Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G072300.1
Synonym Sb02g006090
Functional annotation 5-nucleotidase surE, putative, expressed
UniProt C5XCP3
Pfam PF01975
Panther DB PTHR30457
NCBI CDD -
KEGG Orthology K03787; 5'-nucleotidase
Gene Ontology GO:0016787; hydrolase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G14930 : Survival protein SurE-like phosphatase/nucleotidase
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g10460.1 : 5-nucleotidase surE, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045347
Brachypodium KQK20420
Barley -
Wheat TraesCS6B02G160800
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.002G072300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G113300 expressed protein -
2 Sobic.009G260700 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
3 Sobic.006G103700 tRNA synthetase, putative, expressed K01866: YARS, tyrosyl-tRNA synthetase
4 Sobic.006G170900 growth regulator related protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G014800 expressed protein -
6 Sobic.003G085500 signal peptidase complex subunit 3, putative, expressed K12948: SPCS3, signal peptidase complex subunit 3
7 Sobic.005G178300 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
8 Sobic.003G005900 abscisic acid insensitive 8, putative, expressed -
9 Sobic.001G533100 GHMP kinases ATP-binding protein, putative, expressed K05305: fucokinase
10 Sobic.001G518200 - K06928: nucleoside-triphosphatase
11 Sobic.002G125800 phosphoglucomutase, putative, expressed -
12 Sobic.002G386600 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
13 Sobic.005G018800 expressed protein -
14 Sobic.001G032200 transporter, major facilitator superfamily domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G202100 Uncharacterized ACR, COG1565 containing protein, putative, expressed K18164: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 7
16 Sobic.008G011300 GIY-YIG catalytic domain containing protein, putative, expressed K15078: structure-specific endonuclease subunit SLX1
17 Sobic.008G171400 phosphonate metabolism protein-related, putative, expressed -
18 Sobic.004G270300 - -
19 Sobic.008G051100 RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase ssu72, putative, expressed K15544: RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72
20 Sobic.001G250700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G072300 Sobic002G072300 Sobic003G113300 Sobic003G113300 Sobic002G072300--Sobic003G113300 Sobic009G260700 Sobic009G260700 Sobic002G072300--Sobic009G260700 Sobic006G103700 Sobic006G103700 Sobic002G072300--Sobic006G103700 Sobic006G170900 Sobic006G170900 Sobic002G072300--Sobic006G170900 Sobic002G014800 Sobic002G014800 Sobic002G072300--Sobic002G014800 Sobic003G085500 Sobic003G085500 Sobic002G072300--Sobic003G085500 Sobic005G178300 Sobic005G178300 Sobic002G072300--Sobic005G178300 Sobic003G005900 Sobic003G005900 Sobic002G072300--Sobic003G005900 Sobic001G533100 Sobic001G533100 Sobic002G072300--Sobic001G533100 Sobic009G122500 Sobic009G122500 Sobic003G113300--Sobic009G122500 Sobic002G296400 Sobic002G296400 Sobic003G113300--Sobic002G296400 Sobic003G113300--Sobic002G014800 Sobic001G474400 Sobic001G474400 Sobic003G113300--Sobic001G474400 Sobic001G030000 Sobic001G030000 Sobic003G113300--Sobic001G030000 Sobic005G114500 Sobic005G114500 Sobic003G113300--Sobic005G114500 Sobic007G030100 Sobic007G030100 Sobic003G113300--Sobic007G030100 Sobic003G393200 Sobic003G393200 Sobic003G113300--Sobic003G393200 Sobic001G051400 Sobic001G051400 Sobic003G113300--Sobic001G051400 Sobic003G202100 Sobic003G202100 Sobic009G260700--Sobic003G202100 Sobic008G171400 Sobic008G171400 Sobic009G260700--Sobic008G171400 Sobic001G304000 Sobic001G304000 Sobic009G260700--Sobic001G304000 Sobic001G537100 Sobic001G537100 Sobic009G260700--Sobic001G537100 Sobic002G395500 Sobic002G395500 Sobic009G260700--Sobic002G395500 Sobic006G220400 Sobic006G220400 Sobic009G260700--Sobic006G220400 Sobic001G389200 Sobic001G389200 Sobic009G260700--Sobic001G389200 Sobic003G166500 Sobic003G166500 Sobic009G260700--Sobic003G166500 Sobic008G168200 Sobic008G168200 Sobic009G260700--Sobic008G168200 Sobic006G103700--Sobic006G220400 Sobic006G103700--Sobic003G113300 Sobic006G103700--Sobic006G170900 Sobic004G122900 Sobic004G122900 Sobic006G103700--Sobic004G122900 Sobic004G060300 Sobic004G060300 Sobic006G103700--Sobic004G060300 Sobic001G043200 Sobic001G043200 Sobic006G103700--Sobic001G043200 Sobic001G335000 Sobic001G335000 Sobic006G103700--Sobic001G335000 Sobic006G103700--Sobic007G030100 Sobic001G521700 Sobic001G521700 Sobic006G103700--Sobic001G521700 Sobic005G123400 Sobic005G123400 Sobic006G170900--Sobic005G123400 Sobic003G124600 Sobic003G124600 Sobic006G170900--Sobic003G124600 Sobic006G170900--Sobic003G113300 Sobic007G034200 Sobic007G034200 Sobic006G170900--Sobic007G034200 Sobic006G170900--Sobic006G103700 Sobic002G292800 Sobic002G292800 Sobic006G170900--Sobic002G292800 Sobic003G194800 Sobic003G194800 Sobic006G170900--Sobic003G194800 Sobic004G106250 Sobic004G106250 Sobic006G170900--Sobic004G106250 Sobic006G237500 Sobic006G237500 Sobic006G170900--Sobic006G237500 Sobic002G014800--Sobic003G113300 Sobic002G014800--Sobic003G005900 Sobic004G345400 Sobic004G345400 Sobic002G014800--Sobic004G345400 Sobic009G129600 Sobic009G129600 Sobic002G014800--Sobic009G129600 Sobic003G016500 Sobic003G016500 Sobic002G014800--Sobic003G016500 Sobic002G014800--Sobic006G103700 Sobic005G040900 Sobic005G040900 Sobic002G014800--Sobic005G040900 Sobic001G123600 Sobic001G123600 Sobic002G014800--Sobic001G123600 Sobic002G014800--Sobic005G114500 Sobic001G485300 Sobic001G485300 Sobic003G085500--Sobic001G485300 Sobic001G352800 Sobic001G352800 Sobic003G085500--Sobic001G352800 Sobic010G002800 Sobic010G002800 Sobic003G085500--Sobic010G002800 Sobic004G354100 Sobic004G354100 Sobic003G085500--Sobic004G354100 Sobic007G022700 Sobic007G022700 Sobic003G085500--Sobic007G022700 Sobic002G392400 Sobic002G392400 Sobic003G085500--Sobic002G392400 Sobic002G276800 Sobic002G276800 Sobic003G085500--Sobic002G276800 Sobic003G388700 Sobic003G388700 Sobic003G085500--Sobic003G388700 Sobic004G186100 Sobic004G186100 Sobic003G085500--Sobic004G186100 Sobic006G050500 Sobic006G050500 Sobic005G178300--Sobic006G050500 Sobic002G199400 Sobic002G199400 Sobic005G178300--Sobic002G199400 Sobic005G178300--Sobic003G085500 Sobic005G178300--Sobic010G002800 Sobic007G165300 Sobic007G165300 Sobic005G178300--Sobic007G165300 Sobic006G259900 Sobic006G259900 Sobic005G178300--Sobic006G259900 Sobic005G178300--Sobic003G388700 Sobic005G112100 Sobic005G112100 Sobic005G178300--Sobic005G112100 Sobic010G258000 Sobic010G258000 Sobic005G178300--Sobic010G258000 Sobic003G005900--Sobic005G114500 Sobic003G130900 Sobic003G130900 Sobic003G005900--Sobic003G130900 Sobic006G265600 Sobic006G265600 Sobic003G005900--Sobic006G265600 Sobic003G293000 Sobic003G293000 Sobic003G005900--Sobic003G293000 Sobic003G005900--Sobic001G474400 Sobic004G151200 Sobic004G151200 Sobic003G005900--Sobic004G151200 Sobic001G012900 Sobic001G012900 Sobic003G005900--Sobic001G012900 Sobic003G005900--Sobic002G014800 Sobic009G207200 Sobic009G207200 Sobic003G005900--Sobic009G207200 Sobic002G125800 Sobic002G125800 Sobic001G533100--Sobic002G125800 Sobic005G031000 Sobic005G031000 Sobic001G533100--Sobic005G031000 Sobic004G034300 Sobic004G034300 Sobic001G533100--Sobic004G034300 Sobic004G336300 Sobic004G336300 Sobic001G533100--Sobic004G336300 Sobic001G533100--Sobic003G130900 Sobic002G426100 Sobic002G426100 Sobic001G533100--Sobic002G426100 Sobic005G129201 Sobic005G129201 Sobic001G533100--Sobic005G129201 Sobic007G173000 Sobic007G173000 Sobic001G533100--Sobic007G173000 Sobic001G533100--Sobic003G005900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.