Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G170700.2,Sobic.007G170700.1
Synonym Sb07g024280, FAR1
Functional annotation male sterility protein 2, putative, expressed
UniProt A0A1B6PI91 , A0A1B6PI86
Pfam PF03015 PF07993
Panther DB PTHR11011 PTHR11011:SF39
NCBI CDD KOG1221; Acyl-CoA reductase
KEGG Orthology K13356; alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G22500 : fatty acid reductase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g44360.1 : male sterility protein 2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005611 , Zm00025a030564
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7B02G176400 , TraesCS7B02G176400 , TraesCS7B02G176400 , TraesCS7D02G278300 , TraesCS7D02G278300 , TraesCS7D02G385300 , TraesCS7A02G278500 , TraesCS7A02G389300
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cDNA sequences
Sobic.007G170700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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12 Sobic.006G165600 - -
13 Sobic.008G189500 similar to Secretory acid phosphatase - Pfam Calcineurin-like phosphoesterase(PubMedID : 24655390)@similar to Secretory acid phosphatase - Pfam Calcineurin -like phosphoesterase(PubMedID : 24655390)@Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
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18 Sobic.002G083200 metal cation transporter, putative, expressed K14709: SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3
19 Sobic.004G301200 kinesin motor domain containing protein, expressed K11498: centromeric protein E
20 Sobic.007G162300 OsGrx_S12 - glutaredoxin subgroup I, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3


Gene co-expression network
sample Sobic007G170700 Sobic007G170700 Sobic005G183500 Sobic005G183500 Sobic007G170700--Sobic005G183500 Sobic001G486700 Sobic001G486700 Sobic007G170700--Sobic001G486700 Sobic007G123800 Sobic007G123800 Sobic007G170700--Sobic007G123800 Sobic007G208300 Sobic007G208300 Sobic007G170700--Sobic007G208300 Sobic004G043900 Sobic004G043900 Sobic007G170700--Sobic004G043900 Sobic003G110100 Sobic003G110100 Sobic007G170700--Sobic003G110100 Sobic009G073100 Sobic009G073100 Sobic007G170700--Sobic009G073100 Sobic007G132500 Sobic007G132500 Sobic007G170700--Sobic007G132500 Sobic003G260900 Sobic003G260900 Sobic007G170700--Sobic003G260900 Sobic001G221300 Sobic001G221300 Sobic005G183500--Sobic001G221300 Sobic002G271700 Sobic002G271700 Sobic005G183500--Sobic002G271700 Sobic003G187000 Sobic003G187000 Sobic005G183500--Sobic003G187000 Sobic008G189500 Sobic008G189500 Sobic005G183500--Sobic008G189500 Sobic003G150600 Sobic003G150600 Sobic005G183500--Sobic003G150600 Sobic005G029400 Sobic005G029400 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Octagon: transcription factors


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