Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G214400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YKP6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G124300 - -
2 Sobic.002G413900 - -
3 Sobic.009G107020 - -
4 Sobic.001G260300 - -
5 Sobic.003G128550 - -
6 Sobic.004G324600 - -
7 Sobic.005G115400 - -
8 Sobic.006G248350 - -
9 Sobic.009G017666 - -
10 Sobic.008G072700 expressed protein -
11 Sobic.002G337001 - -
12 Sobic.006G165600 - -
13 Sobic.010G214500 purple acid phosphatase, putative, expressed -
14 Sobic.002G115100 - -
15 Sobic.004G144700 ABC transporter family protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G237000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@sulfate transporter, putative, expressed -
17 Sobic.002G286300 - -
18 Sobic.002G398200 RGH1A, putative, expressed -
19 Sobic.009G070300 - -
20 Sobic.008G015100 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.8 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family


Gene co-expression network
sample Sobic010G214400 Sobic010G214400 Sobic005G124300 Sobic005G124300 Sobic010G214400--Sobic005G124300 Sobic002G413900 Sobic002G413900 Sobic010G214400--Sobic002G413900 Sobic009G107020 Sobic009G107020 Sobic010G214400--Sobic009G107020 Sobic001G260300 Sobic001G260300 Sobic010G214400--Sobic001G260300 Sobic003G128550 Sobic003G128550 Sobic010G214400--Sobic003G128550 Sobic004G324600 Sobic004G324600 Sobic010G214400--Sobic004G324600 Sobic005G115400 Sobic005G115400 Sobic010G214400--Sobic005G115400 Sobic006G248350 Sobic006G248350 Sobic010G214400--Sobic006G248350 Sobic009G017666 Sobic009G017666 Sobic010G214400--Sobic009G017666 Sobic005G124300--Sobic010G214400 Sobic005G124300--Sobic009G107020 Sobic005G124300--Sobic005G115400 Sobic005G124300--Sobic001G260300 Sobic010G115900 Sobic010G115900 Sobic005G124300--Sobic010G115900 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic005G124300--Sobic005G128800 Sobic005G124300--Sobic002G413900 Sobic009G070300 Sobic009G070300 Sobic005G124300--Sobic009G070300 Sobic005G124300--Sobic003G128550 Sobic002G413900--Sobic010G214400 Sobic002G413900--Sobic005G124300 Sobic002G413900--Sobic003G128550 Sobic008G072700 Sobic008G072700 Sobic002G413900--Sobic008G072700 Sobic002G413900--Sobic006G248350 Sobic002G413900--Sobic010G115900 Sobic002G413900--Sobic009G107020 Sobic002G413900--Sobic009G017666 Sobic003G237000 Sobic003G237000 Sobic002G413900--Sobic003G237000 Sobic009G107020--Sobic003G128550 Sobic009G107020--Sobic005G115400 Sobic009G074250 Sobic009G074250 Sobic009G107020--Sobic009G074250 Sobic009G107020--Sobic005G124300 Sobic009G107020--Sobic010G115900 Sobic009G107020--Sobic010G214400 Sobic004G144700 Sobic004G144700 Sobic009G107020--Sobic004G144700 Sobic002G337001 Sobic002G337001 Sobic009G107020--Sobic002G337001 Sobic009G214800 Sobic009G214800 Sobic009G107020--Sobic009G214800 Sobic001G312400 Sobic001G312400 Sobic001G260300--Sobic001G312400 Sobic002G035300 Sobic002G035300 Sobic001G260300--Sobic002G035300 Sobic001G262800 Sobic001G262800 Sobic001G260300--Sobic001G262800 Sobic001G260300--Sobic005G124300 Sobic001G260300--Sobic010G214400 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic001G260300--Sobic001G091200 Sobic002G398200 Sobic002G398200 Sobic001G260300--Sobic002G398200 Sobic010G214500 Sobic010G214500 Sobic001G260300--Sobic010G214500 Sobic003G439900 Sobic003G439900 Sobic001G260300--Sobic003G439900 Sobic003G128550--Sobic009G107020 Sobic003G128550--Sobic009G074250 Sobic003G128550--Sobic005G115400 Sobic001G267000 Sobic001G267000 Sobic003G128550--Sobic001G267000 Sobic003G128550--Sobic010G115900 Sobic003G128550--Sobic009G214800 Sobic003G128550--Sobic010G214400 Sobic003G128550--Sobic002G413900 Sobic003G128550--Sobic009G070300 Sobic004G324600--Sobic010G214400 Sobic004G324600--Sobic009G017666 Sobic004G324600--Sobic002G398200 Sobic002G115100 Sobic002G115100 Sobic004G324600--Sobic002G115100 Sobic006G165600 Sobic006G165600 Sobic004G324600--Sobic006G165600 Sobic003G306700 Sobic003G306700 Sobic004G324600--Sobic003G306700 Sobic007G132500 Sobic007G132500 Sobic004G324600--Sobic007G132500 Sobic004G268500 Sobic004G268500 Sobic004G324600--Sobic004G268500 Sobic003G096500 Sobic003G096500 Sobic004G324600--Sobic003G096500 Sobic005G115400--Sobic009G070300 Sobic005G115400--Sobic010G115900 Sobic005G115400--Sobic009G214800 Sobic005G115400--Sobic009G107020 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic005G115400--Sobic008G120132 Sobic005G115400--Sobic003G128550 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic005G115400--Sobic010G143000 Sobic001G467700 Sobic001G467700 Sobic005G115400--Sobic001G467700 Sobic005G115400--Sobic005G124300 Sobic006G248350--Sobic001G312400 Sobic006G248350--Sobic010G214400 Sobic006G248350--Sobic006G165600 Sobic006G248350--Sobic003G128550 Sobic009G013300 Sobic009G013300 Sobic006G248350--Sobic009G013300 Sobic006G248350--Sobic005G124300 Sobic006G248350--Sobic002G413900 Sobic006G248350--Sobic005G115400 Sobic006G248350--Sobic001G260300 Sobic003G037300 Sobic003G037300 Sobic009G017666--Sobic003G037300 Sobic004G300000 Sobic004G300000 Sobic009G017666--Sobic004G300000 Sobic006G226601 Sobic006G226601 Sobic009G017666--Sobic006G226601 Sobic004G006400 Sobic004G006400 Sobic009G017666--Sobic004G006400 Sobic010G035500 Sobic010G035500 Sobic009G017666--Sobic010G035500 Sobic009G017666--Sobic003G306700 Sobic006G110900 Sobic006G110900 Sobic009G017666--Sobic006G110900 Sobic001G029200 Sobic001G029200 Sobic009G017666--Sobic001G029200 Sobic004G224500 Sobic004G224500 Sobic009G017666--Sobic004G224500
Octagon: transcription factors


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