Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G175700.1
Synonym Sb01g015270
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WTA4
Pfam -
Panther DB PTHR36343
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G05310 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g39830.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007178
Brachypodium KQK14287
Barley HORVU5Hr1G111330.2 , HORVU5Hr1G111330.3 , HORVU5Hr1G111330.4 , HORVU5Hr1G111330.5
Wheat TraesCS5D02G479700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G175700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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10 Sobic.008G119300 - -
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20 Sobic.007G052400 rubredoxin family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G175700 Sobic001G175700 Sobic006G050400 Sobic006G050400 Sobic001G175700--Sobic006G050400 Sobic009G131800 Sobic009G131800 Sobic001G175700--Sobic009G131800 Sobic004G012900 Sobic004G012900 Sobic001G175700--Sobic004G012900 Sobic001G405700 Sobic001G405700 Sobic001G175700--Sobic001G405700 Sobic002G233700 Sobic002G233700 Sobic001G175700--Sobic002G233700 Sobic003G342200 Sobic003G342200 Sobic001G175700--Sobic003G342200 Sobic001G083100 Sobic001G083100 Sobic001G175700--Sobic001G083100 Sobic004G253400 Sobic004G253400 Sobic001G175700--Sobic004G253400 Sobic006G155500 Sobic006G155500 Sobic001G175700--Sobic006G155500 Sobic006G050400--Sobic003G342200 Sobic006G050400--Sobic006G155500 Sobic006G050400--Sobic001G175700 Sobic002G112400 Sobic002G112400 Sobic006G050400--Sobic002G112400 Sobic003G253300 Sobic003G253300 Sobic006G050400--Sobic003G253300 Sobic001G005200 Sobic001G005200 Sobic006G050400--Sobic001G005200 Sobic009G059300 Sobic009G059300 Sobic006G050400--Sobic009G059300 Sobic002G102200 Sobic002G102200 Sobic006G050400--Sobic002G102200 Sobic001G122300 Sobic001G122300 Sobic006G050400--Sobic001G122300 Sobic009G131800--Sobic001G175700 Sobic004G055000 Sobic004G055000 Sobic009G131800--Sobic004G055000 Sobic002G272100 Sobic002G272100 Sobic009G131800--Sobic002G272100 Sobic004G020300 Sobic004G020300 Sobic009G131800--Sobic004G020300 Sobic004G343000 Sobic004G343000 Sobic009G131800--Sobic004G343000 Sobic009G131800--Sobic001G405700 Sobic008G172700 Sobic008G172700 Sobic009G131800--Sobic008G172700 Sobic003G408000 Sobic003G408000 Sobic009G131800--Sobic003G408000 Sobic002G267900 Sobic002G267900 Sobic009G131800--Sobic002G267900 Sobic007G052400 Sobic007G052400 Sobic004G012900--Sobic007G052400 Sobic004G012900--Sobic002G233700 Sobic002G401800 Sobic002G401800 Sobic004G012900--Sobic002G401800 Sobic010G005500 Sobic010G005500 Sobic004G012900--Sobic010G005500 Sobic003G378600 Sobic003G378600 Sobic004G012900--Sobic003G378600 Sobic004G012900--Sobic009G059300 Sobic010G277600 Sobic010G277600 Sobic004G012900--Sobic010G277600 Sobic003G387100 Sobic003G387100 Sobic004G012900--Sobic003G387100 Sobic008G171300 Sobic008G171300 Sobic004G012900--Sobic008G171300 Sobic005G194100 Sobic005G194100 Sobic001G405700--Sobic005G194100 Sobic001G405700--Sobic007G052400 Sobic001G405700--Sobic010G005500 Sobic009G030900 Sobic009G030900 Sobic001G405700--Sobic009G030900 Sobic001G405700--Sobic001G175700 Sobic001G405700--Sobic004G012900 Sobic001G405700--Sobic008G171300 Sobic004G239100 Sobic004G239100 Sobic001G405700--Sobic004G239100 Sobic002G227700 Sobic002G227700 Sobic001G405700--Sobic002G227700 Sobic002G233700--Sobic008G171300 Sobic002G233700--Sobic004G012900 Sobic004G303200 Sobic004G303200 Sobic002G233700--Sobic004G303200 Sobic002G233700--Sobic007G052400 Sobic007G225500 Sobic007G225500 Sobic002G233700--Sobic007G225500 Sobic002G233700--Sobic001G005200 Sobic003G002300 Sobic003G002300 Sobic002G233700--Sobic003G002300 Sobic002G233700--Sobic002G401800 Sobic002G233700--Sobic003G378600 Sobic003G342200--Sobic006G050400 Sobic003G342200--Sobic003G253300 Sobic003G342200--Sobic001G175700 Sobic003G342200--Sobic006G155500 Sobic003G342200--Sobic001G122300 Sobic003G342200--Sobic003G378600 Sobic003G342200--Sobic002G112400 Sobic006G125000 Sobic006G125000 Sobic003G342200--Sobic006G125000 Sobic003G342200--Sobic002G102200 Sobic005G002900 Sobic005G002900 Sobic001G083100--Sobic005G002900 Sobic009G148500 Sobic009G148500 Sobic001G083100--Sobic009G148500 Sobic008G039600 Sobic008G039600 Sobic001G083100--Sobic008G039600 Sobic001G469933 Sobic001G469933 Sobic001G083100--Sobic001G469933 Sobic006G055800 Sobic006G055800 Sobic001G083100--Sobic006G055800 Sobic001G083100--Sobic002G272100 Sobic003G372900 Sobic003G372900 Sobic001G083100--Sobic003G372900 Sobic001G054100 Sobic001G054100 Sobic001G083100--Sobic001G054100 Sobic008G073100 Sobic008G073100 Sobic001G083100--Sobic008G073100 Sobic001G006000 Sobic001G006000 Sobic004G253400--Sobic001G006000 Sobic004G253400--Sobic001G175700 Sobic004G253400--Sobic006G125000 Sobic004G253400--Sobic003G342200 Sobic004G253400--Sobic003G253300 Sobic004G253400--Sobic003G378600 Sobic004G179200 Sobic004G179200 Sobic004G253400--Sobic004G179200 Sobic004G253400--Sobic004G012900 Sobic006G110900 Sobic006G110900 Sobic004G253400--Sobic006G110900 Sobic001G118400 Sobic001G118400 Sobic006G155500--Sobic001G118400 Sobic006G155500--Sobic006G050400 Sobic003G328100 Sobic003G328100 Sobic006G155500--Sobic003G328100 Sobic006G155500--Sobic003G253300 Sobic001G286600 Sobic001G286600 Sobic006G155500--Sobic001G286600 Sobic006G155500--Sobic006G110900 Sobic002G061900 Sobic002G061900 Sobic006G155500--Sobic002G061900 Sobic003G070900 Sobic003G070900 Sobic006G155500--Sobic003G070900 Sobic006G097500 Sobic006G097500 Sobic006G155500--Sobic006G097500
Octagon: transcription factors


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