Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G521200.1
Synonym Sb01g048600
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WZZ2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g03640.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000380
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G183000 peptidase M50 family protein, putative, expressed -
2 Sobic.008G006100 MATE efflux protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G037300 Twin LOV 1, putative, expressed -
4 Sobic.003G233700 SET domain-containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G402700 -(PubMedID : 26976818)@ferredoxin-dependent glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K00284: GLU, glutamate synthase (ferredoxin)
6 Sobic.004G006400 cytochrome P450, putative, expressed -
7 Sobic.002G133900 oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.005G100300 OsClp12 - Putative Clp protease homologue, expressed -
9 Sobic.009G062400 uvrB/uvrC motif family protein, expressed -
10 Sobic.006G260800 phosphatidate cytidylyltransferase, putative, expressed K18678: phytol kinase
11 Sobic.010G125866 - -
12 Sobic.004G268300 phosphatase, putative, expressed -
13 Sobic.003G287900 phenylalanyl-tRNA synthetase, putative, expressed K01889: FARSA, phenylalanyl-tRNA synthetase alpha chain
14 Sobic.005G001700 mitochondrial substrate carrier family protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G134700 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain containing protein, expressed K02639: ferredoxin
16 Sobic.006G168650 - -
17 Sobic.003G070900 inner membrane protein, putative, expressed K03217: yidC, spoIIIJ, OXA1, YidC/Oxa1 family membrane protein insertase
18 Sobic.002G028400 mTERF domain containing protein, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
19 Sobic.003G085100 MYB family transcription factor, putative, expressed -
20 Sobic.001G001300 rhodanese-like domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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