Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G060166.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C5Z5E3
Pfam PF03171
Panther DB PTHR10209 PTHR10209:SF157
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G20400 : 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g07923.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ93389 , PNT65915 , PNT65916
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G318100 - -
2 Sobic.003G112001 - -
3 Sobic.010G165700 expressed protein K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
4 Sobic.002G272500 6-phosphogluconolactonase, putative, expressed K01057: PGLS, pgl, 6-phosphogluconolactonase
5 Sobic.002G381100 expressed protein -
6 Sobic.010G154500 - -
7 Sobic.008G032900 digestive organ expansion factor, putative, expressed K14774: UTP25, U3 small nucleolar RNA-associated protein 25
8 Sobic.002G162500 - -
9 Sobic.004G356200 expressed protein -
10 Sobic.003G351401 - -
11 Sobic.002G035300 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
12 Sobic.010G243600 - -
13 Sobic.002G340200 expressed protein -
14 Sobic.010G155600 DJ-1 family protein, putative, expressed K03152: protein deglycase
15 Sobic.001G528500 - -
16 Sobic.003G032600 - -
17 Sobic.002G137601 - -
18 Sobic.003G256600 - -
19 Sobic.001G503801 - -
20 Sobic.009G089101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G060166 Sobic010G060166 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic010G060166--Sobic001G318100 Sobic003G112001 Sobic003G112001 Sobic010G060166--Sobic003G112001 Sobic010G165700 Sobic010G165700 Sobic010G060166--Sobic010G165700 Sobic002G272500 Sobic002G272500 Sobic010G060166--Sobic002G272500 Sobic002G381100 Sobic002G381100 Sobic010G060166--Sobic002G381100 Sobic010G154500 Sobic010G154500 Sobic010G060166--Sobic010G154500 Sobic008G032900 Sobic008G032900 Sobic010G060166--Sobic008G032900 Sobic002G162500 Sobic002G162500 Sobic010G060166--Sobic002G162500 Sobic004G356200 Sobic004G356200 Sobic010G060166--Sobic004G356200 Sobic001G318100--Sobic010G165700 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic001G318100--Sobic010G143000 Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic001G318100--Sobic002G101100 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic001G318100--Sobic008G120132 Sobic010G165900 Sobic010G165900 Sobic001G318100--Sobic010G165900 Sobic005G075500 Sobic005G075500 Sobic001G318100--Sobic005G075500 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic001G318100--Sobic009G070250 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic001G318100--Sobic005G108225 Sobic008G127250 Sobic008G127250 Sobic001G318100--Sobic008G127250 Sobic003G134700 Sobic003G134700 Sobic003G112001--Sobic003G134700 Sobic009G074250 Sobic009G074250 Sobic003G112001--Sobic009G074250 Sobic009G097900 Sobic009G097900 Sobic003G112001--Sobic009G097900 Sobic009G093800 Sobic009G093800 Sobic003G112001--Sobic009G093800 Sobic003G112001--Sobic001G318100 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic003G112001--Sobic010G102366 Sobic003G112001--Sobic010G060166 Sobic001G192250 Sobic001G192250 Sobic003G112001--Sobic001G192250 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic003G112001--Sobic003G351401 Sobic010G165700--Sobic001G318100 Sobic010G165700--Sobic010G165900 Sobic010G165700--Sobic002G101100 Sobic005G098900 Sobic005G098900 Sobic010G165700--Sobic005G098900 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic010G165700--Sobic005G110547 Sobic002G013800 Sobic002G013800 Sobic010G165700--Sobic002G013800 Sobic010G165700--Sobic009G070250 Sobic005G102350 Sobic005G102350 Sobic010G165700--Sobic005G102350 Sobic010G165800 Sobic010G165800 Sobic010G165700--Sobic010G165800 Sobic001G503801 Sobic001G503801 Sobic002G272500--Sobic001G503801 Sobic006G050500 Sobic006G050500 Sobic002G272500--Sobic006G050500 Sobic001G290700 Sobic001G290700 Sobic002G272500--Sobic001G290700 Sobic002G035300 Sobic002G035300 Sobic002G272500--Sobic002G035300 Sobic003G420900 Sobic003G420900 Sobic002G272500--Sobic003G420900 Sobic007G165300 Sobic007G165300 Sobic002G272500--Sobic007G165300 Sobic005G031000 Sobic005G031000 Sobic002G272500--Sobic005G031000 Sobic002G272500--Sobic001G318100 Sobic003G392600 Sobic003G392600 Sobic002G272500--Sobic003G392600 Sobic006G135575 Sobic006G135575 Sobic002G381100--Sobic006G135575 Sobic002G381100--Sobic010G060166 Sobic001G361700 Sobic001G361700 Sobic002G381100--Sobic001G361700 Sobic001G344400 Sobic001G344400 Sobic002G381100--Sobic001G344400 Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic002G381100--Sobic005G145800 Sobic006G090400 Sobic006G090400 Sobic002G381100--Sobic006G090400 Sobic009G077200 Sobic009G077200 Sobic002G381100--Sobic009G077200 Sobic010G100200 Sobic010G100200 Sobic002G381100--Sobic010G100200 Sobic004G035700 Sobic004G035700 Sobic002G381100--Sobic004G035700 Sobic010G154500--Sobic010G143000 Sobic010G154500--Sobic001G318100 Sobic010G154500--Sobic009G097900 Sobic009G231100 Sobic009G231100 Sobic010G154500--Sobic009G231100 Sobic008G051100 Sobic008G051100 Sobic010G154500--Sobic008G051100 Sobic010G154500--Sobic005G075500 Sobic010G154500--Sobic003G420900 Sobic001G306700 Sobic001G306700 Sobic010G154500--Sobic001G306700 Sobic002G340200 Sobic002G340200 Sobic010G154500--Sobic002G340200 Sobic003G308500 Sobic003G308500 Sobic008G032900--Sobic003G308500 Sobic004G322300 Sobic004G322300 Sobic008G032900--Sobic004G322300 Sobic006G002800 Sobic006G002800 Sobic008G032900--Sobic006G002800 Sobic006G125500 Sobic006G125500 Sobic008G032900--Sobic006G125500 Sobic002G171300 Sobic002G171300 Sobic008G032900--Sobic002G171300 Sobic001G288700 Sobic001G288700 Sobic008G032900--Sobic001G288700 Sobic006G093300 Sobic006G093300 Sobic008G032900--Sobic006G093300 Sobic009G016400 Sobic009G016400 Sobic008G032900--Sobic009G016400 Sobic001G461300 Sobic001G461300 Sobic008G032900--Sobic001G461300 Sobic001G258900 Sobic001G258900 Sobic002G162500--Sobic001G258900 Sobic001G300900 Sobic001G300900 Sobic002G162500--Sobic001G300900 Sobic003G341700 Sobic003G341700 Sobic002G162500--Sobic003G341700 Sobic008G088842 Sobic008G088842 Sobic002G162500--Sobic008G088842 Sobic002G162500--Sobic002G340200 Sobic004G135900 Sobic004G135900 Sobic002G162500--Sobic004G135900 Sobic010G172000 Sobic010G172000 Sobic002G162500--Sobic010G172000 Sobic009G107080 Sobic009G107080 Sobic002G162500--Sobic009G107080 Sobic006G063001 Sobic006G063001 Sobic002G162500--Sobic006G063001 Sobic001G200200 Sobic001G200200 Sobic004G356200--Sobic001G200200 Sobic002G371600 Sobic002G371600 Sobic004G356200--Sobic002G371600 Sobic004G356200--Sobic005G031000 Sobic001G248100 Sobic001G248100 Sobic004G356200--Sobic001G248100 Sobic002G137601 Sobic002G137601 Sobic004G356200--Sobic002G137601 Sobic002G160700 Sobic002G160700 Sobic004G356200--Sobic002G160700 Sobic007G047600 Sobic007G047600 Sobic004G356200--Sobic007G047600 Sobic004G030400 Sobic004G030400 Sobic004G356200--Sobic004G030400 Sobic001G085800 Sobic001G085800 Sobic004G356200--Sobic001G085800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.