Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G281800.2
Synonym Sb02g031470
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W666
Pfam PF13462
Panther DB PTHR33875 PTHR33875:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G20225 : Thioredoxin superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g37020.3 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014473
Brachypodium PNT65040
Barley -
Wheat TraesCS5D02G340400 , TraesCS5A02G335600 , TraesCS5B02G334900 , TraesCS2D02G065900 , TraesCS2A02G067600
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G281800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G080300 peptidase, putative, expressed K01436: amidohydrolase
2 Sobic.003G291400 dehydrogenase, putative, expressed -
3 Sobic.008G072700 expressed protein -
4 Sobic.007G046500 60S ribosomal protein L18a-1, putative, expressed -
5 Sobic.007G029100 ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type, putative, expressed -
6 Sobic.009G190800 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
7 Sobic.003G310100 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G152100 expressed protein -
9 Sobic.009G029700 aminotransferase, putative, expressed K00818: E2.6.1.11, acetylornithine aminotransferase
10 Sobic.002G424100 parvulin-type peptidyl prolyl cis/trans isomerase, putative, expressed -
11 Sobic.001G053000 small multi-drug export protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G006400 DANA2, putative, expressed -
13 Sobic.001G043800 stage II sporulation protein E, putative, expressed -
14 Sobic.001G295300 peptide methionine sulfoxide reductase, putative, expressed K07304: peptide-methionine (S)-S-oxide reductase
15 Sobic.003G125400 Fe-S metabolism associated domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G404200 F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G021600 expressed protein -
18 Sobic.009G028400 expressed protein -
19 Sobic.010G218600 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.001G416300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G281800 Sobic002G281800 Sobic010G080300 Sobic010G080300 Sobic002G281800--Sobic010G080300 Sobic003G291400 Sobic003G291400 Sobic002G281800--Sobic003G291400 Sobic008G072700 Sobic008G072700 Sobic002G281800--Sobic008G072700 Sobic007G046500 Sobic007G046500 Sobic002G281800--Sobic007G046500 Sobic007G029100 Sobic007G029100 Sobic002G281800--Sobic007G029100 Sobic009G190800 Sobic009G190800 Sobic002G281800--Sobic009G190800 Sobic003G310100 Sobic003G310100 Sobic002G281800--Sobic003G310100 Sobic004G152100 Sobic004G152100 Sobic002G281800--Sobic004G152100 Sobic009G029700 Sobic009G029700 Sobic002G281800--Sobic009G029700 Sobic010G080300--Sobic002G281800 Sobic008G193300 Sobic008G193300 Sobic010G080300--Sobic008G193300 Sobic003G125400 Sobic003G125400 Sobic010G080300--Sobic003G125400 Sobic010G080300--Sobic007G046500 Sobic008G063200 Sobic008G063200 Sobic010G080300--Sobic008G063200 Sobic008G144800 Sobic008G144800 Sobic010G080300--Sobic008G144800 Sobic005G072200 Sobic005G072200 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Octagon: transcription factors


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