Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G061900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PFX1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.007G061900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G204800 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
2 Sobic.001G326100 expressed protein -
3 Sobic.004G180000 OsSPL15 - SBP-box gene family member, expressed -
4 Sobic.003G061000 ribosomal protein L3, putative, expressed K02906: RP-L3, MRPL3, large subunit ribosomal protein L3
5 Sobic.010G268200 zinc finger, C3HC4 type, domain containing protein, expressed -
6 Sobic.003G334900 - -
7 Sobic.001G003500 la domain containing protein, putative, expressed K18757: la-related protein 1
8 Sobic.004G291000 scarecrow, putative, expressed -
9 Sobic.007G197400 pentatricopeptide, putative, expressed -
10 Sobic.004G180066 - -
11 Sobic.004G278650 - -
12 Sobic.003G085600 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
13 Sobic.008G080000 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G294800 remorin C-terminal domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G128101 - -
16 Sobic.007G017200 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G289600 - -
18 Sobic.005G046900 expressed protein K08331: autophagy-related protein 13
19 Sobic.004G287900 LYR motif containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G028001 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G061900 Sobic007G061900 Sobic005G204800 Sobic005G204800 Sobic007G061900--Sobic005G204800 Sobic001G326100 Sobic001G326100 Sobic007G061900--Sobic001G326100 Sobic004G180000 Sobic004G180000 Sobic007G061900--Sobic004G180000 Sobic003G061000 Sobic003G061000 Sobic007G061900--Sobic003G061000 Sobic010G268200 Sobic010G268200 Sobic007G061900--Sobic010G268200 Sobic003G334900 Sobic003G334900 Sobic007G061900--Sobic003G334900 Sobic001G003500 Sobic001G003500 Sobic007G061900--Sobic001G003500 Sobic004G291000 Sobic004G291000 Sobic007G061900--Sobic004G291000 Sobic007G197400 Sobic007G197400 Sobic007G061900--Sobic007G197400 Sobic005G204800--Sobic001G326100 Sobic005G229800 Sobic005G229800 Sobic005G204800--Sobic005G229800 Sobic006G072501 Sobic006G072501 Sobic005G204800--Sobic006G072501 Sobic010G004400 Sobic010G004400 Sobic005G204800--Sobic010G004400 Sobic006G180700 Sobic006G180700 Sobic005G204800--Sobic006G180700 Sobic003G060300 Sobic003G060300 Sobic005G204800--Sobic003G060300 Sobic003G259600 Sobic003G259600 Sobic005G204800--Sobic003G259600 Sobic005G204800--Sobic003G061000 Sobic005G204800--Sobic007G061900 Sobic009G067551 Sobic009G067551 Sobic001G326100--Sobic009G067551 Sobic001G326100--Sobic005G204800 Sobic001G326100--Sobic005G229800 Sobic001G326100--Sobic003G060300 Sobic001G326100--Sobic006G180700 Sobic009G044900 Sobic009G044900 Sobic001G326100--Sobic009G044900 Sobic005G114400 Sobic005G114400 Sobic001G326100--Sobic005G114400 Sobic004G180033 Sobic004G180033 Sobic001G326100--Sobic004G180033 Sobic001G326100--Sobic004G180000 Sobic004G180000--Sobic004G180033 Sobic009G005100 Sobic009G005100 Sobic004G180000--Sobic009G005100 Sobic004G180066 Sobic004G180066 Sobic004G180000--Sobic004G180066 Sobic003G153000 Sobic003G153000 Sobic004G180000--Sobic003G153000 Sobic004G294800 Sobic004G294800 Sobic004G180000--Sobic004G294800 Sobic003G439501 Sobic003G439501 Sobic004G180000--Sobic003G439501 Sobic002G396300 Sobic002G396300 Sobic004G180000--Sobic002G396300 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic004G180000--Sobic010G056000 Sobic002G336800 Sobic002G336800 Sobic004G180000--Sobic002G336800 Sobic010G143200 Sobic010G143200 Sobic003G061000--Sobic010G143200 Sobic002G095900 Sobic002G095900 Sobic003G061000--Sobic002G095900 Sobic007G000400 Sobic007G000400 Sobic003G061000--Sobic007G000400 Sobic006G066000 Sobic006G066000 Sobic003G061000--Sobic006G066000 Sobic001G261496 Sobic001G261496 Sobic003G061000--Sobic001G261496 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic003G061000--Sobic008G091671 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic003G061000--Sobic003G159450 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic003G061000--Sobic007G112900 Sobic008G056900 Sobic008G056900 Sobic003G061000--Sobic008G056900 Sobic003G026700 Sobic003G026700 Sobic010G268200--Sobic003G026700 Sobic002G136900 Sobic002G136900 Sobic010G268200--Sobic002G136900 Sobic010G268200--Sobic002G095900 Sobic008G000900 Sobic008G000900 Sobic010G268200--Sobic008G000900 Sobic001G341800 Sobic001G341800 Sobic010G268200--Sobic001G341800 Sobic006G042200 Sobic006G042200 Sobic010G268200--Sobic006G042200 Sobic008G177850 Sobic008G177850 Sobic010G268200--Sobic008G177850 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic010G268200--Sobic008G125600 Sobic001G279200 Sobic001G279200 Sobic010G268200--Sobic001G279200 Sobic001G239300 Sobic001G239300 Sobic003G334900--Sobic001G239300 Sobic007G037301 Sobic007G037301 Sobic003G334900--Sobic007G037301 Sobic003G357166 Sobic003G357166 Sobic003G334900--Sobic003G357166 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic003G334900--Sobic002G431200 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic003G334900--Sobic003G374500 Sobic005G061601 Sobic005G061601 Sobic003G334900--Sobic005G061601 Sobic006G057733 Sobic006G057733 Sobic003G334900--Sobic006G057733 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic003G334900--Sobic009G121750 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic003G334900--Sobic003G366850 Sobic004G321700 Sobic004G321700 Sobic001G003500--Sobic004G321700 Sobic008G147200 Sobic008G147200 Sobic001G003500--Sobic008G147200 Sobic002G052700 Sobic002G052700 Sobic001G003500--Sobic002G052700 Sobic001G291800 Sobic001G291800 Sobic001G003500--Sobic001G291800 Sobic005G220000 Sobic005G220000 Sobic001G003500--Sobic005G220000 Sobic010G007100 Sobic010G007100 Sobic001G003500--Sobic010G007100 Sobic004G357400 Sobic004G357400 Sobic001G003500--Sobic004G357400 Sobic004G095300 Sobic004G095300 Sobic001G003500--Sobic004G095300 Sobic006G125900 Sobic006G125900 Sobic001G003500--Sobic006G125900 Sobic007G183900 Sobic007G183900 Sobic004G291000--Sobic007G183900 Sobic001G267900 Sobic001G267900 Sobic004G291000--Sobic001G267900 Sobic005G021500 Sobic005G021500 Sobic004G291000--Sobic005G021500 Sobic001G425800 Sobic001G425800 Sobic004G291000--Sobic001G425800 Sobic009G195200 Sobic009G195200 Sobic004G291000--Sobic009G195200 Sobic001G533700 Sobic001G533700 Sobic004G291000--Sobic001G533700 Sobic004G158200 Sobic004G158200 Sobic004G291000--Sobic004G158200 Sobic001G362200 Sobic001G362200 Sobic004G291000--Sobic001G362200 Sobic007G191700 Sobic007G191700 Sobic004G291000--Sobic007G191700 Sobic003G085600 Sobic003G085600 Sobic007G197400--Sobic003G085600 Sobic007G197400--Sobic008G056900 Sobic002G408600 Sobic002G408600 Sobic007G197400--Sobic002G408600 Sobic001G485600 Sobic001G485600 Sobic007G197400--Sobic001G485600 Sobic008G098600 Sobic008G098600 Sobic007G197400--Sobic008G098600 Sobic007G197400--Sobic006G180700 Sobic010G278600 Sobic010G278600 Sobic007G197400--Sobic010G278600 Sobic009G093400 Sobic009G093400 Sobic007G197400--Sobic009G093400 Sobic004G089500 Sobic004G089500 Sobic007G197400--Sobic004G089500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.