Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G145800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PSI4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G035300 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
2 Sobic.010G028501 - -
3 Sobic.009G070250 - -
4 Sobic.005G127900 - -
5 Sobic.001G273000 MATE efflux family protein, putative, expressed K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
6 Sobic.008G120132 - -
7 Sobic.001G528400 tobamovirus multiplication protein, putative, expressed -
8 Sobic.009G093800 - -
9 Sobic.001G312400 - -
10 Sobic.002G236500 OsPOP19 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed -
11 Sobic.005G115350 - -
12 Sobic.001G528500 - -
13 Sobic.003G351401 - -
14 Sobic.005G102350 - -
15 Sobic.001G260300 - -
16 Sobic.002G381100 expressed protein -
17 Sobic.002G237800 NOL1/NOP2/sun family protein, putative, expressed K03500: rsmB, 16S rRNA (cytosine967-C5)-methyltransferase
18 Sobic.003G071901 - -
19 Sobic.002G393332 - -
20 Sobic.007G042300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic002G035300 Sobic002G035300 Sobic005G145800--Sobic002G035300 Sobic010G028501 Sobic010G028501 Sobic005G145800--Sobic010G028501 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic005G145800--Sobic009G070250 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic005G145800--Sobic005G127900 Sobic001G273000 Sobic001G273000 Sobic005G145800--Sobic001G273000 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic005G145800--Sobic008G120132 Sobic001G528400 Sobic001G528400 Sobic005G145800--Sobic001G528400 Sobic009G093800 Sobic009G093800 Sobic005G145800--Sobic009G093800 Sobic001G312400 Sobic001G312400 Sobic005G145800--Sobic001G312400 Sobic002G035300--Sobic005G145800 Sobic001G260300 Sobic001G260300 Sobic002G035300--Sobic001G260300 Sobic002G272500 Sobic002G272500 Sobic002G035300--Sobic002G272500 Sobic002G035300--Sobic009G070250 Sobic002G035300--Sobic001G273000 Sobic001G262800 Sobic001G262800 Sobic002G035300--Sobic001G262800 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic002G035300--Sobic001G091200 Sobic002G035300--Sobic008G120132 Sobic005G102350 Sobic005G102350 Sobic002G035300--Sobic005G102350 Sobic010G028501--Sobic005G145800 Sobic005G100250 Sobic005G100250 Sobic010G028501--Sobic005G100250 Sobic010G028501--Sobic001G528400 Sobic010G028501--Sobic009G070250 Sobic010G028501--Sobic005G127900 Sobic010G028501--Sobic008G120132 Sobic010G028501--Sobic002G035300 Sobic002G237800 Sobic002G237800 Sobic010G028501--Sobic002G237800 Sobic006G127350 Sobic006G127350 Sobic010G028501--Sobic006G127350 Sobic009G070250--Sobic005G127900 Sobic009G070250--Sobic008G120132 Sobic005G110547 Sobic005G110547 Sobic009G070250--Sobic005G110547 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic009G070250--Sobic001G318100 Sobic009G070250--Sobic005G145800 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic009G070250--Sobic005G128800 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic009G070250--Sobic005G108225 Sobic010G165700 Sobic010G165700 Sobic009G070250--Sobic010G165700 Sobic005G115350 Sobic005G115350 Sobic009G070250--Sobic005G115350 Sobic005G127900--Sobic009G070250 Sobic008G126500 Sobic008G126500 Sobic005G127900--Sobic008G126500 Sobic005G127900--Sobic005G108225 Sobic002G013800 Sobic002G013800 Sobic005G127900--Sobic002G013800 Sobic005G127900--Sobic005G110547 Sobic007G026900 Sobic007G026900 Sobic005G127900--Sobic007G026900 Sobic001G538100 Sobic001G538100 Sobic005G127900--Sobic001G538100 Sobic005G127900--Sobic008G120132 Sobic005G127900--Sobic005G145800 Sobic003G071901 Sobic003G071901 Sobic001G273000--Sobic003G071901 Sobic002G236500 Sobic002G236500 Sobic001G273000--Sobic002G236500 Sobic001G273000--Sobic002G035300 Sobic001G273000--Sobic005G145800 Sobic001G465500 Sobic001G465500 Sobic001G273000--Sobic001G465500 Sobic001G273000--Sobic001G091200 Sobic001G273000--Sobic005G115350 Sobic004G078500 Sobic004G078500 Sobic001G273000--Sobic004G078500 Sobic002G343000 Sobic002G343000 Sobic001G273000--Sobic002G343000 Sobic010G143000 Sobic010G143000 Sobic008G120132--Sobic010G143000 Sobic008G120132--Sobic005G128800 Sobic008G120132--Sobic001G318100 Sobic005G115400 Sobic005G115400 Sobic008G120132--Sobic005G115400 Sobic010G115900 Sobic010G115900 Sobic008G120132--Sobic010G115900 Sobic009G214800 Sobic009G214800 Sobic008G120132--Sobic009G214800 Sobic008G120132--Sobic009G070250 Sobic001G353800 Sobic001G353800 Sobic008G120132--Sobic001G353800 Sobic008G120132--Sobic005G108225 Sobic001G528500 Sobic001G528500 Sobic001G528400--Sobic001G528500 Sobic001G313900 Sobic001G313900 Sobic001G528400--Sobic001G313900 Sobic001G528400--Sobic005G145800 Sobic009G107080 Sobic009G107080 Sobic001G528400--Sobic009G107080 Sobic002G162500 Sobic002G162500 Sobic001G528400--Sobic002G162500 Sobic001G528400--Sobic010G028501 Sobic001G250700 Sobic001G250700 Sobic001G528400--Sobic001G250700 Sobic001G528400--Sobic002G035300 Sobic001G258900 Sobic001G258900 Sobic001G528400--Sobic001G258900 Sobic009G097900 Sobic009G097900 Sobic009G093800--Sobic009G097900 Sobic003G134700 Sobic003G134700 Sobic009G093800--Sobic003G134700 Sobic003G112001 Sobic003G112001 Sobic009G093800--Sobic003G112001 Sobic009G074250 Sobic009G074250 Sobic009G093800--Sobic009G074250 Sobic009G106000 Sobic009G106000 Sobic009G093800--Sobic009G106000 Sobic008G178450 Sobic008G178450 Sobic009G093800--Sobic008G178450 Sobic009G093800--Sobic005G127900 Sobic009G093800--Sobic009G070250 Sobic009G051800 Sobic009G051800 Sobic009G093800--Sobic009G051800 Sobic001G312400--Sobic001G260300 Sobic006G248350 Sobic006G248350 Sobic001G312400--Sobic006G248350 Sobic001G312400--Sobic008G120132 Sobic001G312400--Sobic005G128800 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic001G312400--Sobic003G351401 Sobic001G312400--Sobic005G145800 Sobic003G439900 Sobic003G439900 Sobic001G312400--Sobic003G439900 Sobic005G124300 Sobic005G124300 Sobic001G312400--Sobic005G124300 Sobic001G312400--Sobic001G262800
Octagon: transcription factors


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