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Transcriptome id Sobic.007G026900.1
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UniProt A0A1B6PF56
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G109300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@acylphosphatase, putative, expressed K01512: acylphosphatase
2 Sobic.003G071901 - -
3 Sobic.005G127900 - -
4 Sobic.003G055200 expressed protein -
5 Sobic.001G380200 nucleotidyltransferase, putative, expressed -
6 Sobic.002G315100 expressed protein K15083: DNA repair protein RAD16
7 Sobic.002G230400 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed K11855: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
8 Sobic.002G354800 zinc finger family protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G046300 histidine kinase, putative, expressed -
10 Sobic.009G070250 - -
11 Sobic.001G081800 GASR3 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
12 Sobic.010G009600 OsFBX182 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G194100 DEFL6 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
14 Sobic.010G193700 expressed protein -
15 Sobic.008G160600 tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein, expressed -
16 Sobic.005G074400 OsPDIL1-1 protein disulfide isomerase PDIL1-1, expressed K09580: PDIA1, protein disulfide-isomerase A1
17 Sobic.010G207900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@prenyltransferase, putative, expressed K09833: HPT, HGGT, homogentisate phytyltransferase / homogentisate geranylgeranyltransferase
18 Sobic.006G143300 nuclear transport factor 2, putative, expressed -
19 Sobic.004G163700 "1,4-alpha-glucan-branching enzyme 2"(PubMedID : 26186930)@"1,4-alpha-glucan branching enzyme IIB (Zm)"(PubMedID : 27208977)@Starch synthesis(PubMedID : 31624872)@"SbeIIb(Ortholog in maize:Jiang et al., 2013)"(PubMedID : 31659883)@1,4-alpha-glucan-branching enzyme, chloroplast precursor, putative, expressed K00700: GBE1, 1,4-alpha-glucan branching enzyme
20 Sobic.002G174500 OsFBX252 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G026900 Sobic007G026900 Sobic010G109300 Sobic010G109300 Sobic007G026900--Sobic010G109300 Sobic003G071901 Sobic003G071901 Sobic007G026900--Sobic003G071901 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic007G026900--Sobic005G127900 Sobic003G055200 Sobic003G055200 Sobic007G026900--Sobic003G055200 Sobic001G380200 Sobic001G380200 Sobic007G026900--Sobic001G380200 Sobic002G315100 Sobic002G315100 Sobic007G026900--Sobic002G315100 Sobic002G230400 Sobic002G230400 Sobic007G026900--Sobic002G230400 Sobic002G354800 Sobic002G354800 Sobic007G026900--Sobic002G354800 Sobic006G046300 Sobic006G046300 Sobic007G026900--Sobic006G046300 Sobic008G160600 Sobic008G160600 Sobic010G109300--Sobic008G160600 Sobic003G042200 Sobic003G042200 Sobic010G109300--Sobic003G042200 Sobic010G009600 Sobic010G009600 Sobic010G109300--Sobic010G009600 Sobic001G194100 Sobic001G194100 Sobic010G109300--Sobic001G194100 Sobic010G109300--Sobic002G354800 Sobic005G041900 Sobic005G041900 Sobic010G109300--Sobic005G041900 Sobic006G184200 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Octagon: transcription factors


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