Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G051100.1
Synonym Sb08g004310
Functional annotation RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase ssu72, putative, expressed
UniProt C5YSM7
Pfam PF04722
Panther DB PTHR20383
NCBI CDD KOG2424; Protein involved in transcription start site selection
KEGG Orthology K15544; RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72
Gene Ontology GO:0006397; mRNA processing GO:0005634nucleus GO:0004721phosphoprotein phosphatase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G73820 : Ssu72-like family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07050.1 : RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase ssu72, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025764
Brachypodium KQJ92085
Barley HORVU5Hr1G036490.1 , HORVU5Hr1G036490.2
Wheat TraesCS5B02G118100 , TraesCS5A02G112700 , TraesCS5D02G129500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G051100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic008G051100 Sobic008G051100 Sobic004G117800 Sobic004G117800 Sobic008G051100--Sobic004G117800 Sobic008G103800 Sobic008G103800 Sobic008G051100--Sobic008G103800 Sobic001G280400 Sobic001G280400 Sobic008G051100--Sobic001G280400 Sobic004G184000 Sobic004G184000 Sobic008G051100--Sobic004G184000 Sobic004G206300 Sobic004G206300 Sobic008G051100--Sobic004G206300 Sobic003G167900 Sobic003G167900 Sobic008G051100--Sobic003G167900 Sobic006G020900 Sobic006G020900 Sobic008G051100--Sobic006G020900 Sobic001G099800 Sobic001G099800 Sobic008G051100--Sobic001G099800 Sobic001G408800 Sobic001G408800 Sobic008G051100--Sobic001G408800 Sobic006G170200 Sobic006G170200 Sobic004G117800--Sobic006G170200 Sobic004G117800--Sobic008G051100 Sobic009G029700 Sobic009G029700 Sobic004G117800--Sobic009G029700 Sobic004G117800--Sobic001G280400 Sobic004G136500 Sobic004G136500 Sobic004G117800--Sobic004G136500 Sobic001G008800 Sobic001G008800 Sobic004G117800--Sobic001G008800 Sobic001G132900 Sobic001G132900 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Octagon: transcription factors


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