Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G089101.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P7U3
Pfam PF06842
Panther DB PTHR13229
NCBI CDD KOG3808; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G20165 : -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G032600 - -
2 Sobic.001G171900 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase precursor (Os)(PubMedID : 27208977)@glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed K01126: E3.1.4.46, glpQ, glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
3 Sobic.001G078400 OsSigP2 - Putative Type I Signal Peptidase homologue@ employs a putative Ser/Lys catalytic dyad, expressed K03100: signal peptidase I
4 Sobic.004G016400 CDP-alcohol phosphatidyltransferase, putative, expressed K00993: ethanolaminephosphotransferase
5 Sobic.005G100250 - -
6 Sobic.007G029700 BTBN17 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
7 Sobic.002G237800 NOL1/NOP2/sun family protein, putative, expressed K03500: rsmB, 16S rRNA (cytosine967-C5)-methyltransferase
8 Sobic.003G351401 - -
9 Sobic.004G307400 peptidase, M24 family protein, putative, expressed K01265: methionyl aminopeptidase
10 Sobic.002G120700 decarboxylase, putative, expressed K01592: tyrosine decarboxylase
11 Sobic.001G250700 expressed protein -
12 Sobic.K031800 inositol-1-monophosphatase, putative, expressed K01082: cysQ, MET22, 3'(2'), 5'-bisphosphate nucleotidase
13 Sobic.010G055000 OsWAK63 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
14 Sobic.001G536800 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed K03768: PPIB, peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B (cyclophilin B)
15 Sobic.002G030500 Reticulon family protein(PubMedID : 26465154)@reticulon domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.008G000400 GHMP kinases ATP-binding protein, putative, expressed K16190: glucuronokinase
17 Sobic.002G098800 peroxiredoxin, putative, expressed -
18 Sobic.002G145000 DNA-directed RNA polymerase subunit, putative, expressed K03011: RPB3, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3
19 Sobic.005G149400 maf, putative, expressed K06287: septum formation protein
20 Sobic.006G225100 OsFBDUF17 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G089101 Sobic009G089101 Sobic003G032600 Sobic003G032600 Sobic009G089101--Sobic003G032600 Sobic001G171900 Sobic001G171900 Sobic009G089101--Sobic001G171900 Sobic001G078400 Sobic001G078400 Sobic009G089101--Sobic001G078400 Sobic004G016400 Sobic004G016400 Sobic009G089101--Sobic004G016400 Sobic005G100250 Sobic005G100250 Sobic009G089101--Sobic005G100250 Sobic007G029700 Sobic007G029700 Sobic009G089101--Sobic007G029700 Sobic002G237800 Sobic002G237800 Sobic009G089101--Sobic002G237800 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic009G089101--Sobic003G351401 Sobic004G307400 Sobic004G307400 Sobic009G089101--Sobic004G307400 Sobic001G248100 Sobic001G248100 Sobic003G032600--Sobic001G248100 Sobic001G431400 Sobic001G431400 Sobic003G032600--Sobic001G431400 Sobic004G356200 Sobic004G356200 Sobic003G032600--Sobic004G356200 Sobic009G124900 Sobic009G124900 Sobic003G032600--Sobic009G124900 Sobic008G032900 Sobic008G032900 Sobic003G032600--Sobic008G032900 Sobic007G159200 Sobic007G159200 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Octagon: transcription factors


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