Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G392600.1,Sobic.003G392600.3,Sobic.003G392600.2
Synonym Sb03g043010
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q7P5
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF9
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g03210.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G202100 Uncharacterized ACR, COG1565 containing protein, putative, expressed K18164: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 7
2 Sobic.006G020900 phosphoglycerate mutase, putative, expressed -
3 Sobic.001G304000 enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein, putative, expressed K05605: 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase
4 Sobic.003G388700 ribosomal protein L13, putative, expressed K02871: RP-L13, MRPL13, large subunit ribosomal protein L13
5 Sobic.002G071100 expressed protein K17408: DAP3, small subunit ribosomal protein S29
6 Sobic.005G018800 expressed protein -
7 Sobic.003G326900 expressed protein -
8 Sobic.009G260700 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
9 Sobic.001G537100 dehydrogenase-phosphopantetheinyltransferase, putative, expressed K06133: LYS5, 4'-phosphopantetheinyl transferase
10 Sobic.003G388900 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.008G087900 expressed protein -
12 Sobic.006G237200 vacuolar ATP synthase subunit D 1, putative, expressed K02149: ATPeV1D, V-type H+-transporting ATPase subunit D
13 Sobic.007G028500 expressed protein -
14 Sobic.003G304400 NLI interacting factor-like phosphatase, putative, expressed K17496: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50
15 Sobic.004G162500 SAM domain family protein, expressed -
16 Sobic.005G129201 - -
17 Sobic.006G041800 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed -
18 Sobic.009G256000 vacuolar ATP synthase subunit C, putative, expressed K02148: ATPeV1C, V-type H+-transporting ATPase subunit C
19 Sobic.002G199400 growth regulator related protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G119600 clathrin adaptor complex small chain domain containing protein, expressed K12403: AP-4 complex subunit sigma-1


Gene co-expression network
sample Sobic003G392600 Sobic003G392600 Sobic003G202100 Sobic003G202100 Sobic003G392600--Sobic003G202100 Sobic006G020900 Sobic006G020900 Sobic003G392600--Sobic006G020900 Sobic001G304000 Sobic001G304000 Sobic003G392600--Sobic001G304000 Sobic003G388700 Sobic003G388700 Sobic003G392600--Sobic003G388700 Sobic002G071100 Sobic002G071100 Sobic003G392600--Sobic002G071100 Sobic005G018800 Sobic005G018800 Sobic003G392600--Sobic005G018800 Sobic003G326900 Sobic003G326900 Sobic003G392600--Sobic003G326900 Sobic009G260700 Sobic009G260700 Sobic003G392600--Sobic009G260700 Sobic001G537100 Sobic001G537100 Sobic003G392600--Sobic001G537100 Sobic003G202100--Sobic009G260700 Sobic008G171400 Sobic008G171400 Sobic003G202100--Sobic008G171400 Sobic003G202100--Sobic001G304000 Sobic003G202100--Sobic001G537100 Sobic003G304400 Sobic003G304400 Sobic003G202100--Sobic003G304400 Sobic003G202100--Sobic003G392600 Sobic003G202100--Sobic002G071100 Sobic003G388900 Sobic003G388900 Sobic003G202100--Sobic003G388900 Sobic003G166500 Sobic003G166500 Sobic003G202100--Sobic003G166500 Sobic001G473400 Sobic001G473400 Sobic006G020900--Sobic001G473400 Sobic002G410700 Sobic002G410700 Sobic006G020900--Sobic002G410700 Sobic006G020900--Sobic003G388700 Sobic005G105500 Sobic005G105500 Sobic006G020900--Sobic005G105500 Sobic004G291400 Sobic004G291400 Sobic006G020900--Sobic004G291400 Sobic006G020900--Sobic001G304000 Sobic009G256000 Sobic009G256000 Sobic006G020900--Sobic009G256000 Sobic006G020900--Sobic003G392600 Sobic009G240700 Sobic009G240700 Sobic006G020900--Sobic009G240700 Sobic001G304000--Sobic003G202100 Sobic001G304000--Sobic008G171400 Sobic001G304000--Sobic005G018800 Sobic001G304000--Sobic002G071100 Sobic001G304000--Sobic003G388900 Sobic001G304000--Sobic006G020900 Sobic001G178500 Sobic001G178500 Sobic001G304000--Sobic001G178500 Sobic007G206300 Sobic007G206300 Sobic001G304000--Sobic007G206300 Sobic008G168200 Sobic008G168200 Sobic001G304000--Sobic008G168200 Sobic007G119600 Sobic007G119600 Sobic003G388700--Sobic007G119600 Sobic001G073600 Sobic001G073600 Sobic003G388700--Sobic001G073600 Sobic003G135600 Sobic003G135600 Sobic003G388700--Sobic003G135600 Sobic009G191400 Sobic009G191400 Sobic003G388700--Sobic009G191400 Sobic002G079700 Sobic002G079700 Sobic003G388700--Sobic002G079700 Sobic003G388700--Sobic001G473400 Sobic010G002800 Sobic010G002800 Sobic003G388700--Sobic010G002800 Sobic010G258000 Sobic010G258000 Sobic003G388700--Sobic010G258000 Sobic006G041800 Sobic006G041800 Sobic003G388700--Sobic006G041800 Sobic001G011000 Sobic001G011000 Sobic002G071100--Sobic001G011000 Sobic001G380600 Sobic001G380600 Sobic002G071100--Sobic001G380600 Sobic002G367800 Sobic002G367800 Sobic002G071100--Sobic002G367800 Sobic002G071100--Sobic003G202100 Sobic002G071100--Sobic001G304000 Sobic004G356300 Sobic004G356300 Sobic002G071100--Sobic004G356300 Sobic004G212100 Sobic004G212100 Sobic002G071100--Sobic004G212100 Sobic009G041800 Sobic009G041800 Sobic002G071100--Sobic009G041800 Sobic002G071100--Sobic003G388900 Sobic003G200800 Sobic003G200800 Sobic005G018800--Sobic003G200800 Sobic008G021200 Sobic008G021200 Sobic005G018800--Sobic008G021200 Sobic004G060100 Sobic004G060100 Sobic005G018800--Sobic004G060100 Sobic007G161200 Sobic007G161200 Sobic005G018800--Sobic007G161200 Sobic005G018800--Sobic009G256000 Sobic001G115700 Sobic001G115700 Sobic005G018800--Sobic001G115700 Sobic004G283600 Sobic004G283600 Sobic005G018800--Sobic004G283600 Sobic005G018800--Sobic001G304000 Sobic005G004100 Sobic005G004100 Sobic005G018800--Sobic005G004100 Sobic001G129400 Sobic001G129400 Sobic003G326900--Sobic001G129400 Sobic002G402500 Sobic002G402500 Sobic003G326900--Sobic002G402500 Sobic001G060300 Sobic001G060300 Sobic003G326900--Sobic001G060300 Sobic001G008800 Sobic001G008800 Sobic003G326900--Sobic001G008800 Sobic004G184000 Sobic004G184000 Sobic003G326900--Sobic004G184000 Sobic010G194200 Sobic010G194200 Sobic003G326900--Sobic010G194200 Sobic010G018000 Sobic010G018000 Sobic003G326900--Sobic010G018000 Sobic004G248900 Sobic004G248900 Sobic003G326900--Sobic004G248900 Sobic001G214900 Sobic001G214900 Sobic003G326900--Sobic001G214900 Sobic009G260700--Sobic003G202100 Sobic009G260700--Sobic008G171400 Sobic009G260700--Sobic001G304000 Sobic009G260700--Sobic001G537100 Sobic002G395500 Sobic002G395500 Sobic009G260700--Sobic002G395500 Sobic006G220400 Sobic006G220400 Sobic009G260700--Sobic006G220400 Sobic001G389200 Sobic001G389200 Sobic009G260700--Sobic001G389200 Sobic009G260700--Sobic003G166500 Sobic009G260700--Sobic008G168200 Sobic001G537100--Sobic003G202100 Sobic001G537100--Sobic008G171400 Sobic001G116500 Sobic001G116500 Sobic001G537100--Sobic001G116500 Sobic006G039400 Sobic006G039400 Sobic001G537100--Sobic006G039400 Sobic001G537100--Sobic005G018800 Sobic001G537100--Sobic009G260700 Sobic004G094700 Sobic004G094700 Sobic001G537100--Sobic004G094700 Sobic010G192600 Sobic010G192600 Sobic001G537100--Sobic010G192600 Sobic007G118500 Sobic007G118500 Sobic001G537100--Sobic007G118500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.