Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G072700.1
Synonym Sb08g006420
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YTL0
Pfam -
Panther DB PTHR36789
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G40045 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g10510.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054445
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G159000 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
2 Sobic.004G201700 glycosyl transferase family 17 protein, putative, expressed K00737: beta-1,4-mannosyl-glycoprotein beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase
3 Sobic.002G281800 expressed protein -
4 Sobic.001G404500 gamma-interferon-inducible lysosomal thiol reductase precursor, putative, expressed K08059: IFI30, interferon, gamma-inducible protein 30
5 Sobic.009G062500 -(PubMedID : 26976818)@triose phosphate/phosphate translocator, non-green plastid,chloroplast precursor, putative, expressed K15283: solute carrier family 35, member E1
6 Sobic.008G015100 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.8 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
7 Sobic.001G525900 homeobox domain containing protein, expressed -
8 Sobic.005G111500 FHA domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.005G097800 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
10 Sobic.009G189000 expressed protein -
11 Sobic.010G269400 DNL zinc finger domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G037300 Twin LOV 1, putative, expressed -
13 Sobic.003G108600 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
14 Sobic.001G078400 OsSigP2 - Putative Type I Signal Peptidase homologue@ employs a putative Ser/Lys catalytic dyad, expressed K03100: signal peptidase I
15 Sobic.003G291400 dehydrogenase, putative, expressed -
16 Sobic.006G131800 B-box (BBX) protein(PubMedID : 30626335)@B-box zinc finger family protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G281000 aquaporin protein, putative, expressed K09872: aquaporin PIP
18 Sobic.008G101400 - -
19 Sobic.003G392700 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
20 Sobic.007G046500 60S ribosomal protein L18a-1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G072700 Sobic008G072700 Sobic007G159000 Sobic007G159000 Sobic008G072700--Sobic007G159000 Sobic004G201700 Sobic004G201700 Sobic008G072700--Sobic004G201700 Sobic002G281800 Sobic002G281800 Sobic008G072700--Sobic002G281800 Sobic001G404500 Sobic001G404500 Sobic008G072700--Sobic001G404500 Sobic009G062500 Sobic009G062500 Sobic008G072700--Sobic009G062500 Sobic008G015100 Sobic008G015100 Sobic008G072700--Sobic008G015100 Sobic001G525900 Sobic001G525900 Sobic008G072700--Sobic001G525900 Sobic005G111500 Sobic005G111500 Sobic008G072700--Sobic005G111500 Sobic005G097800 Sobic005G097800 Sobic008G072700--Sobic005G097800 Sobic007G159000--Sobic008G072700 Sobic002G145000 Sobic002G145000 Sobic007G159000--Sobic002G145000 Sobic004G294700 Sobic004G294700 Sobic007G159000--Sobic004G294700 Sobic007G159000--Sobic009G062500 Sobic007G159000--Sobic004G201700 Sobic004G147200 Sobic004G147200 Sobic007G159000--Sobic004G147200 Sobic001G078400 Sobic001G078400 Sobic007G159000--Sobic001G078400 Sobic003G291400 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Octagon: transcription factors


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