Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G538100.2,Sobic.001G538100.1
Synonym Sb01g050080
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt C5WMQ5 , A0A1Z5SC47
Pfam PF13639
Panther DB PTHR16047 PTHR16047:SF9
NCBI CDD KOG1645; RING-finger-containing E3 ubiquitin ligase
KEGG Orthology K15691; E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G03450 : Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g01790.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000151
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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16 Sobic.005G003400 - -
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19 Sobic.009G070250 - -
20 Sobic.010G257500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G538100 Sobic001G538100 Sobic008G168700 Sobic008G168700 Sobic001G538100--Sobic008G168700 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic001G538100--Sobic005G127900 Sobic005G067400 Sobic005G067400 Sobic001G538100--Sobic005G067400 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic001G538100--Sobic002G239400 Sobic001G178800 Sobic001G178800 Sobic001G538100--Sobic001G178800 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic001G538100--Sobic005G110547 Sobic009G093800 Sobic009G093800 Sobic001G538100--Sobic009G093800 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic001G538100--Sobic001G091200 Sobic007G154350 Sobic007G154350 Sobic001G538100--Sobic007G154350 Sobic008G168700--Sobic005G067400 Sobic008G168700--Sobic001G538100 Sobic004G031100 Sobic004G031100 Sobic008G168700--Sobic004G031100 Sobic008G168700--Sobic002G239400 Sobic009G152140 Sobic009G152140 Sobic008G168700--Sobic009G152140 Sobic007G056900 Sobic007G056900 Sobic008G168700--Sobic007G056900 Sobic002G274700 Sobic002G274700 Sobic008G168700--Sobic002G274700 Sobic010G041100 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Octagon: transcription factors


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