Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G168700.1
Synonym Sb08g021390
Functional annotation OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5YRZ3
Pfam -
Panther DB PTHR31264 PTHR31264:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g17530.1 : OsFBX321 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G168700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G067400 - -
2 Sobic.001G538100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K15691: E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3
3 Sobic.004G031100 CPuORF1 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed -
4 Sobic.002G239400 OsFBX338 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.009G152140 - -
6 Sobic.007G056900 DNA-directed RNA polymerase subunit, putative, expressed K16252: NRPD2, DNA-directed RNA polymerase IV and V subunit 2
7 Sobic.002G274700 glycosyl transferase family 8, putative, expressed K13648: alpha-1,4-galacturonosyltransferase
8 Sobic.010G041100 mTERF family protein, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
9 Sobic.003G343200 outer membrane protein, OMP85 family protein, expressed K07277: SAM50, TOB55, outer membrane protein insertion porin family
10 Sobic.004G218000 SET domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G313400 transcription elongation factor SPT5 homolog 1, putative, expressed K15172: SUPT5H, transcription elongation factor SPT5
12 Sobic.003G092100 - -
13 Sobic.003G044000 lipase class 3 family protein, putative, expressed -
14 Sobic.010G257500 expressed protein -
15 Sobic.003G090000 seven in absentia protein family protein, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
16 Sobic.007G010200 - -
17 Sobic.009G066600 expressed protein -
18 Sobic.001G288000 ankyrin repeat domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G084800 - -
20 Sobic.001G091200 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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