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Transcriptome id Sobic.003G025800.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q0Z2
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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1 Sobic.002G353300 Geranilgeranil pyrophosphate synthetase 1 GGPS1 (Os)(PubMedID : 27208977)@polyprenyl synthetase, putative, expressed K13789: geranylgeranyl diphosphate synthase, type II
2 Sobic.002G297900 CDGSH iron sulfur domain-containing protein 1, putative, expressed -
3 Sobic.007G171800 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11294: NCL, nucleolin
4 Sobic.002G251400 expressed protein -
5 Sobic.002G424100 parvulin-type peptidyl prolyl cis/trans isomerase, putative, expressed -
6 Sobic.001G175700 expressed protein -
7 Sobic.004G019300 terpene synthase, putative, expressed K15086: (3S)-linalool synthase
8 Sobic.001G065500 ZOS3-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
9 Sobic.004G314800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
10 Sobic.009G131800 peptide methionine sulfoxide reductase msrB, putative, expressed K07305: peptide-methionine (R)-S-oxide reductase
11 Sobic.001G489800 HNH endonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G013700 PPR2, putative, expressed -
13 Sobic.003G328200 thylakoid lumenal 20 kDa protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G208300 peptidase, putative, expressed K14677: aminoacylase
15 Sobic.003G187000 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
16 Sobic.004G024600 expressed protein -
17 Sobic.001G281500 OsClp11 - Putative Clp protease homologue, expressed K01358: clpP, ATP-dependent Clp protease, protease subunit
18 Sobic.003G225100 uroporphyrinogen decarboxylase, putative, expressed K01599: hemE, uroporphyrinogen decarboxylase
19 Sobic.008G096800 nnrU, putative, expressed K15744: zeta-carotene isomerase
20 Sobic.004G020300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G025800 Sobic003G025800 Sobic002G353300 Sobic002G353300 Sobic003G025800--Sobic002G353300 Sobic002G297900 Sobic002G297900 Sobic003G025800--Sobic002G297900 Sobic007G171800 Sobic007G171800 Sobic003G025800--Sobic007G171800 Sobic002G251400 Sobic002G251400 Sobic003G025800--Sobic002G251400 Sobic002G424100 Sobic002G424100 Sobic003G025800--Sobic002G424100 Sobic001G175700 Sobic001G175700 Sobic003G025800--Sobic001G175700 Sobic004G019300 Sobic004G019300 Sobic003G025800--Sobic004G019300 Sobic001G065500 Sobic001G065500 Sobic003G025800--Sobic001G065500 Sobic004G314800 Sobic004G314800 Sobic003G025800--Sobic004G314800 Sobic001G122400 Sobic001G122400 Sobic002G353300--Sobic001G122400 Sobic003G324700 Sobic003G324700 Sobic002G353300--Sobic003G324700 Sobic003G386300 Sobic003G386300 Sobic002G353300--Sobic003G386300 Sobic004G311100 Sobic004G311100 Sobic002G353300--Sobic004G311100 Sobic004G335800 Sobic004G335800 Sobic002G353300--Sobic004G335800 Sobic001G291900 Sobic001G291900 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Octagon: transcription factors


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