Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G154500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YJE4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G143000 - -
2 Sobic.001G318100 - -
3 Sobic.009G097900 - -
4 Sobic.009G231100 3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase, putative, expressed K00979: 3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase (CMP-KDO synthetase)
5 Sobic.008G051100 RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase ssu72, putative, expressed K15544: RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72
6 Sobic.005G075500 - -
7 Sobic.003G420900 S-formylglutathione hydrolase, putative, expressed K01070: frmB, ESD, S-formylglutathione hydrolase
8 Sobic.001G306700 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G340200 expressed protein -
10 Sobic.001G011300 expressed protein -
11 Sobic.003G390800 lipase, putative, expressed -
12 Sobic.001G353800 protein kinase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G060166 - -
14 Sobic.008G120132 - -
15 Sobic.010G134500 exonuclease, putative, expressed -
16 Sobic.003G112001 - -
17 Sobic.003G265500 peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial precursor protein, putative, expressed K01056: PTH1, pth, peptidyl-tRNA hydrolase, PTH1 family
18 Sobic.009G074250 - -
19 Sobic.005G108225 - -
20 Sobic.010G243600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G154500 Sobic010G154500 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic010G154500--Sobic010G143000 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic010G154500--Sobic001G318100 Sobic009G097900 Sobic009G097900 Sobic010G154500--Sobic009G097900 Sobic009G231100 Sobic009G231100 Sobic010G154500--Sobic009G231100 Sobic008G051100 Sobic008G051100 Sobic010G154500--Sobic008G051100 Sobic005G075500 Sobic005G075500 Sobic010G154500--Sobic005G075500 Sobic003G420900 Sobic003G420900 Sobic010G154500--Sobic003G420900 Sobic001G306700 Sobic001G306700 Sobic010G154500--Sobic001G306700 Sobic002G340200 Sobic002G340200 Sobic010G154500--Sobic002G340200 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic010G143000--Sobic008G120132 Sobic010G143000--Sobic001G318100 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic010G143000--Sobic005G128800 Sobic009G214800 Sobic009G214800 Sobic010G143000--Sobic009G214800 Sobic010G115900 Sobic010G115900 Sobic010G143000--Sobic010G115900 Sobic001G353800 Sobic001G353800 Sobic010G143000--Sobic001G353800 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Octagon: transcription factors


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