Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G209300.1
Synonym GLT1, Sb04g025490
Functional annotation glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed
UniProt A0A194YRY5
Pfam PF00310
Panther DB PTHR11938 PTHR11938:SF109
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G53460 : NADH-dependent glutamate synthase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g48960.1 : glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047871 , Zm00025a047870 , Zm00025a052604 , Zm00025a038839 , Zm00025a031184 , Zm00025a051630 , Zm00025a028023 , Zm00025a042520 , Zm00025a009788
Brachypodium KQK09208
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.010G186700 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G209300 Sobic004G209300 Sobic008G178450 Sobic008G178450 Sobic004G209300--Sobic008G178450 Sobic008G178100 Sobic008G178100 Sobic004G209300--Sobic008G178100 Sobic003G134700 Sobic003G134700 Sobic004G209300--Sobic003G134700 Sobic003G032600 Sobic003G032600 Sobic004G209300--Sobic003G032600 Sobic004G340300 Sobic004G340300 Sobic004G209300--Sobic004G340300 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic004G209300--Sobic010G102366 Sobic009G124900 Sobic009G124900 Sobic004G209300--Sobic009G124900 Sobic010G154500 Sobic010G154500 Sobic004G209300--Sobic010G154500 Sobic003G188300 Sobic003G188300 Sobic004G209300--Sobic003G188300 Sobic008G178450--Sobic003G134700 Sobic009G093800 Sobic009G093800 Sobic008G178450--Sobic009G093800 Sobic008G178450--Sobic004G209300 Sobic003G115400 Sobic003G115400 Sobic008G178450--Sobic003G115400 Sobic003G112001 Sobic003G112001 Sobic008G178450--Sobic003G112001 Sobic009G097900 Sobic009G097900 Sobic008G178450--Sobic009G097900 Sobic001G091200 Sobic001G091200 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Octagon: transcription factors


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