Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G124300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PS06
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G214400 - -
2 Sobic.009G107020 - -
3 Sobic.005G115400 - -
4 Sobic.001G260300 - -
5 Sobic.010G115900 ureide permease, putative, expressed -
6 Sobic.005G128800 translationally-controlled tumor protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G413900 - -
8 Sobic.009G070300 - -
9 Sobic.003G128550 - -
10 Sobic.002G337001 - -
11 Sobic.001G312400 - -
12 Sobic.006G248350 - -
13 Sobic.001G091200 - -
14 Sobic.004G144700 ABC transporter family protein, putative, expressed -
15 Sobic.008G120132 - -
16 Sobic.010G143000 - -
17 Sobic.009G074250 - -
18 Sobic.002G066901 - -
19 Sobic.004G324600 - -
20 Sobic.001G528400 tobamovirus multiplication protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G124300 Sobic005G124300 Sobic010G214400 Sobic010G214400 Sobic005G124300--Sobic010G214400 Sobic009G107020 Sobic009G107020 Sobic005G124300--Sobic009G107020 Sobic005G115400 Sobic005G115400 Sobic005G124300--Sobic005G115400 Sobic001G260300 Sobic001G260300 Sobic005G124300--Sobic001G260300 Sobic010G115900 Sobic010G115900 Sobic005G124300--Sobic010G115900 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic005G124300--Sobic005G128800 Sobic002G413900 Sobic002G413900 Sobic005G124300--Sobic002G413900 Sobic009G070300 Sobic009G070300 Sobic005G124300--Sobic009G070300 Sobic003G128550 Sobic003G128550 Sobic005G124300--Sobic003G128550 Sobic010G214400--Sobic005G124300 Sobic010G214400--Sobic002G413900 Sobic010G214400--Sobic009G107020 Sobic010G214400--Sobic001G260300 Sobic010G214400--Sobic003G128550 Sobic004G324600 Sobic004G324600 Sobic010G214400--Sobic004G324600 Sobic010G214400--Sobic005G115400 Sobic006G248350 Sobic006G248350 Sobic010G214400--Sobic006G248350 Sobic009G017666 Sobic009G017666 Sobic010G214400--Sobic009G017666 Sobic009G107020--Sobic003G128550 Sobic009G107020--Sobic005G115400 Sobic009G074250 Sobic009G074250 Sobic009G107020--Sobic009G074250 Sobic009G107020--Sobic005G124300 Sobic009G107020--Sobic010G115900 Sobic009G107020--Sobic010G214400 Sobic004G144700 Sobic004G144700 Sobic009G107020--Sobic004G144700 Sobic002G337001 Sobic002G337001 Sobic009G107020--Sobic002G337001 Sobic009G214800 Sobic009G214800 Sobic009G107020--Sobic009G214800 Sobic005G115400--Sobic009G070300 Sobic005G115400--Sobic010G115900 Sobic005G115400--Sobic009G214800 Sobic005G115400--Sobic009G107020 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic005G115400--Sobic008G120132 Sobic005G115400--Sobic003G128550 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic005G115400--Sobic010G143000 Sobic001G467700 Sobic001G467700 Sobic005G115400--Sobic001G467700 Sobic005G115400--Sobic005G124300 Sobic001G312400 Sobic001G312400 Sobic001G260300--Sobic001G312400 Sobic002G035300 Sobic002G035300 Sobic001G260300--Sobic002G035300 Sobic001G262800 Sobic001G262800 Sobic001G260300--Sobic001G262800 Sobic001G260300--Sobic005G124300 Sobic001G260300--Sobic010G214400 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic001G260300--Sobic001G091200 Sobic002G398200 Sobic002G398200 Sobic001G260300--Sobic002G398200 Sobic010G214500 Sobic010G214500 Sobic001G260300--Sobic010G214500 Sobic003G439900 Sobic003G439900 Sobic001G260300--Sobic003G439900 Sobic010G115900--Sobic005G115400 Sobic010G115900--Sobic009G214800 Sobic010G115900--Sobic005G128800 Sobic010G115900--Sobic010G143000 Sobic010G115900--Sobic009G070300 Sobic010G115900--Sobic008G120132 Sobic010G115900--Sobic009G107020 Sobic010G115900--Sobic002G337001 Sobic010G115900--Sobic001G467700 Sobic005G128800--Sobic008G120132 Sobic005G128800--Sobic010G115900 Sobic005G128800--Sobic010G143000 Sobic010G100200 Sobic010G100200 Sobic005G128800--Sobic010G100200 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic005G128800--Sobic009G070250 Sobic001G353800 Sobic001G353800 Sobic005G128800--Sobic001G353800 Sobic005G128800--Sobic005G124300 Sobic005G128800--Sobic005G115400 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic005G128800--Sobic001G318100 Sobic002G413900--Sobic010G214400 Sobic002G413900--Sobic005G124300 Sobic002G413900--Sobic003G128550 Sobic008G072700 Sobic008G072700 Sobic002G413900--Sobic008G072700 Sobic002G413900--Sobic006G248350 Sobic002G413900--Sobic010G115900 Sobic002G413900--Sobic009G107020 Sobic002G413900--Sobic009G017666 Sobic003G237000 Sobic003G237000 Sobic002G413900--Sobic003G237000 Sobic009G070300--Sobic005G115400 Sobic009G070300--Sobic001G467700 Sobic009G070300--Sobic010G115900 Sobic001G267000 Sobic001G267000 Sobic009G070300--Sobic001G267000 Sobic009G070300--Sobic009G214800 Sobic001G148400 Sobic001G148400 Sobic009G070300--Sobic001G148400 Sobic009G070300--Sobic005G124300 Sobic009G070300--Sobic003G128550 Sobic002G066901 Sobic002G066901 Sobic009G070300--Sobic002G066901 Sobic003G128550--Sobic009G107020 Sobic003G128550--Sobic009G074250 Sobic003G128550--Sobic005G115400 Sobic003G128550--Sobic001G267000 Sobic003G128550--Sobic010G115900 Sobic003G128550--Sobic009G214800 Sobic003G128550--Sobic010G214400 Sobic003G128550--Sobic002G413900 Sobic003G128550--Sobic009G070300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.