Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G180000.1
Synonym Sb04g022950
Functional annotation OsSPL15 - SBP-box gene family member, expressed
UniProt A0A194YRH2
Pfam -
Panther DB PTHR31251 PTHR31251:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G76580 : Squamosa promoter-binding protein-like (SBP domain) transcription factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g40260.1 : OsSPL15 - SBP-box gene family member, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006080 , Zm00025a031029 , Zm00025a005131 , Zm00025a033821
Brachypodium -
Barley HORVU7Hr1G051400.7 , HORVU7Hr1G051400.3 , HORVU7Hr1G051400.2 , HORVU7Hr1G051400.8
Wheat TraesCS7B02G142200 , TraesCS7B02G142200 , TraesCS7A02G249100 , TraesCS7A02G249100 , TraesCS7A02G249100 , TraesCS7A02G249100 , TraesCS7D02G248000 , TraesCS7D02G248000 , TraesCS7D02G248000
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G180033 - -
2 Sobic.009G005100 - -
3 Sobic.004G180066 - -
4 Sobic.003G153000 galactosyltransferase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G294800 remorin C-terminal domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.003G439501 - -
7 Sobic.002G396300 OsDegp7 - Putative Deg protease homologue, expressed -
8 Sobic.010G056000 GAGA-binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G336800 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G276900 - -
11 Sobic.005G061601 - -
12 Sobic.001G362200 DHHC zinc finger domain containing protein, expressed K18932: palmitoyltransferase
13 Sobic.001G267900 - -
14 Sobic.006G180700 SNF2 family N-terminal domain containing protein, expressed K14439: SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1
15 Sobic.009G074700 heat shock protein binding protein, putative, expressed K09540: SEC63, translocation protein SEC63
16 Sobic.001G518400 EF hand family protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G060300 endoplasmic oxidoreductin-1 precursor, putative, expressed K10950: ERO1-like protein alpha
18 Sobic.006G138000 expressed protein -
19 Sobic.001G319400 - -
20 Sobic.009G100050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G180000 Sobic004G180000 Sobic004G180033 Sobic004G180033 Sobic004G180000--Sobic004G180033 Sobic009G005100 Sobic009G005100 Sobic004G180000--Sobic009G005100 Sobic004G180066 Sobic004G180066 Sobic004G180000--Sobic004G180066 Sobic003G153000 Sobic003G153000 Sobic004G180000--Sobic003G153000 Sobic004G294800 Sobic004G294800 Sobic004G180000--Sobic004G294800 Sobic003G439501 Sobic003G439501 Sobic004G180000--Sobic003G439501 Sobic002G396300 Sobic002G396300 Sobic004G180000--Sobic002G396300 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic004G180000--Sobic010G056000 Sobic002G336800 Sobic002G336800 Sobic004G180000--Sobic002G336800 Sobic004G180033--Sobic004G180000 Sobic004G180033--Sobic004G180066 Sobic007G208900 Sobic007G208900 Sobic004G180033--Sobic007G208900 Sobic001G326100 Sobic001G326100 Sobic004G180033--Sobic001G326100 Sobic001G362200 Sobic001G362200 Sobic004G180033--Sobic001G362200 Sobic004G180033--Sobic003G153000 Sobic004G287900 Sobic004G287900 Sobic004G180033--Sobic004G287900 Sobic003G060300 Sobic003G060300 Sobic004G180033--Sobic003G060300 Sobic004G180033--Sobic004G294800 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic009G005100--Sobic002G158700 Sobic002G396000 Sobic002G396000 Sobic009G005100--Sobic002G396000 Sobic001G542700 Sobic001G542700 Sobic009G005100--Sobic001G542700 Sobic007G061700 Sobic007G061700 Sobic009G005100--Sobic007G061700 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic009G005100--Sobic006G209850 Sobic001G219600 Sobic001G219600 Sobic009G005100--Sobic001G219600 Sobic003G401000 Sobic003G401000 Sobic009G005100--Sobic003G401000 Sobic001G539016 Sobic001G539016 Sobic009G005100--Sobic001G539016 Sobic001G167200 Sobic001G167200 Sobic009G005100--Sobic001G167200 Sobic004G180066--Sobic004G180033 Sobic004G180066--Sobic004G180000 Sobic007G174600 Sobic007G174600 Sobic004G180066--Sobic007G174600 Sobic004G278650 Sobic004G278650 Sobic004G180066--Sobic004G278650 Sobic004G135300 Sobic004G135300 Sobic004G180066--Sobic004G135300 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic004G180066--Sobic004G289600 Sobic006G042200 Sobic006G042200 Sobic004G180066--Sobic006G042200 Sobic005G099200 Sobic005G099200 Sobic004G180066--Sobic005G099200 Sobic007G054100 Sobic007G054100 Sobic004G180066--Sobic007G054100 Sobic002G233900 Sobic002G233900 Sobic003G153000--Sobic002G233900 Sobic001G518400 Sobic001G518400 Sobic003G153000--Sobic001G518400 Sobic009G100050 Sobic009G100050 Sobic003G153000--Sobic009G100050 Sobic001G267900 Sobic001G267900 Sobic003G153000--Sobic001G267900 Sobic003G380400 Sobic003G380400 Sobic003G153000--Sobic003G380400 Sobic008G011100 Sobic008G011100 Sobic003G153000--Sobic008G011100 Sobic006G044000 Sobic006G044000 Sobic003G153000--Sobic006G044000 Sobic003G153000--Sobic001G219600 Sobic001G170100 Sobic001G170100 Sobic003G153000--Sobic001G170100 Sobic009G132700 Sobic009G132700 Sobic004G294800--Sobic009G132700 Sobic004G284300 Sobic004G284300 Sobic004G294800--Sobic004G284300 Sobic005G027400 Sobic005G027400 Sobic004G294800--Sobic005G027400 Sobic010G079900 Sobic010G079900 Sobic004G294800--Sobic010G079900 Sobic003G398700 Sobic003G398700 Sobic004G294800--Sobic003G398700 Sobic004G130932 Sobic004G130932 Sobic004G294800--Sobic004G130932 Sobic003G355900 Sobic003G355900 Sobic004G294800--Sobic003G355900 Sobic001G222250 Sobic001G222250 Sobic004G294800--Sobic001G222250 Sobic010G021500 Sobic010G021500 Sobic004G294800--Sobic010G021500 Sobic009G028901 Sobic009G028901 Sobic003G439501--Sobic009G028901 Sobic001G186850 Sobic001G186850 Sobic003G439501--Sobic001G186850 Sobic003G088700 Sobic003G088700 Sobic003G439501--Sobic003G088700 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic003G439501--Sobic001G111900 Sobic004G039700 Sobic004G039700 Sobic003G439501--Sobic004G039700 Sobic007G189500 Sobic007G189500 Sobic003G439501--Sobic007G189500 Sobic004G003501 Sobic004G003501 Sobic003G439501--Sobic004G003501 Sobic006G051700 Sobic006G051700 Sobic003G439501--Sobic006G051700 Sobic003G439501--Sobic010G056000 Sobic002G398700 Sobic002G398700 Sobic002G396300--Sobic002G398700 Sobic002G092050 Sobic002G092050 Sobic002G396300--Sobic002G092050 Sobic004G171200 Sobic004G171200 Sobic002G396300--Sobic004G171200 Sobic001G466500 Sobic001G466500 Sobic002G396300--Sobic001G466500 Sobic003G014700 Sobic003G014700 Sobic002G396300--Sobic003G014700 Sobic002G364900 Sobic002G364900 Sobic002G396300--Sobic002G364900 Sobic002G396300--Sobic004G180000 Sobic002G344500 Sobic002G344500 Sobic002G396300--Sobic002G344500 Sobic005G012700 Sobic005G012700 Sobic002G396300--Sobic005G012700 Sobic010G056000--Sobic001G111900 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic010G056000--Sobic003G084900 Sobic010G028800 Sobic010G028800 Sobic010G056000--Sobic010G028800 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic010G056000--Sobic009G127900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic010G056000--Sobic003G087400 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic010G056000--Sobic003G187400 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic010G056000--Sobic005G077466 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic010G056000--Sobic001G094000 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic010G056000--Sobic002G157300 Sobic005G079025 Sobic005G079025 Sobic002G336800--Sobic005G079025 Sobic002G336800--Sobic008G011100 Sobic004G087600 Sobic004G087600 Sobic002G336800--Sobic004G087600 Sobic003G144950 Sobic003G144950 Sobic002G336800--Sobic003G144950 Sobic006G078600 Sobic006G078600 Sobic002G336800--Sobic006G078600 Sobic002G336800--Sobic009G005100 Sobic009G007800 Sobic009G007800 Sobic002G336800--Sobic009G007800 Sobic001G360900 Sobic001G360900 Sobic002G336800--Sobic001G360900 Sobic009G103600 Sobic009G103600 Sobic002G336800--Sobic009G103600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.