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Transcriptome id Sobic.007G181300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PIE1
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cDNA sequences
Sobic.007G181300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G170700 male sterility protein 2, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
2 Sobic.004G096801 - -
3 Sobic.007G162300 OsGrx_S12 - glutaredoxin subgroup I, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
4 Sobic.006G165600 - -
5 Sobic.002G279700 3-dehydroquinate synthase, putative, expressed K01735: 3-dehydroquinate synthase
6 Sobic.008G172700 OsDegp15 - Putative Deg protease homologue, expressed -
7 Sobic.002G288300 Chorophyll a/b binding protein 1(PubMedID : 26186930)@chlorophyll A-B binding protein, putative, expressed K08912: light-harvesting complex II chlorophyll a/b binding protein 1
8 Sobic.005G184050 - -
9 Sobic.002G267900 expressed protein -
10 Sobic.005G004500 ferritin-1, chloroplast precursor, putative, expressed K00522: ferritin heavy chain
11 Sobic.004G097200 Mpv17 / PMP22 family domain containing protein, expressed K13347: PXMP2, peroxisomal membrane protein 2
12 Sobic.001G202600 shikimate/quinate 5-dehydrogenase, putative, expressed K02492: glutamyl-tRNA reductase
13 Sobic.004G326500 PAP fibrillin family domain containing protein, expressed -
14 Sobic.006G125000 expressed protein -
15 Sobic.001G023700 expressed protein -
16 Sobic.006G013800 CBS domain containing membrane protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G065200 pentatricopeptide, putative, expressed -
18 Sobic.004G164100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
19 Sobic.010G062500 protein phosphatase 2C, putative, expressed K14803: protein phosphatase PTC2/3
20 Sobic.002G198000 CRR6, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G181300 Sobic007G181300 Sobic007G170700 Sobic007G170700 Sobic007G181300--Sobic007G170700 Sobic004G096801 Sobic004G096801 Sobic007G181300--Sobic004G096801 Sobic007G162300 Sobic007G162300 Sobic007G181300--Sobic007G162300 Sobic006G165600 Sobic006G165600 Sobic007G181300--Sobic006G165600 Sobic002G279700 Sobic002G279700 Sobic007G181300--Sobic002G279700 Sobic008G172700 Sobic008G172700 Sobic007G181300--Sobic008G172700 Sobic002G288300 Sobic002G288300 Sobic007G181300--Sobic002G288300 Sobic005G184050 Sobic005G184050 Sobic007G181300--Sobic005G184050 Sobic002G267900 Sobic002G267900 Sobic007G181300--Sobic002G267900 Sobic005G183500 Sobic005G183500 Sobic007G170700--Sobic005G183500 Sobic001G486700 Sobic001G486700 Sobic007G170700--Sobic001G486700 Sobic007G123800 Sobic007G123800 Sobic007G170700--Sobic007G123800 Sobic007G208300 Sobic007G208300 Sobic007G170700--Sobic007G208300 Sobic004G043900 Sobic004G043900 Sobic007G170700--Sobic004G043900 Sobic003G110100 Sobic003G110100 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Octagon: transcription factors


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