Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G178450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt -
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025489 , Zm00025a054312
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G134700 exonuclease, putative, expressed -
2 Sobic.009G093800 - -
3 Sobic.004G209300 glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed -
4 Sobic.003G115400 RPA3 - Putative single-stranded DNA binding complex subunit 3, expressed K10740: replication factor A3
5 Sobic.003G112001 - -
6 Sobic.009G097900 - -
7 Sobic.001G091200 - -
8 Sobic.010G135250 - -
9 Sobic.001G538100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K15691: E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3
10 Sobic.008G178100 - -
11 Sobic.010G102366 - -
12 Sobic.009G106000 - -
13 Sobic.002G340200 expressed protein -
14 Sobic.005G100250 - -
15 Sobic.005G104300 - -
16 Sobic.007G154350 - -
17 Sobic.001G091100 - -
18 Sobic.008G061201 - -
19 Sobic.003G351401 - -
20 Sobic.003G032600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G178450 Sobic008G178450 Sobic003G134700 Sobic003G134700 Sobic008G178450--Sobic003G134700 Sobic009G093800 Sobic009G093800 Sobic008G178450--Sobic009G093800 Sobic004G209300 Sobic004G209300 Sobic008G178450--Sobic004G209300 Sobic003G115400 Sobic003G115400 Sobic008G178450--Sobic003G115400 Sobic003G112001 Sobic003G112001 Sobic008G178450--Sobic003G112001 Sobic009G097900 Sobic009G097900 Sobic008G178450--Sobic009G097900 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic008G178450--Sobic001G091200 Sobic010G135250 Sobic010G135250 Sobic008G178450--Sobic010G135250 Sobic001G538100 Sobic001G538100 Sobic008G178450--Sobic001G538100 Sobic003G134700--Sobic003G112001 Sobic003G134700--Sobic009G097900 Sobic003G134700--Sobic009G093800 Sobic009G074250 Sobic009G074250 Sobic003G134700--Sobic009G074250 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic003G134700--Sobic010G102366 Sobic003G134700--Sobic008G178450 Sobic001G178800 Sobic001G178800 Sobic003G134700--Sobic001G178800 Sobic003G134700--Sobic003G115400 Sobic003G128550 Sobic003G128550 Sobic003G134700--Sobic003G128550 Sobic009G093800--Sobic009G097900 Sobic009G093800--Sobic003G134700 Sobic009G093800--Sobic003G112001 Sobic009G093800--Sobic009G074250 Sobic009G106000 Sobic009G106000 Sobic009G093800--Sobic009G106000 Sobic009G093800--Sobic008G178450 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic009G093800--Sobic005G127900 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic009G093800--Sobic009G070250 Sobic009G051800 Sobic009G051800 Sobic009G093800--Sobic009G051800 Sobic004G209300--Sobic008G178450 Sobic008G178100 Sobic008G178100 Sobic004G209300--Sobic008G178100 Sobic004G209300--Sobic003G134700 Sobic003G032600 Sobic003G032600 Sobic004G209300--Sobic003G032600 Sobic004G340300 Sobic004G340300 Sobic004G209300--Sobic004G340300 Sobic004G209300--Sobic010G102366 Sobic009G124900 Sobic009G124900 Sobic004G209300--Sobic009G124900 Sobic010G154500 Sobic010G154500 Sobic004G209300--Sobic010G154500 Sobic003G188300 Sobic003G188300 Sobic004G209300--Sobic003G188300 Sobic001G541000 Sobic001G541000 Sobic003G115400--Sobic001G541000 Sobic001G036300 Sobic001G036300 Sobic003G115400--Sobic001G036300 Sobic001G300000 Sobic001G300000 Sobic003G115400--Sobic001G300000 Sobic003G115400--Sobic009G097900 Sobic007G184100 Sobic007G184100 Sobic003G115400--Sobic007G184100 Sobic005G098900 Sobic005G098900 Sobic003G115400--Sobic005G098900 Sobic003G115400--Sobic003G134700 Sobic001G025900 Sobic001G025900 Sobic003G115400--Sobic001G025900 Sobic003G274400 Sobic003G274400 Sobic003G115400--Sobic003G274400 Sobic003G112001--Sobic003G134700 Sobic003G112001--Sobic009G074250 Sobic003G112001--Sobic009G097900 Sobic003G112001--Sobic009G093800 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic003G112001--Sobic001G318100 Sobic003G112001--Sobic010G102366 Sobic010G060166 Sobic010G060166 Sobic003G112001--Sobic010G060166 Sobic001G192250 Sobic001G192250 Sobic003G112001--Sobic001G192250 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic003G112001--Sobic003G351401 Sobic009G097900--Sobic009G093800 Sobic009G097900--Sobic003G134700 Sobic009G097900--Sobic003G112001 Sobic009G097900--Sobic009G074250 Sobic009G097900--Sobic001G318100 Sobic009G097900--Sobic001G178800 Sobic009G097900--Sobic001G192250 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic009G097900--Sobic005G108225 Sobic009G097900--Sobic003G115400 Sobic004G146100 Sobic004G146100 Sobic001G091200--Sobic004G146100 Sobic003G208500 Sobic003G208500 Sobic001G091200--Sobic003G208500 Sobic003G388000 Sobic003G388000 Sobic001G091200--Sobic003G388000 Sobic005G159801 Sobic005G159801 Sobic001G091200--Sobic005G159801 Sobic001G260300 Sobic001G260300 Sobic001G091200--Sobic001G260300 Sobic001G475000 Sobic001G475000 Sobic001G091200--Sobic001G475000 Sobic001G273000 Sobic001G273000 Sobic001G091200--Sobic001G273000 Sobic008G168700 Sobic008G168700 Sobic001G091200--Sobic008G168700 Sobic005G104300 Sobic005G104300 Sobic001G091200--Sobic005G104300 Sobic010G137100 Sobic010G137100 Sobic010G135250--Sobic010G137100 Sobic005G100250 Sobic005G100250 Sobic010G135250--Sobic005G100250 Sobic003G251100 Sobic003G251100 Sobic010G135250--Sobic003G251100 Sobic010G132900 Sobic010G132900 Sobic010G135250--Sobic010G132900 Sobic010G163400 Sobic010G163400 Sobic010G135250--Sobic010G163400 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic010G135250--Sobic003G207500 Sobic010G135250--Sobic010G102366 Sobic007G163001 Sobic007G163001 Sobic010G135250--Sobic007G163001 Sobic008G111200 Sobic008G111200 Sobic010G135250--Sobic008G111200 Sobic001G538100--Sobic008G168700 Sobic001G538100--Sobic005G127900 Sobic005G067400 Sobic005G067400 Sobic001G538100--Sobic005G067400 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic001G538100--Sobic002G239400 Sobic001G538100--Sobic001G178800 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic001G538100--Sobic005G110547 Sobic001G538100--Sobic009G093800 Sobic001G538100--Sobic001G091200 Sobic007G154350 Sobic007G154350 Sobic001G538100--Sobic007G154350
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.