Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G168650.2,Sobic.006G168650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5REZ8 , A0A1Z5REA6
Pfam PF08146
Panther DB PTHR13457 PTHR13457 PTHR13457:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06530 : ARM repeat superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g46310.2 : HEAT repeat family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023348
Brachypodium KQJ83918
Barley HORVU2Hr1G098020.31 , HORVU2Hr1G098020.30 , HORVU2Hr1G098020.20 , HORVU2Hr1G098020.18 , HORVU2Hr1G098020.17 , HORVU2Hr1G098020.26 , HORVU2Hr1G098020.27 , HORVU2Hr1G098020.24 , HORVU2Hr1G098020.25 , HORVU2Hr1G098020.28 , HORVU2Hr1G098020.29 , HORVU2Hr1G098020.14
Wheat TraesCS2D02G413500 , TraesCS2B02G435400 , TraesCS2A02G416500 , TraesCS2A02G416500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G306600 acetamidase, putative, expressed K01455: formamidase
2 Sobic.001G521200 expressed protein -
3 Sobic.002G402700 -(PubMedID : 26976818)@ferredoxin-dependent glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K00284: GLU, glutamate synthase (ferredoxin)
4 Sobic.003G179350 - -
5 Sobic.003G037300 Twin LOV 1, putative, expressed -
6 Sobic.004G298900 OR, putative, expressed -
7 Sobic.001G134700 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain containing protein, expressed K02639: ferredoxin
8 Sobic.008G006100 MATE efflux protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G074000 OsSCP65 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16296: serine carboxypeptidase-like clade I
10 Sobic.002G220900 expressed protein -
11 Sobic.005G001700 mitochondrial substrate carrier family protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G465700 aminotransferase, putative, expressed K00833: adenosylmethionine---8-amino-7-oxononanoate aminotransferase
13 Sobic.005G111550 - -
14 Sobic.003G233700 SET domain-containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G171600 STE_MEKK_ste11_MAP3K.12 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
16 Sobic.009G062400 uvrB/uvrC motif family protein, expressed -
17 Sobic.001G183000 peptidase M50 family protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G125900 DNA gyrase subunit B, chloroplast/mitochondrial precursor, putative, expressed K02470: DNA gyrase subunit B
19 Sobic.010G125833 - -
20 Sobic.002G028400 mTERF domain containing protein, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial


Gene co-expression network
sample Sobic006G168650 Sobic006G168650 Sobic003G306600 Sobic003G306600 Sobic006G168650--Sobic003G306600 Sobic001G521200 Sobic001G521200 Sobic006G168650--Sobic001G521200 Sobic002G402700 Sobic002G402700 Sobic006G168650--Sobic002G402700 Sobic003G179350 Sobic003G179350 Sobic006G168650--Sobic003G179350 Sobic003G037300 Sobic003G037300 Sobic006G168650--Sobic003G037300 Sobic004G298900 Sobic004G298900 Sobic006G168650--Sobic004G298900 Sobic001G134700 Sobic001G134700 Sobic006G168650--Sobic001G134700 Sobic008G006100 Sobic008G006100 Sobic006G168650--Sobic008G006100 Sobic008G074000 Sobic008G074000 Sobic006G168650--Sobic008G074000 Sobic003G306600--Sobic008G074000 Sobic003G306600--Sobic003G179350 Sobic009G219100 Sobic009G219100 Sobic003G306600--Sobic009G219100 Sobic009G062400 Sobic009G062400 Sobic003G306600--Sobic009G062400 Sobic010G171600 Sobic010G171600 Sobic003G306600--Sobic010G171600 Sobic004G268300 Sobic004G268300 Sobic003G306600--Sobic004G268300 Sobic003G306600--Sobic008G006100 Sobic003G306600--Sobic006G168650 Sobic003G203300 Sobic003G203300 Sobic003G306600--Sobic003G203300 Sobic001G183000 Sobic001G183000 Sobic001G521200--Sobic001G183000 Sobic001G521200--Sobic008G006100 Sobic001G521200--Sobic003G037300 Sobic003G233700 Sobic003G233700 Sobic001G521200--Sobic003G233700 Sobic001G521200--Sobic002G402700 Sobic004G006400 Sobic004G006400 Sobic001G521200--Sobic004G006400 Sobic002G133900 Sobic002G133900 Sobic001G521200--Sobic002G133900 Sobic005G100300 Sobic005G100300 Sobic001G521200--Sobic005G100300 Sobic001G521200--Sobic009G062400 Sobic008G033000 Sobic008G033000 Sobic002G402700--Sobic008G033000 Sobic008G129900 Sobic008G129900 Sobic002G402700--Sobic008G129900 Sobic001G217900 Sobic001G217900 Sobic002G402700--Sobic001G217900 Sobic002G206300 Sobic002G206300 Sobic002G402700--Sobic002G206300 Sobic001G504400 Sobic001G504400 Sobic002G402700--Sobic001G504400 Sobic005G001700 Sobic005G001700 Sobic002G402700--Sobic005G001700 Sobic001G540600 Sobic001G540600 Sobic002G402700--Sobic001G540600 Sobic010G231300 Sobic010G231300 Sobic002G402700--Sobic010G231300 Sobic001G378100 Sobic001G378100 Sobic002G402700--Sobic001G378100 Sobic003G179350--Sobic009G219100 Sobic003G179350--Sobic003G306600 Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic003G179350--Sobic007G185300 Sobic004G154400 Sobic004G154400 Sobic003G179350--Sobic004G154400 Sobic009G038701 Sobic009G038701 Sobic003G179350--Sobic009G038701 Sobic009G093100 Sobic009G093100 Sobic003G179350--Sobic009G093100 Sobic001G536700 Sobic001G536700 Sobic003G179350--Sobic001G536700 Sobic003G179350--Sobic001G504400 Sobic003G179350--Sobic009G062400 Sobic003G037300--Sobic004G298900 Sobic003G037300--Sobic009G062400 Sobic003G037300--Sobic008G006100 Sobic010G269400 Sobic010G269400 Sobic003G037300--Sobic010G269400 Sobic009G207900 Sobic009G207900 Sobic003G037300--Sobic009G207900 Sobic003G037300--Sobic004G154400 Sobic010G076800 Sobic010G076800 Sobic003G037300--Sobic010G076800 Sobic003G037300--Sobic001G521200 Sobic001G286600 Sobic001G286600 Sobic003G037300--Sobic001G286600 Sobic004G298900--Sobic003G037300 Sobic004G298900--Sobic009G062400 Sobic006G258700 Sobic006G258700 Sobic004G298900--Sobic006G258700 Sobic004G298900--Sobic008G006100 Sobic003G014300 Sobic003G014300 Sobic004G298900--Sobic003G014300 Sobic002G102200 Sobic002G102200 Sobic004G298900--Sobic002G102200 Sobic005G111550 Sobic005G111550 Sobic004G298900--Sobic005G111550 Sobic004G151500 Sobic004G151500 Sobic004G298900--Sobic004G151500 Sobic006G260800 Sobic006G260800 Sobic004G298900--Sobic006G260800 Sobic004G336200 Sobic004G336200 Sobic001G134700--Sobic004G336200 Sobic001G134700--Sobic005G100300 Sobic003G160800 Sobic003G160800 Sobic001G134700--Sobic003G160800 Sobic001G134700--Sobic008G006100 Sobic006G101500 Sobic006G101500 Sobic001G134700--Sobic006G101500 Sobic001G500600 Sobic001G500600 Sobic001G134700--Sobic001G500600 Sobic008G073100 Sobic008G073100 Sobic001G134700--Sobic008G073100 Sobic005G110400 Sobic005G110400 Sobic001G134700--Sobic005G110400 Sobic003G387100 Sobic003G387100 Sobic001G134700--Sobic003G387100 Sobic002G112400 Sobic002G112400 Sobic008G006100--Sobic002G112400 Sobic001G128600 Sobic001G128600 Sobic008G006100--Sobic001G128600 Sobic008G006100--Sobic009G062400 Sobic008G006100--Sobic001G500600 Sobic003G070900 Sobic003G070900 Sobic008G006100--Sobic003G070900 Sobic009G237000 Sobic009G237000 Sobic008G006100--Sobic009G237000 Sobic008G006100--Sobic001G134700 Sobic008G006100--Sobic003G233700 Sobic007G103400 Sobic007G103400 Sobic008G006100--Sobic007G103400 Sobic008G074000--Sobic003G070900 Sobic008G074000--Sobic007G103400 Sobic008G074000--Sobic002G133900 Sobic008G074000--Sobic003G233700 Sobic008G074000--Sobic009G237000 Sobic008G074000--Sobic001G504400 Sobic004G353100 Sobic004G353100 Sobic008G074000--Sobic004G353100 Sobic009G170200 Sobic009G170200 Sobic008G074000--Sobic009G170200 Sobic008G074000--Sobic009G219100
Octagon: transcription factors


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