Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G381100.2
Synonym Sb02g039766
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W7D7
Pfam -
Panther DB PTHR36137 PTHR36137:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g47320.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G135575 - -
2 Sobic.010G060166 - -
3 Sobic.001G361700 expressed protein -
4 Sobic.001G344400 3-oxoacyl-synthase, putative, expressed K09458: fabF, OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II
5 Sobic.005G145800 - -
6 Sobic.006G090400 OsRR1 type-A response regulator, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
7 Sobic.009G077200 ribosomal protein L5, putative, expressed K02868: RP-L11e, large subunit ribosomal protein L11e
8 Sobic.010G100200 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed -
9 Sobic.004G035700 - -
10 Sobic.001G528500 - -
11 Sobic.003G199800 expressed protein -
12 Sobic.010G183032 - -
13 Sobic.002G040100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
14 Sobic.003G112001 - -
15 Sobic.010G183100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@agenet domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.010G108401 - -
17 Sobic.001G338500 ACT domain containing protein, expressed -
18 Sobic.002G098800 peroxiredoxin, putative, expressed -
19 Sobic.010G030800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@zinc finger family protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G297400 histone H3, putative, expressed K11253: histone H3


Gene co-expression network
sample Sobic002G381100 Sobic002G381100 Sobic006G135575 Sobic006G135575 Sobic002G381100--Sobic006G135575 Sobic010G060166 Sobic010G060166 Sobic002G381100--Sobic010G060166 Sobic001G361700 Sobic001G361700 Sobic002G381100--Sobic001G361700 Sobic001G344400 Sobic001G344400 Sobic002G381100--Sobic001G344400 Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic002G381100--Sobic005G145800 Sobic006G090400 Sobic006G090400 Sobic002G381100--Sobic006G090400 Sobic009G077200 Sobic009G077200 Sobic002G381100--Sobic009G077200 Sobic010G100200 Sobic010G100200 Sobic002G381100--Sobic010G100200 Sobic004G035700 Sobic004G035700 Sobic002G381100--Sobic004G035700 Sobic010G183100 Sobic010G183100 Sobic006G135575--Sobic010G183100 Sobic006G135575--Sobic004G035700 Sobic010G183032 Sobic010G183032 Sobic006G135575--Sobic010G183032 Sobic010G108401 Sobic010G108401 Sobic006G135575--Sobic010G108401 Sobic007G189700 Sobic007G189700 Sobic006G135575--Sobic007G189700 Sobic003G199800 Sobic003G199800 Sobic006G135575--Sobic003G199800 Sobic005G209400 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Sobic004G035700--Sobic010G038500 Sobic004G035700--Sobic002G040100 Sobic001G297400 Sobic001G297400 Sobic004G035700--Sobic001G297400
Octagon: transcription factors


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