Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G180033.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RN85
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G180000 OsSPL15 - SBP-box gene family member, expressed -
2 Sobic.004G180066 - -
3 Sobic.007G208900 resistance protein LR10, putative, expressed -
4 Sobic.001G326100 expressed protein -
5 Sobic.001G362200 DHHC zinc finger domain containing protein, expressed K18932: palmitoyltransferase
6 Sobic.003G153000 galactosyltransferase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G287900 LYR motif containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G060300 endoplasmic oxidoreductin-1 precursor, putative, expressed K10950: ERO1-like protein alpha
9 Sobic.004G294800 remorin C-terminal domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.005G204800 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
11 Sobic.005G229800 expressed protein -
12 Sobic.002G427300 protein phosphotase protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G032900 endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.009G005100 - -
15 Sobic.005G114400 TBC domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G267900 - -
17 Sobic.001G518400 EF hand family protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G361300 CDPK - calcium/calmodulin dependent serine/threonine protein kinase 1(PubMedID : 31721651)@CAMK_CAMK_like.18 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
19 Sobic.003G109700 expressed protein -
20 Sobic.003G332100 histidine triad family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G180033 Sobic004G180033 Sobic004G180000 Sobic004G180000 Sobic004G180033--Sobic004G180000 Sobic004G180066 Sobic004G180066 Sobic004G180033--Sobic004G180066 Sobic007G208900 Sobic007G208900 Sobic004G180033--Sobic007G208900 Sobic001G326100 Sobic001G326100 Sobic004G180033--Sobic001G326100 Sobic001G362200 Sobic001G362200 Sobic004G180033--Sobic001G362200 Sobic003G153000 Sobic003G153000 Sobic004G180033--Sobic003G153000 Sobic004G287900 Sobic004G287900 Sobic004G180033--Sobic004G287900 Sobic003G060300 Sobic003G060300 Sobic004G180033--Sobic003G060300 Sobic004G294800 Sobic004G294800 Sobic004G180033--Sobic004G294800 Sobic004G180000--Sobic004G180033 Sobic009G005100 Sobic009G005100 Sobic004G180000--Sobic009G005100 Sobic004G180000--Sobic004G180066 Sobic004G180000--Sobic003G153000 Sobic004G180000--Sobic004G294800 Sobic003G439501 Sobic003G439501 Sobic004G180000--Sobic003G439501 Sobic002G396300 Sobic002G396300 Sobic004G180000--Sobic002G396300 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic004G180000--Sobic010G056000 Sobic002G336800 Sobic002G336800 Sobic004G180000--Sobic002G336800 Sobic004G180066--Sobic004G180033 Sobic004G180066--Sobic004G180000 Sobic007G174600 Sobic007G174600 Sobic004G180066--Sobic007G174600 Sobic004G278650 Sobic004G278650 Sobic004G180066--Sobic004G278650 Sobic004G135300 Sobic004G135300 Sobic004G180066--Sobic004G135300 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic004G180066--Sobic004G289600 Sobic006G042200 Sobic006G042200 Sobic004G180066--Sobic006G042200 Sobic005G099200 Sobic005G099200 Sobic004G180066--Sobic005G099200 Sobic007G054100 Sobic007G054100 Sobic004G180066--Sobic007G054100 Sobic001G539016 Sobic001G539016 Sobic007G208900--Sobic001G539016 Sobic003G196900 Sobic003G196900 Sobic007G208900--Sobic003G196900 Sobic007G203500 Sobic007G203500 Sobic007G208900--Sobic007G203500 Sobic002G301500 Sobic002G301500 Sobic007G208900--Sobic002G301500 Sobic007G208900--Sobic009G005100 Sobic008G002000 Sobic008G002000 Sobic007G208900--Sobic008G002000 Sobic001G383300 Sobic001G383300 Sobic007G208900--Sobic001G383300 Sobic009G103600 Sobic009G103600 Sobic007G208900--Sobic009G103600 Sobic001G532700 Sobic001G532700 Sobic007G208900--Sobic001G532700 Sobic009G067551 Sobic009G067551 Sobic001G326100--Sobic009G067551 Sobic005G204800 Sobic005G204800 Sobic001G326100--Sobic005G204800 Sobic005G229800 Sobic005G229800 Sobic001G326100--Sobic005G229800 Sobic001G326100--Sobic003G060300 Sobic006G180700 Sobic006G180700 Sobic001G326100--Sobic006G180700 Sobic009G044900 Sobic009G044900 Sobic001G326100--Sobic009G044900 Sobic005G114400 Sobic005G114400 Sobic001G326100--Sobic005G114400 Sobic001G326100--Sobic004G180033 Sobic001G326100--Sobic004G180000 Sobic003G332500 Sobic003G332500 Sobic001G362200--Sobic003G332500 Sobic003G109700 Sobic003G109700 Sobic001G362200--Sobic003G109700 Sobic006G032900 Sobic006G032900 Sobic001G362200--Sobic006G032900 Sobic001G102700 Sobic001G102700 Sobic001G362200--Sobic001G102700 Sobic001G515000 Sobic001G515000 Sobic001G362200--Sobic001G515000 Sobic004G192200 Sobic004G192200 Sobic001G362200--Sobic004G192200 Sobic004G072100 Sobic004G072100 Sobic001G362200--Sobic004G072100 Sobic002G134600 Sobic002G134600 Sobic001G362200--Sobic002G134600 Sobic007G183900 Sobic007G183900 Sobic001G362200--Sobic007G183900 Sobic002G233900 Sobic002G233900 Sobic003G153000--Sobic002G233900 Sobic001G518400 Sobic001G518400 Sobic003G153000--Sobic001G518400 Sobic009G100050 Sobic009G100050 Sobic003G153000--Sobic009G100050 Sobic001G267900 Sobic001G267900 Sobic003G153000--Sobic001G267900 Sobic003G380400 Sobic003G380400 Sobic003G153000--Sobic003G380400 Sobic008G011100 Sobic008G011100 Sobic003G153000--Sobic008G011100 Sobic006G044000 Sobic006G044000 Sobic003G153000--Sobic006G044000 Sobic001G219600 Sobic001G219600 Sobic003G153000--Sobic001G219600 Sobic001G170100 Sobic001G170100 Sobic003G153000--Sobic001G170100 Sobic006G233000 Sobic006G233000 Sobic004G287900--Sobic006G233000 Sobic002G356600 Sobic002G356600 Sobic004G287900--Sobic002G356600 Sobic006G271700 Sobic006G271700 Sobic004G287900--Sobic006G271700 Sobic002G305100 Sobic002G305100 Sobic004G287900--Sobic002G305100 Sobic004G173100 Sobic004G173100 Sobic004G287900--Sobic004G173100 Sobic002G235300 Sobic002G235300 Sobic004G287900--Sobic002G235300 Sobic007G165900 Sobic007G165900 Sobic004G287900--Sobic007G165900 Sobic006G233300 Sobic006G233300 Sobic004G287900--Sobic006G233300 Sobic001G527300 Sobic001G527300 Sobic004G287900--Sobic001G527300 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic003G060300--Sobic003G374500 Sobic003G060300--Sobic005G229800 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic003G060300--Sobic005G079700 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic003G060300--Sobic010G101700 Sobic010G033700 Sobic010G033700 Sobic003G060300--Sobic010G033700 Sobic003G060300--Sobic004G289600 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic003G060300--Sobic001G278600 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic003G060300--Sobic008G065400 Sobic002G387200 Sobic002G387200 Sobic003G060300--Sobic002G387200 Sobic009G132700 Sobic009G132700 Sobic004G294800--Sobic009G132700 Sobic004G284300 Sobic004G284300 Sobic004G294800--Sobic004G284300 Sobic005G027400 Sobic005G027400 Sobic004G294800--Sobic005G027400 Sobic010G079900 Sobic010G079900 Sobic004G294800--Sobic010G079900 Sobic003G398700 Sobic003G398700 Sobic004G294800--Sobic003G398700 Sobic004G130932 Sobic004G130932 Sobic004G294800--Sobic004G130932 Sobic003G355900 Sobic003G355900 Sobic004G294800--Sobic003G355900 Sobic001G222250 Sobic001G222250 Sobic004G294800--Sobic001G222250 Sobic010G021500 Sobic010G021500 Sobic004G294800--Sobic010G021500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.