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Transcriptome id Sobic.009G106000.3
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cDNA sequences
Sobic.009G106000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G093800 - -
2 Sobic.009G097900 - -
3 Sobic.010G024000 transketolase, chloroplast precursor, putative, expressed K00615: E2.2.1.1, tktA, transketolase
4 Sobic.005G127900 - -
5 Sobic.009G070250 - -
6 Sobic.003G401800 expressed protein -
7 Sobic.009G231100 3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase, putative, expressed K00979: 3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase (CMP-KDO synthetase)
8 Sobic.005G102350 - -
9 Sobic.005G110547 - -
10 Sobic.003G047900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@boron transporter protein, putative, expressed -
11 Sobic.003G134700 exonuclease, putative, expressed -
12 Sobic.009G051800 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
13 Sobic.008G168700 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.008G030600 similar to Non-specific lipid-transfer protein(PubMedID : 29862293)@SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@Protease inhibitor/seed storage/LTP("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@LTPL14 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
15 Sobic.001G538100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K15691: E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3
16 Sobic.003G112001 - -
17 Sobic.008G078000 EDM2, putative, expressed -
18 Sobic.008G126500 - -
19 Sobic.002G013800 NB-ARC domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G108225 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G106000 Sobic009G106000 Sobic009G093800 Sobic009G093800 Sobic009G106000--Sobic009G093800 Sobic009G097900 Sobic009G097900 Sobic009G106000--Sobic009G097900 Sobic010G024000 Sobic010G024000 Sobic009G106000--Sobic010G024000 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic009G106000--Sobic005G127900 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic009G106000--Sobic009G070250 Sobic003G401800 Sobic003G401800 Sobic009G106000--Sobic003G401800 Sobic009G231100 Sobic009G231100 Sobic009G106000--Sobic009G231100 Sobic005G102350 Sobic005G102350 Sobic009G106000--Sobic005G102350 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic009G106000--Sobic005G110547 Sobic009G093800--Sobic009G097900 Sobic003G134700 Sobic003G134700 Sobic009G093800--Sobic003G134700 Sobic003G112001 Sobic003G112001 Sobic009G093800--Sobic003G112001 Sobic009G074250 Sobic009G074250 Sobic009G093800--Sobic009G074250 Sobic009G093800--Sobic009G106000 Sobic008G178450 Sobic008G178450 Sobic009G093800--Sobic008G178450 Sobic009G093800--Sobic005G127900 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Sobic010G036901 Sobic005G110547--Sobic010G036901 Sobic005G110547--Sobic010G165700
Octagon: transcription factors


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