Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G134700.5,Sobic.003G134700.6,Sobic.003G134700.7,Sobic.003G134700.1,Sobic.003G134700.2
Synonym Sb03g011452
Functional annotation exonuclease, putative, expressed
UniProt A0A1W0VX61 , A0A1B6Q303 , A0A1B6Q2Y9
Pfam PF00929
Panther DB PTHR30231 PTHR30231:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G07710 : Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g26730.1 : exonuclease, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017804 , Zm00025a011146
Brachypodium KQJ82927
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G134700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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10 Sobic.001G538100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K15691: E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3
11 Sobic.001G192250 - -
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17 Sobic.010G154500 - -
18 Sobic.004G209300 glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed -
19 Sobic.008G061201 - -
20 Sobic.003G261566 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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