Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G503801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SBB7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G08980 : Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g05430.1 : peptidase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000654
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G272500 6-phosphogluconolactonase, putative, expressed K01057: PGLS, pgl, 6-phosphogluconolactonase
2 Sobic.002G208400 regulator protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G212900 expressed protein K12606: RCD1, CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9
4 Sobic.009G216700 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14962: WDR82, SWD2, COMPASS component SWD2
5 Sobic.010G155600 DJ-1 family protein, putative, expressed K03152: protein deglycase
6 Sobic.003G166500 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G356200 expressed protein -
8 Sobic.004G030400 expressed protein -
9 Sobic.005G178300 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
10 Sobic.009G020100 hydrolase, NUDIX family, domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G388700 ribosomal protein L13, putative, expressed K02871: RP-L13, MRPL13, large subunit ribosomal protein L13
12 Sobic.006G050500 methylisocitrate lyase 2, putative, expressed -
13 Sobic.004G037200 cycloartenol synthase, putative, expressed K01853: cycloartenol synthase
14 Sobic.002G125800 phosphoglucomutase, putative, expressed -
15 Sobic.004G247100 peptidase, putative, expressed -
16 Sobic.001G200200 tetratricopeptide repeat, putative, expressed -
17 Sobic.008G097600 cyclin-T1-4, putative, expressed K15188: cyclin T
18 Sobic.003G023200 DNA repair protein Rad51, putative, expressed K10870: RAD51L2, RAD51-like protein 2
19 Sobic.003G129300 uridine kinase, putative, expressed -
20 Sobic.002G035300 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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