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Transcriptome id Sobic.002G286300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5X703
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G137100 - -
2 Sobic.010G011700 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed -
3 Sobic.005G171300 expressed protein -
4 Sobic.003G207500 signal peptide peptidase domain containing protein, expressed -
5 Sobic.008G101400 - -
6 Sobic.009G030800 expressed protein -
7 Sobic.004G111300 - -
8 Sobic.005G203300 tropinone reductase 2, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
9 Sobic.010G102366 - -
10 Sobic.010G135250 - -
11 Sobic.010G126600 expressed protein -
12 Sobic.004G201700 glycosyl transferase family 17 protein, putative, expressed K00737: beta-1,4-mannosyl-glycoprotein beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase
13 Sobic.002G412100 flowering promoting factor-like 1, putative, expressed -
14 Sobic.003G435800 Pheophorbide a oxygenase family protein with Rieske [2Fe-2S] domain(PubMedID : 26465154)@Pheophorbide a oxygenase family protein with Rieske [2Fe-2S] domain(PubMedID : 26465154)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@chlorophyllide a oxygenase, chloroplast precursor, putative, expressed K13600: chlorophyllide a oxygenase
15 Sobic.002G030500 Reticulon family protein(PubMedID : 26465154)@reticulon domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.010G214400 - -
17 Sobic.001G151400 nicotianamine synthase, putative, expressed K05953: nicotianamine synthase
18 Sobic.009G017666 - -
19 Sobic.010G163400 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, chloroplast precursor, putative, expressed -
20 Sobic.003G179350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G286300 Sobic002G286300 Sobic010G137100 Sobic010G137100 Sobic002G286300--Sobic010G137100 Sobic010G011700 Sobic010G011700 Sobic002G286300--Sobic010G011700 Sobic005G171300 Sobic005G171300 Sobic002G286300--Sobic005G171300 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic002G286300--Sobic003G207500 Sobic008G101400 Sobic008G101400 Sobic002G286300--Sobic008G101400 Sobic009G030800 Sobic009G030800 Sobic002G286300--Sobic009G030800 Sobic004G111300 Sobic004G111300 Sobic002G286300--Sobic004G111300 Sobic005G203300 Sobic005G203300 Sobic002G286300--Sobic005G203300 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic002G286300--Sobic010G102366 Sobic010G137100--Sobic010G102366 Sobic010G135250 Sobic010G135250 Sobic010G137100--Sobic010G135250 Sobic010G137100--Sobic002G286300 Sobic010G137100--Sobic003G207500 Sobic004G340300 Sobic004G340300 Sobic010G137100--Sobic004G340300 Sobic010G132900 Sobic010G132900 Sobic010G137100--Sobic010G132900 Sobic010G163400 Sobic010G163400 Sobic010G137100--Sobic010G163400 Sobic001G182850 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Octagon: transcription factors


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