Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G273000.3,Sobic.001G273000.2,Sobic.001G273000.1
Synonym Sb01g026730
Functional annotation MATE efflux family protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6QLD4 , A0A1B6QLD9 , A0A1Z5S7T5
Pfam PF01554
Panther DB PTHR11206 PTHR11206:SF174
NCBI CDD KOG1347; Uncharacterized membrane protein, predicted efflux pump
KEGG Orthology K03327; TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0015297antiporter activity GO:0006855drug transmembrane transport


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G47530 : MATE efflux family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g11860.1 : MATE efflux family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a003704
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.004G157100 "generic sugar transporter, up-regulated under drought stress "(PubMedID : 24655390)@SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
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20 Sobic.009G070250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G273000 Sobic001G273000 Sobic003G071901 Sobic003G071901 Sobic001G273000--Sobic003G071901 Sobic002G236500 Sobic002G236500 Sobic001G273000--Sobic002G236500 Sobic002G035300 Sobic002G035300 Sobic001G273000--Sobic002G035300 Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic001G273000--Sobic005G145800 Sobic001G465500 Sobic001G465500 Sobic001G273000--Sobic001G465500 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic001G273000--Sobic001G091200 Sobic005G115350 Sobic005G115350 Sobic001G273000--Sobic005G115350 Sobic004G078500 Sobic004G078500 Sobic001G273000--Sobic004G078500 Sobic002G343000 Sobic002G343000 Sobic001G273000--Sobic002G343000 Sobic010G152000 Sobic010G152000 Sobic003G071901--Sobic010G152000 Sobic007G192200 Sobic007G192200 Sobic003G071901--Sobic007G192200 Sobic005G036200 Sobic005G036200 Sobic003G071901--Sobic005G036200 Sobic002G420400 Sobic002G420400 Sobic003G071901--Sobic002G420400 Sobic007G026900 Sobic007G026900 Sobic003G071901--Sobic007G026900 Sobic003G379900 Sobic003G379900 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Octagon: transcription factors


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