Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G115100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QAK7
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NCBI CDD -
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cDNA sequences
Sobic.002G115100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G183800 AAA family ATPase, putative, expressed K03544: clpX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX
2 Sobic.010G030300 serine threonine kinase, putative, expressed -
3 Sobic.010G269400 DNL zinc finger domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G404500 gamma-interferon-inducible lysosomal thiol reductase precursor, putative, expressed K08059: IFI30, interferon, gamma-inducible protein 30
5 Sobic.004G210900 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
6 Sobic.005G175500 TKL_IRAK_DUF26-lc.25 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
7 Sobic.006G123500 peptide methionine sulfoxide reductase, putative, expressed K07304: peptide-methionine (S)-S-oxide reductase
8 Sobic.008G072700 expressed protein -
9 Sobic.004G268500 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase 1, chloroplast precursor, putative, expressed K09840: 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase
10 Sobic.002G142066 - K18045: SIW14, tyrosine-protein phosphatase SIW14
11 Sobic.010G189200 pentatricopeptide, putative, expressed -
12 Sobic.009G141400 transcriptional regulator, putative, expressed -
13 Sobic.009G017666 - -
14 Sobic.003G014300 expressed protein -
15 Sobic.002G362100 expressed protein -
16 Sobic.010G080300 peptidase, putative, expressed K01436: amidohydrolase
17 Sobic.006G164300 YELLOW STRIPE like 2(PubMedID : 26465154)@- -
18 Sobic.003G179400 NLI interacting factor(NIF) family protein(PubMedID : 26320239)@NLI interacting factor-like phosphatase, putative, expressed K15731: carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase
19 Sobic.003G037300 Twin LOV 1, putative, expressed -
20 Sobic.008G065200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@receptor protein kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G115100 Sobic002G115100 Sobic004G183800 Sobic004G183800 Sobic002G115100--Sobic004G183800 Sobic010G030300 Sobic010G030300 Sobic002G115100--Sobic010G030300 Sobic010G269400 Sobic010G269400 Sobic002G115100--Sobic010G269400 Sobic001G404500 Sobic001G404500 Sobic002G115100--Sobic001G404500 Sobic004G210900 Sobic004G210900 Sobic002G115100--Sobic004G210900 Sobic005G175500 Sobic005G175500 Sobic002G115100--Sobic005G175500 Sobic006G123500 Sobic006G123500 Sobic002G115100--Sobic006G123500 Sobic008G072700 Sobic008G072700 Sobic002G115100--Sobic008G072700 Sobic004G268500 Sobic004G268500 Sobic002G115100--Sobic004G268500 Sobic010G189200 Sobic010G189200 Sobic004G183800--Sobic010G189200 Sobic004G183800--Sobic004G210900 Sobic004G183800--Sobic005G175500 Sobic010G109600 Sobic010G109600 Sobic004G183800--Sobic010G109600 Sobic001G043800 Sobic001G043800 Sobic004G183800--Sobic001G043800 Sobic001G300100 Sobic001G300100 Sobic004G183800--Sobic001G300100 Sobic009G193500 Sobic009G193500 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Octagon: transcription factors


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