Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G066901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W2R5
Pfam PF12165
Panther DB PTHR12321 PTHR12321:SF37
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G11200 : alfin-like 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g07040.1 : PHD finger protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013368
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G245000 - -
2 Sobic.001G267000 - -
3 Sobic.009G070300 - -
4 Sobic.005G117200 - -
5 Sobic.005G115400 - -
6 Sobic.005G127900 - -
7 Sobic.010G079800 expressed protein -
8 Sobic.001G380200 nucleotidyltransferase, putative, expressed -
9 Sobic.005G159801 - -
10 Sobic.005G067400 - -
11 Sobic.001G091200 - -
12 Sobic.007G026900 - -
13 Sobic.008G168700 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.005G124300 - -
15 Sobic.008G126500 - -
16 Sobic.005G074400 OsPDIL1-1 protein disulfide isomerase PDIL1-1, expressed K09580: PDIA1, protein disulfide-isomerase A1
17 Sobic.005G108225 - -
18 Sobic.001G188700 OST3/OST6 family protein, putative, expressed K12669: OST3, oligosaccharyltransferase complex subunit gamma
19 Sobic.002G188350 - -
20 Sobic.003G058900 TATA-binding protein-associated factor 2N, putative, expressed K13098: TLS, RNA-binding protein FUS


Gene co-expression network
sample Sobic002G066901 Sobic002G066901 Sobic006G245000 Sobic006G245000 Sobic002G066901--Sobic006G245000 Sobic001G267000 Sobic001G267000 Sobic002G066901--Sobic001G267000 Sobic009G070300 Sobic009G070300 Sobic002G066901--Sobic009G070300 Sobic005G117200 Sobic005G117200 Sobic002G066901--Sobic005G117200 Sobic005G115400 Sobic005G115400 Sobic002G066901--Sobic005G115400 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic002G066901--Sobic005G127900 Sobic010G079800 Sobic010G079800 Sobic002G066901--Sobic010G079800 Sobic001G380200 Sobic001G380200 Sobic002G066901--Sobic001G380200 Sobic005G159801 Sobic005G159801 Sobic002G066901--Sobic005G159801 Sobic006G245000--Sobic002G066901 Sobic007G181600 Sobic007G181600 Sobic006G245000--Sobic007G181600 Sobic004G298700 Sobic004G298700 Sobic006G245000--Sobic004G298700 Sobic006G180900 Sobic006G180900 Sobic006G245000--Sobic006G180900 Sobic008G051400 Sobic008G051400 Sobic006G245000--Sobic008G051400 Sobic006G245000--Sobic010G079800 Sobic001G310500 Sobic001G310500 Sobic006G245000--Sobic001G310500 Sobic007G140500 Sobic007G140500 Sobic006G245000--Sobic007G140500 Sobic006G245000--Sobic001G267000 Sobic003G128550 Sobic003G128550 Sobic001G267000--Sobic003G128550 Sobic001G178800 Sobic001G178800 Sobic001G267000--Sobic001G178800 Sobic001G267000--Sobic009G070300 Sobic001G267000--Sobic005G115400 Sobic001G267000--Sobic005G117200 Sobic009G097900 Sobic009G097900 Sobic001G267000--Sobic009G097900 Sobic001G267000--Sobic002G066901 Sobic001G192250 Sobic001G192250 Sobic001G267000--Sobic001G192250 Sobic009G128000 Sobic009G128000 Sobic001G267000--Sobic009G128000 Sobic009G070300--Sobic005G115400 Sobic001G467700 Sobic001G467700 Sobic009G070300--Sobic001G467700 Sobic010G115900 Sobic010G115900 Sobic009G070300--Sobic010G115900 Sobic009G070300--Sobic001G267000 Sobic009G214800 Sobic009G214800 Sobic009G070300--Sobic009G214800 Sobic001G148400 Sobic001G148400 Sobic009G070300--Sobic001G148400 Sobic005G124300 Sobic005G124300 Sobic009G070300--Sobic005G124300 Sobic009G070300--Sobic003G128550 Sobic009G070300--Sobic002G066901 Sobic005G075500 Sobic005G075500 Sobic005G117200--Sobic005G075500 Sobic005G117200--Sobic005G115400 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic005G117200--Sobic010G143000 Sobic005G117200--Sobic001G267000 Sobic002G069500 Sobic002G069500 Sobic005G117200--Sobic002G069500 Sobic005G117200--Sobic009G097900 Sobic005G117200--Sobic005G127900 Sobic005G117200--Sobic002G066901 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic005G117200--Sobic005G108225 Sobic005G115400--Sobic009G070300 Sobic005G115400--Sobic010G115900 Sobic005G115400--Sobic009G214800 Sobic009G107020 Sobic009G107020 Sobic005G115400--Sobic009G107020 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic005G115400--Sobic008G120132 Sobic005G115400--Sobic003G128550 Sobic005G115400--Sobic010G143000 Sobic005G115400--Sobic001G467700 Sobic005G115400--Sobic005G124300 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic005G127900--Sobic009G070250 Sobic008G126500 Sobic008G126500 Sobic005G127900--Sobic008G126500 Sobic005G127900--Sobic005G108225 Sobic002G013800 Sobic002G013800 Sobic005G127900--Sobic002G013800 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic005G127900--Sobic005G110547 Sobic007G026900 Sobic007G026900 Sobic005G127900--Sobic007G026900 Sobic001G538100 Sobic001G538100 Sobic005G127900--Sobic001G538100 Sobic005G127900--Sobic008G120132 Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic005G127900--Sobic005G145800 Sobic001G239100 Sobic001G239100 Sobic010G079800--Sobic001G239100 Sobic007G050300 Sobic007G050300 Sobic010G079800--Sobic007G050300 Sobic001G136500 Sobic001G136500 Sobic010G079800--Sobic001G136500 Sobic004G146200 Sobic004G146200 Sobic010G079800--Sobic004G146200 Sobic007G153700 Sobic007G153700 Sobic010G079800--Sobic007G153700 Sobic007G031100 Sobic007G031100 Sobic010G079800--Sobic007G031100 Sobic001G478700 Sobic001G478700 Sobic010G079800--Sobic001G478700 Sobic004G206300 Sobic004G206300 Sobic010G079800--Sobic004G206300 Sobic001G188700 Sobic001G188700 Sobic010G079800--Sobic001G188700 Sobic001G380200--Sobic007G026900 Sobic001G380200--Sobic001G478700 Sobic001G380200--Sobic002G066901 Sobic001G432100 Sobic001G432100 Sobic001G380200--Sobic001G432100 Sobic005G067400 Sobic005G067400 Sobic001G380200--Sobic005G067400 Sobic010G109300 Sobic010G109300 Sobic001G380200--Sobic010G109300 Sobic001G380200--Sobic010G079800 Sobic003G071901 Sobic003G071901 Sobic001G380200--Sobic003G071901 Sobic002G354800 Sobic002G354800 Sobic001G380200--Sobic002G354800 Sobic003G439900 Sobic003G439900 Sobic005G159801--Sobic003G439900 Sobic005G184050 Sobic005G184050 Sobic005G159801--Sobic005G184050 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic005G159801--Sobic001G091200 Sobic006G275700 Sobic006G275700 Sobic005G159801--Sobic006G275700 Sobic002G398200 Sobic002G398200 Sobic005G159801--Sobic002G398200 Sobic005G163866 Sobic005G163866 Sobic005G159801--Sobic005G163866 Sobic001G309800 Sobic001G309800 Sobic005G159801--Sobic001G309800 Sobic002G128101 Sobic002G128101 Sobic005G159801--Sobic002G128101 Sobic001G262800 Sobic001G262800 Sobic005G159801--Sobic001G262800
Octagon: transcription factors


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