Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G180066.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RN68
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G180033 - -
2 Sobic.004G180000 OsSPL15 - SBP-box gene family member, expressed -
3 Sobic.007G174600 glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed -
4 Sobic.004G278650 - -
5 Sobic.004G135300 - -
6 Sobic.004G289600 - -
7 Sobic.006G042200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./middle senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@MATE efflux family protein, putative, expressed K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
8 Sobic.005G099200 - -
9 Sobic.007G054100 stress-induced protein, putative, expressed -
10 Sobic.004G192200 choline transporter-related, putative, expressed -
11 Sobic.007G010000 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
12 Sobic.004G294800 remorin C-terminal domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.009G057700 metal cation transporter, putative, expressed K14709: SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3
14 Sobic.001G261496 - -
15 Sobic.003G061000 ribosomal protein L3, putative, expressed K02906: RP-L3, MRPL3, large subunit ribosomal protein L3
16 Sobic.005G204800 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
17 Sobic.006G098100 protein phosphotase protein, putative, expressed -
18 Sobic.007G207500 expressed protein -
19 Sobic.007G061900 - -
20 Sobic.002G272350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G180066 Sobic004G180066 Sobic004G180033 Sobic004G180033 Sobic004G180066--Sobic004G180033 Sobic004G180000 Sobic004G180000 Sobic004G180066--Sobic004G180000 Sobic007G174600 Sobic007G174600 Sobic004G180066--Sobic007G174600 Sobic004G278650 Sobic004G278650 Sobic004G180066--Sobic004G278650 Sobic004G135300 Sobic004G135300 Sobic004G180066--Sobic004G135300 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic004G180066--Sobic004G289600 Sobic006G042200 Sobic006G042200 Sobic004G180066--Sobic006G042200 Sobic005G099200 Sobic005G099200 Sobic004G180066--Sobic005G099200 Sobic007G054100 Sobic007G054100 Sobic004G180066--Sobic007G054100 Sobic004G180033--Sobic004G180000 Sobic004G180033--Sobic004G180066 Sobic007G208900 Sobic007G208900 Sobic004G180033--Sobic007G208900 Sobic001G326100 Sobic001G326100 Sobic004G180033--Sobic001G326100 Sobic001G362200 Sobic001G362200 Sobic004G180033--Sobic001G362200 Sobic003G153000 Sobic003G153000 Sobic004G180033--Sobic003G153000 Sobic004G287900 Sobic004G287900 Sobic004G180033--Sobic004G287900 Sobic003G060300 Sobic003G060300 Sobic004G180033--Sobic003G060300 Sobic004G294800 Sobic004G294800 Sobic004G180033--Sobic004G294800 Sobic004G180000--Sobic004G180033 Sobic009G005100 Sobic009G005100 Sobic004G180000--Sobic009G005100 Sobic004G180000--Sobic004G180066 Sobic004G180000--Sobic003G153000 Sobic004G180000--Sobic004G294800 Sobic003G439501 Sobic003G439501 Sobic004G180000--Sobic003G439501 Sobic002G396300 Sobic002G396300 Sobic004G180000--Sobic002G396300 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic004G180000--Sobic010G056000 Sobic002G336800 Sobic002G336800 Sobic004G180000--Sobic002G336800 Sobic007G174600--Sobic006G042200 Sobic007G222900 Sobic007G222900 Sobic007G174600--Sobic007G222900 Sobic002G175900 Sobic002G175900 Sobic007G174600--Sobic002G175900 Sobic002G040800 Sobic002G040800 Sobic007G174600--Sobic002G040800 Sobic004G194700 Sobic004G194700 Sobic007G174600--Sobic004G194700 Sobic010G228700 Sobic010G228700 Sobic007G174600--Sobic010G228700 Sobic007G174600--Sobic004G180066 Sobic002G290300 Sobic002G290300 Sobic007G174600--Sobic002G290300 Sobic004G010101 Sobic004G010101 Sobic007G174600--Sobic004G010101 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic004G278650--Sobic009G067501 Sobic004G278650--Sobic004G289600 Sobic004G278650--Sobic006G042200 Sobic003G088700 Sobic003G088700 Sobic004G278650--Sobic003G088700 Sobic003G190300 Sobic003G190300 Sobic004G278650--Sobic003G190300 Sobic006G028250 Sobic006G028250 Sobic004G278650--Sobic006G028250 Sobic003G205801 Sobic003G205801 Sobic004G278650--Sobic003G205801 Sobic004G278650--Sobic004G135300 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic004G278650--Sobic008G125600 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic004G135300--Sobic003G084900 Sobic001G222250 Sobic001G222250 Sobic004G135300--Sobic001G222250 Sobic004G135300--Sobic006G042200 Sobic001G409600 Sobic001G409600 Sobic004G135300--Sobic001G409600 Sobic006G273200 Sobic006G273200 Sobic004G135300--Sobic006G273200 Sobic004G135300--Sobic003G088700 Sobic005G128400 Sobic005G128400 Sobic004G135300--Sobic005G128400 Sobic007G009400 Sobic007G009400 Sobic004G135300--Sobic007G009400 Sobic001G267900 Sobic001G267900 Sobic004G135300--Sobic001G267900 Sobic008G065800 Sobic008G065800 Sobic004G289600--Sobic008G065800 Sobic004G289600--Sobic008G125600 Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic004G289600--Sobic001G022100 Sobic003G020600 Sobic003G020600 Sobic004G289600--Sobic003G020600 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic004G289600--Sobic006G068400 Sobic010G033700 Sobic010G033700 Sobic004G289600--Sobic010G033700 Sobic004G289600--Sobic009G067501 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic004G289600--Sobic008G106600 Sobic008G189400 Sobic008G189400 Sobic004G289600--Sobic008G189400 Sobic006G042200--Sobic004G135300 Sobic006G042200--Sobic007G054100 Sobic006G042200--Sobic001G222250 Sobic004G174900 Sobic004G174900 Sobic006G042200--Sobic004G174900 Sobic006G042200--Sobic008G125600 Sobic006G042200--Sobic004G010101 Sobic009G008100 Sobic009G008100 Sobic006G042200--Sobic009G008100 Sobic002G073900 Sobic002G073900 Sobic006G042200--Sobic002G073900 Sobic006G042200--Sobic002G040800 Sobic006G066000 Sobic006G066000 Sobic005G099200--Sobic006G066000 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic005G099200--Sobic004G045566 Sobic005G022300 Sobic005G022300 Sobic005G099200--Sobic005G022300 Sobic010G015000 Sobic010G015000 Sobic005G099200--Sobic010G015000 Sobic006G067100 Sobic006G067100 Sobic005G099200--Sobic006G067100 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic005G099200--Sobic005G099150 Sobic004G185500 Sobic004G185500 Sobic005G099200--Sobic004G185500 Sobic005G099200--Sobic004G289600 Sobic002G146900 Sobic002G146900 Sobic005G099200--Sobic002G146900 Sobic003G308700 Sobic003G308700 Sobic007G054100--Sobic003G308700 Sobic007G054100--Sobic006G042200 Sobic002G273700 Sobic002G273700 Sobic007G054100--Sobic002G273700 Sobic007G054100--Sobic002G073900 Sobic003G153800 Sobic003G153800 Sobic007G054100--Sobic003G153800 Sobic002G174900 Sobic002G174900 Sobic007G054100--Sobic002G174900 Sobic002G187801 Sobic002G187801 Sobic007G054100--Sobic002G187801 Sobic004G096300 Sobic004G096300 Sobic007G054100--Sobic004G096300 Sobic005G090600 Sobic005G090600 Sobic007G054100--Sobic005G090600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.