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Transcriptome id Sobic.004G302150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RQT3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G190700 zinc finger, C3HC4 type, putative, expressed -
2 Sobic.006G165600 - -
3 Sobic.002G428800 ubiquitin-activating enzyme, putative, expressed K03178: UBE1, ubiquitin-activating enzyme E1
4 Sobic.003G378400 DUF803 domain containing, putative, expressed -
5 Sobic.010G102366 - -
6 Sobic.010G089800 expressed protein -
7 Sobic.009G094700 haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G486700 adenylosuccinate synthetase, chloroplast precursor, putative, expressed K01939: purA, adenylosuccinate synthase
9 Sobic.005G140500 peptidase, M24 family protein, putative, expressed K01262: Xaa-Pro aminopeptidase
10 Sobic.010G273300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
11 Sobic.004G290000 OsSub19 - Putative Subtilisin homologue, expressed K01280: tripeptidyl-peptidase II
12 Sobic.004G043900 - -
13 Sobic.006G238600 chloride channel protein, putative, expressed K05016: chloride channel 7
14 Sobic.007G170700 male sterility protein 2, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
15 Sobic.002G236500 OsPOP19 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed -
16 Sobic.007G073700 nucleoside transporter, putative, expressed K15014: SLC29A1_2_3, solute carrier family 29 (equilibrative nucleoside transporter), member 1/2/3
17 Sobic.001G312400 - -
18 Sobic.002G398200 RGH1A, putative, expressed -
19 Sobic.002G301200 OsSCP39 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16298: serine carboxypeptidase-like clade IV
20 Sobic.001G093800 WD domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G302150 Sobic004G302150 Sobic004G190700 Sobic004G190700 Sobic004G302150--Sobic004G190700 Sobic006G165600 Sobic006G165600 Sobic004G302150--Sobic006G165600 Sobic002G428800 Sobic002G428800 Sobic004G302150--Sobic002G428800 Sobic003G378400 Sobic003G378400 Sobic004G302150--Sobic003G378400 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic004G302150--Sobic010G102366 Sobic010G089800 Sobic010G089800 Sobic004G302150--Sobic010G089800 Sobic009G094700 Sobic009G094700 Sobic004G302150--Sobic009G094700 Sobic001G486700 Sobic001G486700 Sobic004G302150--Sobic001G486700 Sobic005G140500 Sobic005G140500 Sobic004G302150--Sobic005G140500 Sobic007G073700 Sobic007G073700 Sobic004G190700--Sobic007G073700 Sobic007G029100 Sobic007G029100 Sobic004G190700--Sobic007G029100 Sobic004G190700--Sobic002G428800 Sobic003G053900 Sobic003G053900 Sobic004G190700--Sobic003G053900 Sobic004G190700--Sobic004G302150 Sobic003G134000 Sobic003G134000 Sobic004G190700--Sobic003G134000 Sobic001G501300 Sobic001G501300 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Octagon: transcription factors


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