Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G020300.1
Synonym Sb04g001870
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XT25
Pfam PF13301
Panther DB PTHR34679 PTHR34679:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G61870 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g03010.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034936
Brachypodium KQJ93011
Barley HORVU6Hr1G011990.2
Wheat TraesCS6B02G089400 , TraesCS6A02G066100 , TraesCSU02G117800
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.004G020300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G131800 peptide methionine sulfoxide reductase msrB, putative, expressed K07305: peptide-methionine (R)-S-oxide reductase
2 Sobic.009G210200 Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase-related protein(PubMedID : 26465154)@Divergent PAP2 family domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G272100 expressed protein -
4 Sobic.001G405700 - -
5 Sobic.002G267900 expressed protein -
6 Sobic.008G172700 OsDegp15 - Putative Deg protease homologue, expressed -
7 Sobic.004G343000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.006G021600 uncharacterized membrane protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G022300 SOUL heme-binding protein, putative, expressed -
10 Sobic.008G171300 methyltransferase domain containing protein, putative, expressed K12502: VTE3, MPBQ/MSBQ methyltransferase
11 Sobic.005G194100 expressed protein -
12 Sobic.006G067400 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G326500 PAP fibrillin family domain containing protein, expressed -
14 Sobic.010G277600 - -
15 Sobic.001G104800 expressed protein -
16 Sobic.009G030900 bundle sheath defective protein 2, putative, expressed -
17 Sobic.002G351600 prenyltransferase, putative, expressed K12501: homogentisate solanesyltransferase
18 Sobic.004G055000 peptidase, cysteine peptidase active site, putative, expressed -
19 Sobic.002G227700 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
20 Sobic.009G238300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G020300 Sobic004G020300 Sobic009G131800 Sobic009G131800 Sobic004G020300--Sobic009G131800 Sobic009G210200 Sobic009G210200 Sobic004G020300--Sobic009G210200 Sobic002G272100 Sobic002G272100 Sobic004G020300--Sobic002G272100 Sobic001G405700 Sobic001G405700 Sobic004G020300--Sobic001G405700 Sobic002G267900 Sobic002G267900 Sobic004G020300--Sobic002G267900 Sobic008G172700 Sobic008G172700 Sobic004G020300--Sobic008G172700 Sobic004G343000 Sobic004G343000 Sobic004G020300--Sobic004G343000 Sobic006G021600 Sobic006G021600 Sobic004G020300--Sobic006G021600 Sobic003G022300 Sobic003G022300 Sobic004G020300--Sobic003G022300 Sobic001G175700 Sobic001G175700 Sobic009G131800--Sobic001G175700 Sobic004G055000 Sobic004G055000 Sobic009G131800--Sobic004G055000 Sobic009G131800--Sobic002G272100 Sobic009G131800--Sobic004G020300 Sobic009G131800--Sobic004G343000 Sobic009G131800--Sobic001G405700 Sobic009G131800--Sobic008G172700 Sobic003G408000 Sobic003G408000 Sobic009G131800--Sobic003G408000 Sobic009G131800--Sobic002G267900 Sobic008G064500 Sobic008G064500 Sobic009G210200--Sobic008G064500 Sobic004G303200 Sobic004G303200 Sobic009G210200--Sobic004G303200 Sobic009G210200--Sobic004G020300 Sobic006G067400 Sobic006G067400 Sobic009G210200--Sobic006G067400 Sobic010G160700 Sobic010G160700 Sobic009G210200--Sobic010G160700 Sobic008G171300 Sobic008G171300 Sobic009G210200--Sobic008G171300 Sobic002G233700 Sobic002G233700 Sobic009G210200--Sobic002G233700 Sobic006G235350 Sobic006G235350 Sobic009G210200--Sobic006G235350 Sobic009G210200--Sobic002G272100 Sobic002G401800 Sobic002G401800 Sobic002G272100--Sobic002G401800 Sobic008G073100 Sobic008G073100 Sobic002G272100--Sobic008G073100 Sobic001G368500 Sobic001G368500 Sobic002G272100--Sobic001G368500 Sobic008G050400 Sobic008G050400 Sobic002G272100--Sobic008G050400 Sobic008G039600 Sobic008G039600 Sobic002G272100--Sobic008G039600 Sobic002G351600 Sobic002G351600 Sobic002G272100--Sobic002G351600 Sobic002G272100--Sobic002G267900 Sobic001G083100 Sobic001G083100 Sobic002G272100--Sobic001G083100 Sobic005G110400 Sobic005G110400 Sobic002G272100--Sobic005G110400 Sobic005G194100 Sobic005G194100 Sobic001G405700--Sobic005G194100 Sobic007G052400 Sobic007G052400 Sobic001G405700--Sobic007G052400 Sobic010G005500 Sobic010G005500 Sobic001G405700--Sobic010G005500 Sobic009G030900 Sobic009G030900 Sobic001G405700--Sobic009G030900 Sobic001G405700--Sobic001G175700 Sobic004G012900 Sobic004G012900 Sobic001G405700--Sobic004G012900 Sobic001G405700--Sobic008G171300 Sobic004G239100 Sobic004G239100 Sobic001G405700--Sobic004G239100 Sobic002G227700 Sobic002G227700 Sobic001G405700--Sobic002G227700 Sobic002G267900--Sobic008G172700 Sobic002G267900--Sobic004G055000 Sobic002G267900--Sobic002G272100 Sobic010G277600 Sobic010G277600 Sobic002G267900--Sobic010G277600 Sobic009G183700 Sobic009G183700 Sobic002G267900--Sobic009G183700 Sobic004G326500 Sobic004G326500 Sobic002G267900--Sobic004G326500 Sobic002G267900--Sobic002G401800 Sobic008G119300 Sobic008G119300 Sobic002G267900--Sobic008G119300 Sobic002G198000 Sobic002G198000 Sobic002G267900--Sobic002G198000 Sobic008G172700--Sobic002G267900 Sobic001G350000 Sobic001G350000 Sobic008G172700--Sobic001G350000 Sobic008G172700--Sobic004G239100 Sobic008G172700--Sobic004G055000 Sobic003G378600 Sobic003G378600 Sobic008G172700--Sobic003G378600 Sobic008G172700--Sobic010G277600 Sobic008G172700--Sobic009G183700 Sobic008G172700--Sobic008G171300 Sobic004G359600 Sobic004G359600 Sobic008G172700--Sobic004G359600 Sobic004G343000--Sobic009G131800 Sobic004G343000--Sobic004G326500 Sobic004G343000--Sobic004G020300 Sobic004G343000--Sobic004G055000 Sobic003G275200 Sobic003G275200 Sobic004G343000--Sobic003G275200 Sobic004G164100 Sobic004G164100 Sobic004G343000--Sobic004G164100 Sobic003G014100 Sobic003G014100 Sobic004G343000--Sobic003G014100 Sobic004G343000--Sobic001G405700 Sobic004G343000--Sobic002G198000 Sobic006G021600--Sobic001G368500 Sobic003G432500 Sobic003G432500 Sobic006G021600--Sobic003G432500 Sobic002G274200 Sobic002G274200 Sobic006G021600--Sobic002G274200 Sobic001G469933 Sobic001G469933 Sobic006G021600--Sobic001G469933 Sobic006G021600--Sobic002G272100 Sobic003G077400 Sobic003G077400 Sobic006G021600--Sobic003G077400 Sobic003G324700 Sobic003G324700 Sobic006G021600--Sobic003G324700 Sobic006G021600--Sobic008G073100 Sobic001G122400 Sobic001G122400 Sobic006G021600--Sobic001G122400 Sobic003G022300--Sobic002G227700 Sobic003G022300--Sobic004G020300 Sobic001G221300 Sobic001G221300 Sobic003G022300--Sobic001G221300 Sobic001G295300 Sobic001G295300 Sobic003G022300--Sobic001G295300 Sobic003G022300--Sobic009G210200 Sobic001G033100 Sobic001G033100 Sobic003G022300--Sobic001G033100 Sobic003G022300--Sobic006G067400 Sobic004G343900 Sobic004G343900 Sobic003G022300--Sobic004G343900 Sobic007G004700 Sobic007G004700 Sobic003G022300--Sobic007G004700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.