Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G011700.1
Synonym Sb10g001150
Functional annotation SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed
UniProt A0A194YGQ8
Pfam PF03492
Panther DB PTHR31009 PTHR31009:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008168; methyltransferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G36470 : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g20920.1 : SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G286300 - -
2 Sobic.009G049850 - -
3 Sobic.008G101400 - -
4 Sobic.002G395200 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
5 Sobic.008G072700 expressed protein -
6 Sobic.005G097800 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
7 Sobic.006G168650 - -
8 Sobic.009G189000 expressed protein -
9 Sobic.004G268500 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase 1, chloroplast precursor, putative, expressed K09840: 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase
10 Sobic.009G062500 -(PubMedID : 26976818)@triose phosphate/phosphate translocator, non-green plastid,chloroplast precursor, putative, expressed K15283: solute carrier family 35, member E1
11 Sobic.007G153900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@nitrate reductase, putative, expressed K10534: nitrate reductase (NAD(P)H)
12 Sobic.003G255900 expressed protein -
13 Sobic.009G017666 - -
14 Sobic.003G369000 - -
15 Sobic.006G055000 TKL_IRAK_DUF26-lc.12 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
16 Sobic.004G201700 glycosyl transferase family 17 protein, putative, expressed K00737: beta-1,4-mannosyl-glycoprotein beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase
17 Sobic.003G037300 Twin LOV 1, putative, expressed -
18 Sobic.009G107020 - -
19 Sobic.008G015100 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.8 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
20 Sobic.003G128550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G011700 Sobic010G011700 Sobic002G286300 Sobic002G286300 Sobic010G011700--Sobic002G286300 Sobic009G049850 Sobic009G049850 Sobic010G011700--Sobic009G049850 Sobic008G101400 Sobic008G101400 Sobic010G011700--Sobic008G101400 Sobic002G395200 Sobic002G395200 Sobic010G011700--Sobic002G395200 Sobic008G072700 Sobic008G072700 Sobic010G011700--Sobic008G072700 Sobic005G097800 Sobic005G097800 Sobic010G011700--Sobic005G097800 Sobic006G168650 Sobic006G168650 Sobic010G011700--Sobic006G168650 Sobic009G189000 Sobic009G189000 Sobic010G011700--Sobic009G189000 Sobic004G268500 Sobic004G268500 Sobic010G011700--Sobic004G268500 Sobic010G137100 Sobic010G137100 Sobic002G286300--Sobic010G137100 Sobic002G286300--Sobic010G011700 Sobic005G171300 Sobic005G171300 Sobic002G286300--Sobic005G171300 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic002G286300--Sobic003G207500 Sobic002G286300--Sobic008G101400 Sobic009G030800 Sobic009G030800 Sobic002G286300--Sobic009G030800 Sobic004G111300 Sobic004G111300 Sobic002G286300--Sobic004G111300 Sobic005G203300 Sobic005G203300 Sobic002G286300--Sobic005G203300 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic002G286300--Sobic010G102366 Sobic001G160700 Sobic001G160700 Sobic009G049850--Sobic001G160700 Sobic008G015100 Sobic008G015100 Sobic008G101400--Sobic008G015100 Sobic004G201700 Sobic004G201700 Sobic008G101400--Sobic004G201700 Sobic010G189300 Sobic010G189300 Sobic008G101400--Sobic010G189300 Sobic002G316700 Sobic002G316700 Sobic008G101400--Sobic002G316700 Sobic009G062500 Sobic009G062500 Sobic008G101400--Sobic009G062500 Sobic009G164300 Sobic009G164300 Sobic008G101400--Sobic009G164300 Sobic007G136900 Sobic007G136900 Sobic008G101400--Sobic007G136900 Sobic007G223500 Sobic007G223500 Sobic008G101400--Sobic007G223500 Sobic001G435500 Sobic001G435500 Sobic008G101400--Sobic001G435500 Sobic003G088800 Sobic003G088800 Sobic002G395200--Sobic003G088800 Sobic002G395200--Sobic005G097800 Sobic001G019300 Sobic001G019300 Sobic002G395200--Sobic001G019300 Sobic009G202600 Sobic009G202600 Sobic002G395200--Sobic009G202600 Sobic002G281000 Sobic002G281000 Sobic002G395200--Sobic002G281000 Sobic001G525900 Sobic001G525900 Sobic002G395200--Sobic001G525900 Sobic002G337001 Sobic002G337001 Sobic002G395200--Sobic002G337001 Sobic010G193000 Sobic010G193000 Sobic002G395200--Sobic010G193000 Sobic002G395200--Sobic008G015100 Sobic007G159000 Sobic007G159000 Sobic008G072700--Sobic007G159000 Sobic008G072700--Sobic004G201700 Sobic002G281800 Sobic002G281800 Sobic008G072700--Sobic002G281800 Sobic001G404500 Sobic001G404500 Sobic008G072700--Sobic001G404500 Sobic008G072700--Sobic009G062500 Sobic008G072700--Sobic008G015100 Sobic008G072700--Sobic001G525900 Sobic005G111500 Sobic005G111500 Sobic008G072700--Sobic005G111500 Sobic008G072700--Sobic005G097800 Sobic005G097800--Sobic002G281000 Sobic009G202400 Sobic009G202400 Sobic005G097800--Sobic009G202400 Sobic005G220900 Sobic005G220900 Sobic005G097800--Sobic005G220900 Sobic005G097800--Sobic001G404500 Sobic002G265400 Sobic002G265400 Sobic005G097800--Sobic002G265400 Sobic003G292600 Sobic003G292600 Sobic005G097800--Sobic003G292600 Sobic008G063100 Sobic008G063100 Sobic005G097800--Sobic008G063100 Sobic010G225600 Sobic010G225600 Sobic005G097800--Sobic010G225600 Sobic006G135100 Sobic006G135100 Sobic005G097800--Sobic006G135100 Sobic003G306600 Sobic003G306600 Sobic006G168650--Sobic003G306600 Sobic001G521200 Sobic001G521200 Sobic006G168650--Sobic001G521200 Sobic002G402700 Sobic002G402700 Sobic006G168650--Sobic002G402700 Sobic003G179350 Sobic003G179350 Sobic006G168650--Sobic003G179350 Sobic003G037300 Sobic003G037300 Sobic006G168650--Sobic003G037300 Sobic004G298900 Sobic004G298900 Sobic006G168650--Sobic004G298900 Sobic001G134700 Sobic001G134700 Sobic006G168650--Sobic001G134700 Sobic008G006100 Sobic008G006100 Sobic006G168650--Sobic008G006100 Sobic008G074000 Sobic008G074000 Sobic006G168650--Sobic008G074000 Sobic004G063200 Sobic004G063200 Sobic009G189000--Sobic004G063200 Sobic010G214000 Sobic010G214000 Sobic009G189000--Sobic010G214000 Sobic003G108600 Sobic003G108600 Sobic009G189000--Sobic003G108600 Sobic009G189000--Sobic001G404500 Sobic009G023401 Sobic009G023401 Sobic009G189000--Sobic009G023401 Sobic001G351400 Sobic001G351400 Sobic009G189000--Sobic001G351400 Sobic009G189000--Sobic002G265400 Sobic001G005500 Sobic001G005500 Sobic009G189000--Sobic001G005500 Sobic010G063200 Sobic010G063200 Sobic009G189000--Sobic010G063200 Sobic006G123500 Sobic006G123500 Sobic004G268500--Sobic006G123500 Sobic008G065200 Sobic008G065200 Sobic004G268500--Sobic008G065200 Sobic003G284800 Sobic003G284800 Sobic004G268500--Sobic003G284800 Sobic004G268500--Sobic001G404500 Sobic001G071200 Sobic001G071200 Sobic004G268500--Sobic001G071200 Sobic004G268500--Sobic003G292600 Sobic002G046900 Sobic002G046900 Sobic004G268500--Sobic002G046900 Sobic002G025700 Sobic002G025700 Sobic004G268500--Sobic002G025700 Sobic002G362100 Sobic002G362100 Sobic004G268500--Sobic002G362100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.