Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G278650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RPC7
Pfam PF03181
Panther DB PTHR31236 PTHR31236:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G25610 : BURP domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g38810.1 : BURP domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004992
Brachypodium KQJ98849
Barley HORVU7Hr1G048820.3 , HORVU7Hr1G048820.2 , HORVU7Hr1G048820.6 , HORVU7Hr1G048820.5 , HORVU7Hr1G048820.4 , HORVU7Hr1G048820.8
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G067501 - -
2 Sobic.004G289600 - -
3 Sobic.006G042200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./middle senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@MATE efflux family protein, putative, expressed K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
4 Sobic.003G088700 - -
5 Sobic.003G190300 - -
6 Sobic.006G028250 - -
7 Sobic.003G205801 - -
8 Sobic.004G135300 - -
9 Sobic.008G125600 - -
10 Sobic.003G159450 - -
11 Sobic.007G054100 stress-induced protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G112900 - -
13 Sobic.004G010101 - -
14 Sobic.010G143200 - -
15 Sobic.007G010000 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
16 Sobic.008G091671 - -
17 Sobic.008G065800 - -
18 Sobic.006G174975 - -
19 Sobic.003G061000 ribosomal protein L3, putative, expressed K02906: RP-L3, MRPL3, large subunit ribosomal protein L3
20 Sobic.001G267900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G278650 Sobic004G278650 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic004G278650--Sobic009G067501 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic004G278650--Sobic004G289600 Sobic006G042200 Sobic006G042200 Sobic004G278650--Sobic006G042200 Sobic003G088700 Sobic003G088700 Sobic004G278650--Sobic003G088700 Sobic003G190300 Sobic003G190300 Sobic004G278650--Sobic003G190300 Sobic006G028250 Sobic006G028250 Sobic004G278650--Sobic006G028250 Sobic003G205801 Sobic003G205801 Sobic004G278650--Sobic003G205801 Sobic004G135300 Sobic004G135300 Sobic004G278650--Sobic004G135300 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic004G278650--Sobic008G125600 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic009G067501--Sobic008G091671 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic009G067501--Sobic003G159450 Sobic009G067501--Sobic008G125600 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic009G067501--Sobic009G197200 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic009G067501--Sobic007G112900 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic009G067501--Sobic004G291800 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic009G067501--Sobic006G068400 Sobic009G067501--Sobic006G028250 Sobic009G067501--Sobic004G278650 Sobic008G065800 Sobic008G065800 Sobic004G289600--Sobic008G065800 Sobic004G289600--Sobic008G125600 Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic004G289600--Sobic001G022100 Sobic003G020600 Sobic003G020600 Sobic004G289600--Sobic003G020600 Sobic004G289600--Sobic006G068400 Sobic010G033700 Sobic010G033700 Sobic004G289600--Sobic010G033700 Sobic004G289600--Sobic009G067501 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic004G289600--Sobic008G106600 Sobic008G189400 Sobic008G189400 Sobic004G289600--Sobic008G189400 Sobic006G042200--Sobic004G135300 Sobic007G054100 Sobic007G054100 Sobic006G042200--Sobic007G054100 Sobic001G222250 Sobic001G222250 Sobic006G042200--Sobic001G222250 Sobic004G174900 Sobic004G174900 Sobic006G042200--Sobic004G174900 Sobic006G042200--Sobic008G125600 Sobic004G010101 Sobic004G010101 Sobic006G042200--Sobic004G010101 Sobic009G008100 Sobic009G008100 Sobic006G042200--Sobic009G008100 Sobic002G073900 Sobic002G073900 Sobic006G042200--Sobic002G073900 Sobic002G040800 Sobic002G040800 Sobic006G042200--Sobic002G040800 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic003G088700--Sobic010G056000 Sobic003G088700--Sobic003G205801 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic003G088700--Sobic001G111900 Sobic009G178800 Sobic009G178800 Sobic003G088700--Sobic009G178800 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic003G088700--Sobic003G084900 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic003G088700--Sobic009G127900 Sobic003G088700--Sobic008G125600 Sobic004G039700 Sobic004G039700 Sobic003G088700--Sobic004G039700 Sobic006G183800 Sobic006G183800 Sobic003G088700--Sobic006G183800 Sobic003G205501 Sobic003G205501 Sobic003G190300--Sobic003G205501 Sobic005G040900 Sobic005G040900 Sobic003G190300--Sobic005G040900 Sobic001G296500 Sobic001G296500 Sobic003G190300--Sobic001G296500 Sobic006G072900 Sobic006G072900 Sobic003G190300--Sobic006G072900 Sobic003G190300--Sobic003G205801 Sobic002G115500 Sobic002G115500 Sobic003G190300--Sobic002G115500 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic003G190300--Sobic004G045566 Sobic008G127400 Sobic008G127400 Sobic003G190300--Sobic008G127400 Sobic001G267900 Sobic001G267900 Sobic003G190300--Sobic001G267900 Sobic006G028250--Sobic001G296500 Sobic006G028250--Sobic008G125600 Sobic006G028250--Sobic008G091671 Sobic006G028250--Sobic010G056000 Sobic006G028250--Sobic009G067501 Sobic006G028250--Sobic006G068400 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic006G028250--Sobic010G139301 Sobic003G401000 Sobic003G401000 Sobic006G028250--Sobic003G401000 Sobic005G207100 Sobic005G207100 Sobic006G028250--Sobic005G207100 Sobic003G205801--Sobic003G084900 Sobic003G241200 Sobic003G241200 Sobic003G205801--Sobic003G241200 Sobic010G028800 Sobic010G028800 Sobic003G205801--Sobic010G028800 Sobic003G205801--Sobic003G088700 Sobic001G152320 Sobic001G152320 Sobic003G205801--Sobic001G152320 Sobic001G261496 Sobic001G261496 Sobic003G205801--Sobic001G261496 Sobic003G205801--Sobic010G056000 Sobic006G165000 Sobic006G165000 Sobic003G205801--Sobic006G165000 Sobic003G205801--Sobic009G178800 Sobic004G135300--Sobic003G084900 Sobic004G135300--Sobic001G222250 Sobic004G135300--Sobic006G042200 Sobic001G409600 Sobic001G409600 Sobic004G135300--Sobic001G409600 Sobic006G273200 Sobic006G273200 Sobic004G135300--Sobic006G273200 Sobic004G135300--Sobic003G088700 Sobic005G128400 Sobic005G128400 Sobic004G135300--Sobic005G128400 Sobic007G009400 Sobic007G009400 Sobic004G135300--Sobic007G009400 Sobic004G135300--Sobic001G267900 Sobic008G125501 Sobic008G125501 Sobic008G125600--Sobic008G125501 Sobic008G000900 Sobic008G000900 Sobic008G125600--Sobic008G000900 Sobic008G125600--Sobic003G159450 Sobic008G125600--Sobic001G111900 Sobic008G125600--Sobic003G088700 Sobic008G125600--Sobic007G112900 Sobic004G062800 Sobic004G062800 Sobic008G125600--Sobic004G062800 Sobic008G125600--Sobic010G056000 Sobic001G454401 Sobic001G454401 Sobic008G125600--Sobic001G454401
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.