Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G178100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5YSF9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025489 , Zm00025a054312
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G257500 HORMA domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.004G209300 glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed -
3 Sobic.001G103800 lecithin cholesterol acyltransferase, putative, expressed K06129: lysophospholipase III
4 Sobic.009G083600 OsCML18 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed K13448: calcium-binding protein CML
5 Sobic.002G197200 expressed protein -
6 Sobic.003G117200 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed -
7 Sobic.002G290700 - -
8 Sobic.001G279400 - -
9 Sobic.001G538100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K15691: E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3
10 Sobic.005G108225 - -
11 Sobic.003G308100 CSLC1 - cellulose synthase-like family C, expressed -
12 Sobic.006G234300 expressed protein -
13 Sobic.009G219500 dehydrogenase/reductase SDR family member 2, putative, expressed K11147: dehydrogenase/reductase SDR family member 4
14 Sobic.001G146301 - -
15 Sobic.008G178450 - -
16 Sobic.005G007900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@protein phosphatase 2c, putative, expressed -
17 Sobic.006G271600 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K13126: polyadenylate-binding protein
18 Sobic.007G128200 expressed protein -
19 Sobic.002G233800 homeobox associated leucine zipper, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
20 Sobic.003G207300 OsFBD3 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G178100 Sobic008G178100 Sobic002G257500 Sobic002G257500 Sobic008G178100--Sobic002G257500 Sobic004G209300 Sobic004G209300 Sobic008G178100--Sobic004G209300 Sobic001G103800 Sobic001G103800 Sobic008G178100--Sobic001G103800 Sobic009G083600 Sobic009G083600 Sobic008G178100--Sobic009G083600 Sobic002G197200 Sobic002G197200 Sobic008G178100--Sobic002G197200 Sobic003G117200 Sobic003G117200 Sobic008G178100--Sobic003G117200 Sobic002G290700 Sobic002G290700 Sobic008G178100--Sobic002G290700 Sobic001G279400 Sobic001G279400 Sobic008G178100--Sobic001G279400 Sobic001G538100 Sobic001G538100 Sobic008G178100--Sobic001G538100 Sobic005G162900 Sobic005G162900 Sobic002G257500--Sobic005G162900 Sobic006G271600 Sobic006G271600 Sobic002G257500--Sobic006G271600 Sobic010G194600 Sobic010G194600 Sobic002G257500--Sobic010G194600 Sobic001G071600 Sobic001G071600 Sobic002G257500--Sobic001G071600 Sobic004G220200 Sobic004G220200 Sobic002G257500--Sobic004G220200 Sobic004G234600 Sobic004G234600 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Octagon: transcription factors


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