Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G528400.1
Synonym TOM3
Functional annotation tobamovirus multiplication protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6QQW7
Pfam PF06454
Panther DB PTHR31142 PTHR31142:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G02180 : tobamovirus multiplication protein 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g02850.2 : tobamovirus multiplication protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053507 , Zm00025a052261
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G528500 - -
2 Sobic.001G313900 rhoGAP domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G145800 - -
4 Sobic.009G107080 - -
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6 Sobic.010G028501 - -
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8 Sobic.002G035300 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
9 Sobic.001G258900 - -
10 Sobic.004G144700 ABC transporter family protein, putative, expressed -
11 Sobic.003G217200 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G312400 - -
13 Sobic.006G169500 L-asparaginase precursor protein, putative, expressed K01444: AGA, N4-(beta-N-acetylglucosaminyl)-L-asparaginase
14 Sobic.001G260300 - -
15 Sobic.006G063001 - -
16 Sobic.010G163100 ribosomal protein L5, putative, expressed K02868: RP-L11e, large subunit ribosomal protein L11e
17 Sobic.009G089101 - -
18 Sobic.008G088875 - -
19 Sobic.010G237900 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G542450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G528400 Sobic001G528400 Sobic001G528500 Sobic001G528500 Sobic001G528400--Sobic001G528500 Sobic001G313900 Sobic001G313900 Sobic001G528400--Sobic001G313900 Sobic005G145800 Sobic005G145800 Sobic001G528400--Sobic005G145800 Sobic009G107080 Sobic009G107080 Sobic001G528400--Sobic009G107080 Sobic002G162500 Sobic002G162500 Sobic001G528400--Sobic002G162500 Sobic010G028501 Sobic010G028501 Sobic001G528400--Sobic010G028501 Sobic001G250700 Sobic001G250700 Sobic001G528400--Sobic001G250700 Sobic002G035300 Sobic002G035300 Sobic001G528400--Sobic002G035300 Sobic001G258900 Sobic001G258900 Sobic001G528400--Sobic001G258900 Sobic001G528500--Sobic001G528400 Sobic008G111200 Sobic008G111200 Sobic001G528500--Sobic008G111200 Sobic004G146100 Sobic004G146100 Sobic001G528500--Sobic004G146100 Sobic010G214500 Sobic010G214500 Sobic001G528500--Sobic010G214500 Sobic003G207500 Sobic003G207500 Sobic001G528500--Sobic003G207500 Sobic006G169500 Sobic006G169500 Sobic001G528500--Sobic006G169500 Sobic001G528500--Sobic009G107080 Sobic010G089800 Sobic010G089800 Sobic001G528500--Sobic010G089800 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic001G528500--Sobic003G351401 Sobic010G237900 Sobic010G237900 Sobic001G313900--Sobic010G237900 Sobic001G070600 Sobic001G070600 Sobic001G313900--Sobic001G070600 Sobic007G159900 Sobic007G159900 Sobic001G313900--Sobic007G159900 Sobic003G175100 Sobic003G175100 Sobic001G313900--Sobic003G175100 Sobic004G129300 Sobic004G129300 Sobic001G313900--Sobic004G129300 Sobic008G145800 Sobic008G145800 Sobic001G313900--Sobic008G145800 Sobic001G313900--Sobic001G250700 Sobic006G063001 Sobic006G063001 Sobic001G313900--Sobic006G063001 Sobic002G148750 Sobic002G148750 Sobic001G313900--Sobic002G148750 Sobic005G145800--Sobic002G035300 Sobic005G145800--Sobic010G028501 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic005G145800--Sobic009G070250 Sobic005G127900 Sobic005G127900 Sobic005G145800--Sobic005G127900 Sobic001G273000 Sobic001G273000 Sobic005G145800--Sobic001G273000 Sobic008G120132 Sobic008G120132 Sobic005G145800--Sobic008G120132 Sobic005G145800--Sobic001G528400 Sobic009G093800 Sobic009G093800 Sobic005G145800--Sobic009G093800 Sobic001G312400 Sobic001G312400 Sobic005G145800--Sobic001G312400 Sobic001G482200 Sobic001G482200 Sobic009G107080--Sobic001G482200 Sobic009G107080--Sobic001G258900 Sobic002G148400 Sobic002G148400 Sobic009G107080--Sobic002G148400 Sobic009G107080--Sobic002G162500 Sobic004G135900 Sobic004G135900 Sobic009G107080--Sobic004G135900 Sobic009G101000 Sobic009G101000 Sobic009G107080--Sobic009G101000 Sobic009G107080--Sobic006G063001 Sobic003G312700 Sobic003G312700 Sobic009G107080--Sobic003G312700 Sobic002G340200 Sobic002G340200 Sobic009G107080--Sobic002G340200 Sobic002G162500--Sobic001G258900 Sobic001G300900 Sobic001G300900 Sobic002G162500--Sobic001G300900 Sobic003G341700 Sobic003G341700 Sobic002G162500--Sobic003G341700 Sobic008G088842 Sobic008G088842 Sobic002G162500--Sobic008G088842 Sobic002G162500--Sobic002G340200 Sobic002G162500--Sobic004G135900 Sobic010G172000 Sobic010G172000 Sobic002G162500--Sobic010G172000 Sobic002G162500--Sobic009G107080 Sobic002G162500--Sobic006G063001 Sobic010G028501--Sobic005G145800 Sobic005G100250 Sobic005G100250 Sobic010G028501--Sobic005G100250 Sobic010G028501--Sobic001G528400 Sobic010G028501--Sobic009G070250 Sobic010G028501--Sobic005G127900 Sobic010G028501--Sobic008G120132 Sobic010G028501--Sobic002G035300 Sobic002G237800 Sobic002G237800 Sobic010G028501--Sobic002G237800 Sobic006G127350 Sobic006G127350 Sobic010G028501--Sobic006G127350 Sobic001G155400 Sobic001G155400 Sobic001G250700--Sobic001G155400 Sobic001G250700--Sobic010G237900 Sobic009G228000 Sobic009G228000 Sobic001G250700--Sobic009G228000 Sobic010G145800 Sobic010G145800 Sobic001G250700--Sobic010G145800 Sobic001G248100 Sobic001G248100 Sobic001G250700--Sobic001G248100 Sobic009G107300 Sobic009G107300 Sobic001G250700--Sobic009G107300 Sobic008G000400 Sobic008G000400 Sobic001G250700--Sobic008G000400 Sobic010G204900 Sobic010G204900 Sobic001G250700--Sobic010G204900 Sobic006G039400 Sobic006G039400 Sobic001G250700--Sobic006G039400 Sobic002G035300--Sobic005G145800 Sobic001G260300 Sobic001G260300 Sobic002G035300--Sobic001G260300 Sobic002G272500 Sobic002G272500 Sobic002G035300--Sobic002G272500 Sobic002G035300--Sobic009G070250 Sobic002G035300--Sobic001G273000 Sobic001G262800 Sobic001G262800 Sobic002G035300--Sobic001G262800 Sobic001G091200 Sobic001G091200 Sobic002G035300--Sobic001G091200 Sobic002G035300--Sobic008G120132 Sobic005G102350 Sobic005G102350 Sobic002G035300--Sobic005G102350 Sobic001G258900--Sobic002G162500 Sobic001G258900--Sobic010G172000 Sobic001G258900--Sobic003G341700 Sobic001G258900--Sobic009G107080 Sobic001G258900--Sobic006G063001 Sobic008G097600 Sobic008G097600 Sobic001G258900--Sobic008G097600 Sobic001G258900--Sobic001G300900 Sobic008G092532 Sobic008G092532 Sobic001G258900--Sobic008G092532 Sobic003G311600 Sobic003G311600 Sobic001G258900--Sobic003G311600
Octagon: transcription factors


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