Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G131800.1
Synonym MSRB2, Sb09g019820
Functional annotation peptide methionine sulfoxide reductase msrB, putative, expressed
UniProt C5YXN9
Pfam PF01641
Panther DB PTHR10173 PTHR10173:SF19
NCBI CDD KOG0856; Predicted pilin-like transcription factor
KEGG Orthology K07305; peptide-methionine (R)-S-oxide reductase
Gene Ontology GO:0016671; oxidoreductase activity, acting on a sulfur group of donors, disulfide as acceptor GO:0006979response to oxidative stress


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G21860 : methionine sulfoxide reductase B 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g33510.1 : peptide methionine sulfoxide reductase msrB, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037506 , Zm00025a037510
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G061210.3 , HORVU1Hr1G061210.2 , HORVU1Hr1G061210.1
Wheat TraesCS1B02G265600 , TraesCS1A02G252400 , TraesCS1D02G252100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Gene co-expression network
sample Sobic009G131800 Sobic009G131800 Sobic001G175700 Sobic001G175700 Sobic009G131800--Sobic001G175700 Sobic004G055000 Sobic004G055000 Sobic009G131800--Sobic004G055000 Sobic002G272100 Sobic002G272100 Sobic009G131800--Sobic002G272100 Sobic004G020300 Sobic004G020300 Sobic009G131800--Sobic004G020300 Sobic004G343000 Sobic004G343000 Sobic009G131800--Sobic004G343000 Sobic001G405700 Sobic001G405700 Sobic009G131800--Sobic001G405700 Sobic008G172700 Sobic008G172700 Sobic009G131800--Sobic008G172700 Sobic003G408000 Sobic003G408000 Sobic009G131800--Sobic003G408000 Sobic002G267900 Sobic002G267900 Sobic009G131800--Sobic002G267900 Sobic006G050400 Sobic006G050400 Sobic001G175700--Sobic006G050400 Sobic001G175700--Sobic009G131800 Sobic004G012900 Sobic004G012900 Sobic001G175700--Sobic004G012900 Sobic001G175700--Sobic001G405700 Sobic002G233700 Sobic002G233700 Sobic001G175700--Sobic002G233700 Sobic003G342200 Sobic003G342200 Sobic001G175700--Sobic003G342200 Sobic001G083100 Sobic001G083100 Sobic001G175700--Sobic001G083100 Sobic004G253400 Sobic004G253400 Sobic001G175700--Sobic004G253400 Sobic006G155500 Sobic006G155500 Sobic001G175700--Sobic006G155500 Sobic003G275200 Sobic003G275200 Sobic004G055000--Sobic003G275200 Sobic004G154800 Sobic004G154800 Sobic004G055000--Sobic004G154800 Sobic004G055000--Sobic008G172700 Sobic004G055000--Sobic002G267900 Sobic004G055000--Sobic009G131800 Sobic004G326500 Sobic004G326500 Sobic004G055000--Sobic004G326500 Sobic002G351600 Sobic002G351600 Sobic004G055000--Sobic002G351600 Sobic006G108200 Sobic006G108200 Sobic004G055000--Sobic006G108200 Sobic004G055000--Sobic002G272100 Sobic002G401800 Sobic002G401800 Sobic002G272100--Sobic002G401800 Sobic008G073100 Sobic008G073100 Sobic002G272100--Sobic008G073100 Sobic001G368500 Sobic001G368500 Sobic002G272100--Sobic001G368500 Sobic008G050400 Sobic008G050400 Sobic002G272100--Sobic008G050400 Sobic008G039600 Sobic008G039600 Sobic002G272100--Sobic008G039600 Sobic002G272100--Sobic002G351600 Sobic002G272100--Sobic002G267900 Sobic002G272100--Sobic001G083100 Sobic005G110400 Sobic005G110400 Sobic002G272100--Sobic005G110400 Sobic004G020300--Sobic009G131800 Sobic009G210200 Sobic009G210200 Sobic004G020300--Sobic009G210200 Sobic004G020300--Sobic002G272100 Sobic004G020300--Sobic001G405700 Sobic004G020300--Sobic002G267900 Sobic004G020300--Sobic008G172700 Sobic004G020300--Sobic004G343000 Sobic006G021600 Sobic006G021600 Sobic004G020300--Sobic006G021600 Sobic003G022300 Sobic003G022300 Sobic004G020300--Sobic003G022300 Sobic004G343000--Sobic009G131800 Sobic004G343000--Sobic004G326500 Sobic004G343000--Sobic004G020300 Sobic004G343000--Sobic004G055000 Sobic004G343000--Sobic003G275200 Sobic004G164100 Sobic004G164100 Sobic004G343000--Sobic004G164100 Sobic003G014100 Sobic003G014100 Sobic004G343000--Sobic003G014100 Sobic004G343000--Sobic001G405700 Sobic002G198000 Sobic002G198000 Sobic004G343000--Sobic002G198000 Sobic005G194100 Sobic005G194100 Sobic001G405700--Sobic005G194100 Sobic007G052400 Sobic007G052400 Sobic001G405700--Sobic007G052400 Sobic010G005500 Sobic010G005500 Sobic001G405700--Sobic010G005500 Sobic009G030900 Sobic009G030900 Sobic001G405700--Sobic009G030900 Sobic001G405700--Sobic001G175700 Sobic001G405700--Sobic004G012900 Sobic008G171300 Sobic008G171300 Sobic001G405700--Sobic008G171300 Sobic004G239100 Sobic004G239100 Sobic001G405700--Sobic004G239100 Sobic002G227700 Sobic002G227700 Sobic001G405700--Sobic002G227700 Sobic008G172700--Sobic002G267900 Sobic001G350000 Sobic001G350000 Sobic008G172700--Sobic001G350000 Sobic008G172700--Sobic004G239100 Sobic008G172700--Sobic004G055000 Sobic003G378600 Sobic003G378600 Sobic008G172700--Sobic003G378600 Sobic010G277600 Sobic010G277600 Sobic008G172700--Sobic010G277600 Sobic009G183700 Sobic009G183700 Sobic008G172700--Sobic009G183700 Sobic008G172700--Sobic008G171300 Sobic004G359600 Sobic004G359600 Sobic008G172700--Sobic004G359600 Sobic003G408000--Sobic001G405700 Sobic003G408000--Sobic004G012900 Sobic003G419900 Sobic003G419900 Sobic003G408000--Sobic003G419900 Sobic003G408000--Sobic009G131800 Sobic003G408000--Sobic008G039600 Sobic003G077400 Sobic003G077400 Sobic003G408000--Sobic003G077400 Sobic002G405100 Sobic002G405100 Sobic003G408000--Sobic002G405100 Sobic009G055800 Sobic009G055800 Sobic003G408000--Sobic009G055800 Sobic003G408000--Sobic002G401800 Sobic002G267900--Sobic008G172700 Sobic002G267900--Sobic004G055000 Sobic002G267900--Sobic002G272100 Sobic002G267900--Sobic010G277600 Sobic002G267900--Sobic009G183700 Sobic002G267900--Sobic004G326500 Sobic002G267900--Sobic002G401800 Sobic008G119300 Sobic008G119300 Sobic002G267900--Sobic008G119300 Sobic002G267900--Sobic002G198000
Octagon: transcription factors


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