096801 Sobic004G096801 Sobic001G309800--Sobic004G096801 Sobic010G004701 Sobic010G004701 Sobic001G309800--Sobic010G004701 Sobic004G122100 Sobic004G122100 Sobic001G309800--Sobic004G122100 Sobic001G262200 Sobic001G262200 Sobic001G309800--Sobic001G262200 Sobic003G418733 Sobic003G418733 Sobic001G309800--Sobic003G418733 Sobic005G159801--Sobic003G439900 Sobic005G184050 Sobic005G184050 Sobic005G159801--Sobic005G184050 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic005G159801--Sobic001G091200 Sobic006G275700 Sobic006G275700 Sobic005G159801--Sobic006G275700 Sobic005G159801--Sobic002G398200 Sobic005G159801--Sobic005G163866 Sobic005G159801--Sobic001G309800 Sobic002G128101 Sobic002G128101 Sobic005G159801--Sobic002G128101 Sobic001G262800 Sobic001G262800 Sobic005G159801--Sobic001G262800 Sobic010G214400 Sobic010G214400 Sobic004G324600--Sobic010G214400 Sobic009G017666 Sobic009G017666 Sobic004G324600--Sobic009G017666 Sobic004G324600--Sobic002G398200 Sobic002G115100 Sobic002G115100 Sobic004G324600--Sobic002G115100 Sobic006G165600 Sobic006G165600 Sobic004G324600--Sobic006G165600 Sobic003G306700 Sobic003G306700 Sobic004G324600--Sobic003G306700 Sobic007G132500 Sobic007G132500 Sobic004G324600--Sobic007G132500 Sobic004G268500 Sobic004G268500 Sobic004G324600--Sobic004G268500 Sobic003G096500 Sobic003G096500 Sobic004G324600--Sobic003G096500 Sobic001G260300--Sobic001G312400 Sobic002G035300 Sobic002G035300 Sobic001G260300--Sobic002G035300 Sobic001G260300--Sobic001G262800 Sobic005G124300 Sobic005G124300 Sobic001G260300--Sobic005G124300 Sobic001G260300--Sobic010G214400 Sobic001G260300--Sobic001G091200 Sobic001G260300--Sobic002G398200 Sobic010G214500 Sobic010G214500 Sobic001G260300--Sobic010G214500 Sobic001G260300--Sobic003G439900 Sobic003G439900--Sobic005G159801 Sobic003G439900--Sobic001G262200 Sobic003G439900--Sobic001G262800 Sobic005G065200 Sobic005G065200 Sobic003G439900--Sobic005G065200 Sobic003G439900--Sobic001G312400 Sobic003G439900--Sobic002G128101 Sobic008G121240 Sobic008G121240 Sobic003G439900--Sobic008G121240 Sobic003G439900--Sobic001G260300 Sobic003G439900--Sobic002G398200 Sobic001G312400--Sobic001G260300 Sobic006G248350 Sobic006G248350 Sobic001G312400--Sobic006G248350 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic001G312400--Sobic008G120132 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic001G312400--Sobic005G128800 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic001G312400--Sobic003G351401 Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic001G312400--Sobic005G145800 Sobic001G312400--Sobic003G439900 Sobic001G312400--Sobic005G124300 Sobic001G312400--Sobic001G262800 Sobic005G132600 Sobic005G132600 Sobic009G019800--Sobic005G132600 Sobic003G251100 Sobic003G251100 Sobic009G019800--Sobic003G251100 Sobic010G121100 Sobic010G121100 Sobic009G019800--Sobic010G121100 Sobic010G273300 Sobic010G273300 Sobic009G019800--Sobic010G273300 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic009G019800--Sobic003G207500 Sobic007G163001 Sobic007G163001 Sobic009G019800--Sobic007G163001 Sobic004G130964 Sobic004G130964 Sobic009G019800--Sobic004G130964 Sobic001G159032 Sobic001G159032 Sobic009G019800--Sobic001G159032 Sobic007G188800 Sobic007G188800 Sobic009G019800--Sobic007G188800 Sobic007G073700 Sobic007G073700 Sobic004G190700--Sobic007G073700 Sobic007G029100 Sobic007G029100 Sobic004G190700--Sobic007G029100 Sobic002G428800 Sobic002G428800 Sobic004G190700--Sobic002G428800 Sobic003G053900 Sobic003G053900 Sobic004G190700--Sobic003G053900 Sobic004G302150 Sobic004G302150 Sobic004G190700--Sobic004G302150 Sobic003G134000 Sobic003G134000 Sobic004G190700--Sobic003G134000 Sobic001G501300 Sobic001G501300 Sobic004G190700--Sobic001G501300 Sobic007G200900 Sobic007G200900 Sobic004G190700--Sobic007G200900 Sobic003G378400 Sobic003G378400 Sobic004G190700--Sobic003G378400 Sobic005G163866--Sobic005G184050 Sobic005G145550 Sobic005G145550 Sobic005G163866--Sobic005G145550 Sobic005G163866--Sobic004G096801 Sobic005G163866--Sobic010G214500 Sobic005G163866--Sobic006G165600 Sobic005G163866--Sobic003G351401 Sobic003G164600 Sobic003G164600 Sobic005G163866--Sobic003G164600 Sobic005G163866--Sobic007G188800 Sobic005G163866--Sobic005G159801
Octagon: transcription factors


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